Mac下安装rJava,xlsx,ReporteRs包
xlsx包可以用来读取excel数据,ReporteRs包可以用来直接输出word报告,这两个包都对rJava包有依赖,所以必须先安装rJava.
(1)查看mac的java信息
java版本:
> java –version
java路径:
>which java
java HOME:
>/usr/libexec/java_home
(2)添加环境变量
操作步骤:
1.打开Terminal
2.输入:vi ~/.bash_profile
3.设置PATH:
export JAVA_HOME="/usr/libexec/java_home -v 1.8"
export LD_LIBRARY_PATH=$JAVA_HOME/jre/lib/server
4.输入:wq 保存退出vi
5.修改立即生效:source ~/.bash_profile。
6.查看环境变量:echo $PATH
注意:
Mac配置环境变量的地方
1./etc/profile (建议不修改这个文件 )
全局(公有)配置,不管是哪个用户,登录时都会读取该文件。
2./etc/bashrc (一般在这个文件中添加系统级环境变量)
全局(公有)配置,bash shell执行时,不管是何种方式,都会读取此文件。
3.~/.bash_profile (一般在这个文件中添加用户级环境变量)
每个用户都可使用该文件输入专用于自己使用的shell信息,当用户登录时,该文件仅仅执行一次!
如果是新增环境变量或者是修改环境变量的值,都需要source一下才能立即生效。如果是删除一个环境变量,必须输入exit以logout当前shell,然后再重新打开一个新的shell并login才能生效。
(3)终端执行下面的语句:
>sudo R CMD javareconf
命令行打开R,安装rJava:
install.packages('rJava',type='source')
(4)建立链接(link)。让RStudio 能够通过 Finder/Spotlight去连接libjvm.dylib to /usr/local/lib:
sudo ln -f -s $(/usr/libexec/java_home)/jre/lib/server/libjvm.dylib /usr/local/lib
-f 参数是用来强制写入已经存在的链接(link)。
(5)如果通过以上步骤仍不能在R中安装ReporteRs,那么需要到oracle官网下载最新的JDK。然后重新运行sudo R CMD javareconf
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