R包经常会遇到各种版本不兼容的毛病,比如当前的版本相较于包,新了/旧了都是麻烦
而升级R软件呢,最麻烦的就是之前安装的包怎么办?
搜罗了以下几种方法:
 
方法1:
(1)直接安装新版本
(2)然后复制旧版本的library中的文件夹到新版本的library文件夹下,粘贴。
         如果中间跳出有重名的,就不覆盖(基础包是需要最新的)。
(3)打开新版的R,输入:
  1. update.packages()
默默等待更新即可
(不过我其实不建议这种方式,他会不断的跳出来,让你选择y/n/c 是/否/取消)
直接选择程序包——更新程序包,应该就可以了吧?
 
方法2
使用installr包
所以,还没开始,似乎结局已经注定
如果是这样,我不知道其意义何在呢?
不过呢,按照其他参考资料而言,应该还是很简便的
(参考资料的发布时间最在的在2014,晚一点的也在2015,看来这个包也是经过了不少改动啊)
 
 
方法3
在旧版本下的控制输入:
  1. olib <- installed.packages()[,"Package"]
  2.  
  3. save(olib, file="oldRpackages.txt",ascii=T)
也就是,在旧版本下,读入了所有已安装的扩展包
我将后缀名保存为txt,并设置ascii参数为T,是为了能打开,打开能识别编码。恩,最好使用editplus打开,不然直接用txt,格式看起来混乱。
上述语句要在卸载旧版本之前运行,然后,上述语句运行完,会在当前的工作空间(getwd()查看)文件下生成一个oldRpackages.txt文件
安装新的R,然后在新的R中输入:
  1. > load("oldRpackages")
  2. > chooseCRANmirror() #我先选择设置镜像,才出现此代码
  3. > tobeinstalled <- setdiff(olib, installed.packages()[,"Package"])
  4. > biocLite(tobeinstalled)
  5.  
  6. 错误:没有"biocLite"这个函数
 使用??biocLite,也是not fund
但事实上不是这样的,输入:(这是因为,他们所用的镜像,是生物信息自己的镜像,会加载包)
  1. load("oldRpackages")
  2. source("http://bioconductor.org/biocLite.R")
  3.  
    1. 试开URL’https://bioconductor.org/packages/3.3/bioc/bin/windows/contrib/3.3/BiocInstaller_1.22.1.zip'
    2. Content type 'application/zip' length 58128 bytes (56 KB)
    3. downloaded 56 KB
    4. The downloaded binary packages are in
    5. C:\Users\xuan\AppData\Local\Temp\Rtmp6dKreM\downloaded_packages
    6. Bioconductor version 3.3 (BiocInstaller
    7. 1.22.1), ?biocLite for help
     
  4.  
  5. tobeinstalled <- setdiff(olib, installed.packages()[,"Package"])
  6. biocLite(tobeinstalled)
  7.  
    1. BioC_mirror: https://bioconductor.org
    2. Using Bioconductor 3.3 (BiocInstaller 1.22.1), R 3.3.0
    3. (2016-05-03).
    4. Old packages: 'Rcpp', 'survival'
     
  8. Update all/some/none?[a/s/n]: a(自己输入选择)
报错了........
(作者还有其他关于R的作品,蛮有意思http://www.calyx.biz/r-tips--r2521624039
 
综上所述,我觉得,在方法2可用的情况下,可以使用2 ,否则,我还是更愿意使用方法1.
 
卸载,进入安装文件,找到unins000.exe
卸载完后,library文件夹还会残留下来,但是,此时残留的仅仅是扩展包,其他的核心基础包,都木有啦。
 
安装:
(我手贱,一开始自己选了Plain text,结果帮助文档是在一个控制台一样的窗口输出的,不方便啊,无法缩放,窗口切换也麻烦)
 
 

R的卸载和更新安装的更多相关文章

  1. android86 监听SD卡状态,勒索软件,监听应用的安装、卸载、更新,无序广播有序广播

    * 添加权限 <uses-permission android:name="android.permission.RECEIVE_SMS"/> * 4.0以后广播接收者 ...

  2. Android apk的安装、卸载、更新升级(通过Eclipse实现静默安装)

    一.通过Intent消息机制发送消息,调用系统应用进行,实现apk的安装/卸载 . (1) 调用系统的安装应用,让系统自动进行apk的安装 String fileName = "/data/ ...

  3. python 学习笔记_1 pip安装、卸载、更新包相关操作及数据类型学习

    '''prepare_1 pip安装.卸载.更新组件type 各数据类型''' py -3 -m pip py -3 -m pip listpy -3 -m pip show nosepy -3 -m ...

  4. Linux CentOS 6.5 卸载、tar安装MySQL

    卸载系统自带MySQL 1. 查看系统当前是否安装有MySQL rpm -qa|grep -i mysql 2. 卸载当前版本的MySQL yum remove mysql mysql-server ...

  5. ubuntu 上更新安装 openoffice.org3的过程

    方法一:手动安装1首先在“应用成程序--添加/删除”里卸载openoffice 2.4,可能openoffice.org 2.4 Draw因为关联而无法卸载,忽略,卸载其他几项.然后在中文官方网上下载 ...

  6. c#自动更新+安装程序的制作 (转)

    c#自动更新+安装程序的制作 (转)  http://blog.csdn.net/myhuli120/article/details/6927588 一.自动更新的实现 让客户端实现自动更新,通常做法 ...

  7. c#自动更新+安装程序的制作

    一.自动更新的实现 让客户端实现自动更新,通常做法是在客户端部署一个单独的自动更新程序.主程序启动后,访问服务端,检查配置文件是否有更新版本,有更新版本就启动更新程序,由更新负责下载更新版本,并更新客 ...

  8. deepin卸载mysql并安装设置mysql5.7

    mysql完全卸载以及安全安装 完全卸载 sudo apt purge mysql-* sudo rm -rf /etc/mysql/ /var/lib/mysql sudo apt autoremo ...

  9. sql sever和mysql 卸载及oracle安装

    sql sever和mysql的卸载及Oracle安装 目的:本人健忘,以后难免会重装系统啥的,软件卸了装是常有的事,特此写此详细教程,一是方便自己以后重装的时候可以看看:二是如果有某位初学者有幸光临 ...

随机推荐

  1. CentOS使用yum源中自带的rpm包安装LAMP环境

    CentOS使用yum源中自带的rpm包安装LAMP环境.这是Linux下安装LAMP的环境一种最基本最简便的方式.新手可以从容安装使用. 1. 安装基础包(可选安装)yum install -y w ...

  2. makefile之VPATH和vpath的使用

    来自阅读陈皓的<跟我一起写makefile> VPATH变量 在一些大的工程中,有大量的源文件,我们通常的做法是把这许多的源文件分类,并存放在不同的目录中.所以,当 make 需要去找寻文 ...

  3. android 学习中的一些问题记录 主要是概念问题

    一些问题记录 应用程序 res 目录常见的目录有哪些,分别放置什么类型的资源? animator/ 和anim/ 放的都是定义动画的XML文件,两个地方的动画类型不同. color/ XML文件:定义 ...

  4. MMORPG大型游戏设计与开发(服务器 游戏场景 聊天管道和寻路器)

    又快到双十一,又是不少同仁们出血的日子,首先希望大家玩的开心.我曾经想要仔细的剖析场景的的每个组件,就像这里的聊天管道与寻路器,但是仔细阅读别人代码的时候才发现元件虽小但是实现并不简单,因为有些东西还 ...

  5. 编码中的setCharacterEncoding 理解

    1.pageEncoding="UTF-8"的作用是设置JSP编译成Servlet时使用的编码.  2.contentType="text/html;charset=UT ...

  6. 基于ionic+cordova+angularJs从零开始搭建自己的移动端H5 APP

    这里详细介绍下如何用ionic+cordova+angularjs搭建自己的移动端app,包括环境搭建,框架使用等,具体项目已放置在github上,可下载下来自行启动. 下载地址:https://gi ...

  7. Rect 和 Bounds

    Rect 表示一个2D矩形区域 Bounds 表示一个3D的方块区域 http://www.cnblogs.com/crazylights/p/3977348.html

  8. [No00006B]方便的网络下载工具wget 可下载网站目录下的所有文件(可下载整个网站)

    wget是linux下命令行的下载工具,功能很强大,它能完成某些下载软件所不能做的,比如如果你想下载一个网页目录下的所有文件,如何做呢?网络用户有时候会遇到需要下载一批文件的情况,有时甚至需要把整个网 ...

  9. php-简单对称加密算法和字符串与十六进制之间的互转函数

    /** * 简单对称加密算法之加密 * @param String $string 需要加密的字串 * @param String $skey 加密EKY * @return String */fun ...

  10. intel和AMD CPU性能对比(2016年CPU天梯图)组装电脑必读!

    http://www.365pcbuy.com/article-411.html 特别提示:此文已经于2016年10月12日更新!内容变动较大,请细细品鉴! 如何为客户推荐高性价比机型是我站的重要工作 ...