使用pybind11为Python编写C++扩展(一)配置篇:Build(编译和链接)
最后决定选用pybind11,理由如下:
- 比python原生的C API看起来人性多了
- 我的C++代码不是现成的,需要一定的C++开发工作量,所以感觉cython不是很方便。如果C++接口已经给好了,只需要简单包装一下,Cython可能更好。
- pybind11声称只包含头文件,且能通过pip安装,感觉比boost_python轻量且最后这个扩展包容易分发。此外,感觉它的文档也比boost python友好不少……
Setuptools
这种方式适合python包的构建、打包、分发、上传到PyPi一条龙服务。python使用C++扩展需要在setup.py里配置好Extension。以下是一个setup.py的样例:
import glob
import os.path
from distutils.core import setup
__version__ = "0.0.1"
# make sure the working directory is BASE_DIR
BASE_DIR = os.path.dirname(__file__)
os.chdir(BASE_DIR)
ext_modules = []
try:
from pybind11.setup_helpers import Pybind11Extension, ParallelCompile, naive_recompile
# `N` is to set the bumer of threads
# `naive_recompile` makes it recompile only if the source file changes. It does not check header files!
ParallelCompile("NPY_NUM_BUILD_JOBS", needs_recompile=naive_recompile, default=4).install()
# could only be relative paths, otherwise the `build` command would fail if you use a MANIFEST.in to distribute your package
# only source files (.cpp, .c, .cc) are needed
source_files = glob.glob('source/path/*.cpp', recursive=True)
# If any libraries are used, e.g. libabc.so
include_dirs = ["INCLUDE_DIR"]
library_dirs = ["LINK_DIR"]
# (optional) if the library is not in the dir like `/usr/lib/`
# either to add its dir to `runtime_library_dirs` or to the env variable "LD_LIBRARY_PATH"
# MUST be absolute path
runtime_library_dirs = [os.path.abspath("LINK_DIR")]
libraries = ["abc"]
ext_modules = [
Pybind11Extension(
"package.this_package", # depends on the structure of your package
source_files,
# Example: passing in the version to the compiled code
define_macros=[('VERSION_INFO', __version__)],
include_dirs=include_dirs,
library_dirs=library_dirs,
runtime_library_dirs=runtime_library_dirs,
libraries=libraries,
cxx_std=14,
language='c++'
),
]
except ImportError:
pass
setup(
name='project_name', # used by `pip install`
version='0.0.1',
description='xxx',
ext_modules=ext_modules,
packages=['package'], # the directory would be installed to site-packages
setup_requires=["pybind11"],
install_requires=["pybind11"],
python_requires='>=3.8',
include_package_data=True,
zip_safe=False,
)
一些需要注意的点(坑):
如果需要通过sdist(即
.tar.gz的源码方式)发布包的话,Extension的source_files字段必须是相对路径。否则build的时候会因为egg-info里的SOURCE.txt里有绝对路径而报错。但由此带来的问题是我们不能确定跑setup.py的时候工作目录是啥,为了保险起见,需要把它设置成setup.py所在的目录。在安装包之前,为了获取一些metadata,setuptools会先跑一次
setup.py,这个时候如果没有装pybind11,会报错。为了解决这个问题:- 为了能正常执行到
setup函数,我们需要先保证没有pybind11的情况下执行这个文件也不会报错。所以我们需要把所有依赖pybind11.setup_helpers的部分都放到try里。也有其它的方法,比如直接复制一个setup_helpers啥的,具体可以看文档。
- 根据setuptools的文档,
setup_requires并不会安装包,所以pybind11也需要加到install_requires里。 - 最后,在安装本包前,setuptools会先安装依赖项,然后再跑
setup.py install,这时就可以成功build和安装了。
- 为了能正常执行到
如果你的外接库不在系统查找动态库的指定路径里,那么指定link_dirs之后,编译和链接不会出错。但执行的时候还是会因为找不到动态库而报错。可以通过添加
runtime_library_dirs(等价于-Wl,-rpath),或者给LD_LIBRARY_PATH环境变量里添加这个路径。编译后的
.so的位置,以及你的C++ module在python里的名字,取决于你给Extension写的名字。例如,你希望文件结构是这样:project_dir
|-- package
| |-- __init__.py
| |-- this_package.xxxx.so
| |-- other.py
|-- setup.py
这样你最后在
site-packages里只会新建一个包叫package。此外,哪怕你这个project只想导出一个
.so里的模块,把它放到一个文件夹里包装起来也会更好。因为如果你只想导出一个this_package,把setup函数里的配置改成了packages=['this_package'],这个.so文件会直接被加到site-packages,感觉不是很优雅。这时候你的
Extension的名字就需要是package.this_package。这样.so的位置就是对的,你运行import package.this_package就会正确地找到.so并执行了。
但是,要保证执行.so不出错,在C++里通过PYBIND11_MODULE把这个扩展expose到python里的时候,名字也要对应:PYBIND11_MODULE(_pynodejs, m) {}
CMake
参考官方的CMake构建文档。
如果是编译嵌入python的C++程序,可以用CMake,比较方便。
虽然python extension似乎也可以用CMake,但是还是setuptools比较方便。
我这里主要是用CMake编译C++部分的测试。CMakeLists.txt大概长这样:
# the CMakeList to test the C++ part from a C entry point
cmake_minimum_required(VERSION 3.21)
project(project_name)
set(CMAKE_CXX_STANDARD 14)
# Find pybind11
find_package(pybind11 REQUIRED)
# If any library (e.g. libabc.so) is needed
include_directories(INCLUDE_DIR)
link_directories(LINK_DIR)
# Add source file
file(GLOB A_NAME_FOR_SOURCE CONFIGURE_DEPENDS "source/path/*.cpp")
file(GLOB A_NAME_FOR_TEST CONFIGURE_DEPENDS "test/path/*.cpp")
add_executable(TARGET_NAME test_cpp_part.cpp ${A_NAME_FOR_SOURCE} ${A_NAME_FOR_TEST})
target_link_libraries(TARGET_NAME abc pybind11::embed)
project_name随便写TARGET_NAME随便写,只要add_executable和target_link_libraries对应就行,是最后的可执行文件的名字A_NAME_FOR_SOURCE和A_NAME_FOR_TEST是一个CMake的中间变量名,随便写,它们分别代表了GLOB找到的一堆源文件,和用于测试的一堆文件INCLUDE_DIR里是库abc的头文件,LINK_DIR里必须包含库文件,动态库类似libabc.so,静态库类似libabc.a。- Link到
pybind11::embed的原因是防止带python对象的那部分C++代码编译失败。
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