下午花了两个小时回答读者的疑问，觉得可以记录下来，也许能帮到一部分人。

第一位读者做的是非模式物种的单细胞。

一开始以为是想问我非模式物种的marker基因在哪儿找，读者朋友也提到了blast

研究的主要细胞类型的marker是有的

让读者朋友困惑的是一张表，cluster乘样本的表，每一个值表示表达这个marker基因的细胞数目。这个表其实没有多少信息，且容易给人误导。应该直接从小提琴图看。

解答完了这个问题，另一个问题还是回到“非模式物种如何找marker”。找同源基因是一个思路，甚至都不用自己比对，这类信息网上数据库应该就有；再一个就是多看同一领域的文献，实验、bulk RNA-seq都做了那么多了，几个marker基因还是有的吧。

因水平有限，有错误的地方，欢迎批评指正！

答读者问(1)：非模式物种找marker；如何根据marker定义细胞类型的更多相关文章

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