LncRNA
简介:长链非编码RNA(Long non-coding RNA, lncRNA)通过多种机制发挥其生物学功能, 这些机制包括基因印记、染色质重塑、细胞周期调控、剪接调控、mRNA降解和翻译调控等。lncRNA通过这些作用机制在不同水平进行基因表达调控。
长链非编码RNA(Long non-coding RNA, lncRNA)是长度大于200个核苷酸的非编码RNA[1]。研究表明, lncRNA在剂量补偿效应(Dosage compensation effect)、表观遗传调控、细胞周期调控和细胞分化调控等众多生命活动中发挥重要作用
根据lncRNA与蛋白质编码基因的位置关系, 可将它们分为重叠型、顺式反义型、双向型和内含子型等;而根据lncRNA的功能, 则可将其分为信号分子(Signal molecule)、诱饵分子(Decoy molecule)、引导分子(Guide molecule)和骨架分子(Scaffold molecule)等4类分子。
其中,lncRNAdb 是专门针对lncRNA的数据库。
网址:http://www.lncrnadb.org/
它收录了今年来文献报道的相关物种的lncRNA信息,包括lncRNA的名称,别名,特征,功能,参考文献等等。
其他的相关网站:
agilent_ncRNA
https://earray.chem.agilent.com/earray/
lncRNAdb
http://lncrnadb.com/
Gencode
http://www.gencodegenes.org/
H-invDB
http://h-invitational.jp/hinv/
NONCODE
http://noncode.org/NONCODERv3/guide.htm
RefSeq
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/projects/RefSeq/
Ultra-conserved
http://users.soe.ucsc.edu/~jill/ultra.html
UCSC_lincRNAsTranscripts
http://genome.ucsc.edu
LncRNA的更多相关文章
- Systematic LncRNA Classification
Systematic LncRNA Classification From: http://www.arraystar.com/Services/Services_main.asp?ID=307 An ...
- lncRNA研究
------------------------------- Long noncoding RNAs are rarely translated in two human cell lines. ( ...
- 长链非编码RNA(lncRNA)
长链非编码RNA(lncRNA) 转自:http://blog.sina.com.cn/s/blog_909da11301010bkz.html 长链非编码RNA(lncRNA)是一类转录本长 ...
- lncRNA表达定量方法评估
见文章:Benchmark of lncRNA Quantification for RNA-Seq of Cancer Samples Overall, 10-16% of lncRNAs can ...
- 七种常见的核酸序列蛋白编码能力预测工具 | ncRNAs | lncRNA
注:这些工具的应用都是受限的,有些本来就是只能用于预测动物,在使用之前务必用ground truth数据来测试一些.我想预测某一个植物的转录本,所以可以拿已经注释得比较好的拟南芥来测试一下.(测试的结 ...
- lncRNA芯片重注释
.caret,.dropup>.btn>.caret{border-top-color:#000!important}.label{border:1px solid #000}.table ...
- 关于lncRNA数据收集
最近需要自己收集数据库里的核酸序列,于是直接面对一些神文 http://www.360doc.com/content/17/0120/08/30227855_623625901.shtml http: ...
- Hairpin|Bulge|Loop|假结|共变化(进化)|单序列预测|snRNA|snoRNA|siRNA|microRNA|piRNA|LncRNA|antisense RNAs|cis-NATs|trans-NATs|假基因|环形RNA
生物信息学 GU也可以配对,即“wobble” pairing GU. Hairpin发夹结构,最少不能少于3个碱基.没有配对 Bulge 单侧配对 Loop双侧配对 假结,游离的leading ed ...
- SAGE|DNA微阵列|RNA-seq|lncRNA|scripture|tophat|cufflinks|NONCODE|MA|LOWESS|qualitile归一化|permutation test|SAM|FDR|The Bonferroni|Tukey's|BH|FWER|Holm's step-down|q-value|
生物信息学-基因表达分析 为了丰富中心法则,研究人员使用不断更新的技术研究lncRNA的方方面面,其中技术主要是生物学上的微阵列芯片技术和表达数据分析方法,方方面面是指lncRNA的位置特征. Bac ...
随机推荐
- python选择排序算法总结
选择排序算法: a=[6,5,4,3,2,1] 算法思路: 第一步:在列表的第一个位置存放此队列的最小值 声明一个变量min_index等于列表的第一个坐标值0 从第一个位置0坐标开始,和它后边所有的 ...
- 禁止火狐浏览器缓存input标签方法
禁止火狐浏览器缓存input标签方法 问题1:在火狐浏览器里,云平台的输入框.选项框.勾选框…填写之后按F5刷新页面,之前填的东西会保留着,其它浏览器不会火狐强制刷新用Ctrl + F5 浏览器自动保 ...
- css去掉a标签点击后的虚线框,outline,this.blur()
css去掉a标签点击后的虚线框,outline,this.blur() outline是css3的一个属性,用的很少.声明,这是个不能兼容的css属性,在ie6.ie7.遨游浏览器都不兼容. outl ...
- x86,x64,Any CPU区别
https://blog.csdn.net/zuguangboy/article/details/51509670 1,即主程序(编译出来是exe文件的)是x86平台下编译的,而它所依赖的一个项目(或 ...
- ACM题目————Face The Right Way
Description Farmer John has arranged his N (1 ≤ N ≤ 5,000) cows in a row and many of them are facing ...
- Confluence5.8更改数据库配置
Confluence5.8更改数据库配置 第一步:是找到confluence的安装目录,我的安装目录在 /opt/atlassian/: 第二步:由于confluence把tomcat给改造了,所以c ...
- java replaceAll之$替换
最近,在开发一个伪代码翻译工具的过程中,遇到个问题,我们在伪代码中使用spring EL的规则,将非变量限定在${"1"}中,解析后根据上下文的类型转换为相应的java类型.在规则 ...
- JavaScript 获取和修改 内联样式
JavaScript 获取和修改 内联样式 版权声明:未经授权,严禁转载分享! 元素的样式 HTML 元素的 style 属性返回一个 CSSStyleDeclaration 类型的对象. Style ...
- Class<T>
首先,什么是类类型? 可见: https://www.cnblogs.com/yanze/p/9717658.html Class<T>即T的类类型 如何获取Class<T>? ...
- 20145307陈俊达《网络对抗》Exp5 MSF基础应用
20145307陈俊达<网络对抗>Exp5 MSF基础应用 基础问题回答 用自己的话解释什么是exploit,payload,encode? exploit就相当于是载具,各式各样的漏洞在 ...