LncRNA
简介:长链非编码RNA(Long non-coding RNA, lncRNA)通过多种机制发挥其生物学功能, 这些机制包括基因印记、染色质重塑、细胞周期调控、剪接调控、mRNA降解和翻译调控等。lncRNA通过这些作用机制在不同水平进行基因表达调控。
长链非编码RNA(Long non-coding RNA, lncRNA)是长度大于200个核苷酸的非编码RNA[1]。研究表明, lncRNA在剂量补偿效应(Dosage compensation effect)、表观遗传调控、细胞周期调控和细胞分化调控等众多生命活动中发挥重要作用
根据lncRNA与蛋白质编码基因的位置关系, 可将它们分为重叠型、顺式反义型、双向型和内含子型等;而根据lncRNA的功能, 则可将其分为信号分子(Signal molecule)、诱饵分子(Decoy molecule)、引导分子(Guide molecule)和骨架分子(Scaffold molecule)等4类分子。
其中,lncRNAdb 是专门针对lncRNA的数据库。
网址:http://www.lncrnadb.org/
它收录了今年来文献报道的相关物种的lncRNA信息,包括lncRNA的名称,别名,特征,功能,参考文献等等。
其他的相关网站:
agilent_ncRNA
https://earray.chem.agilent.com/earray/
lncRNAdb
http://lncrnadb.com/
Gencode
http://www.gencodegenes.org/
H-invDB
http://h-invitational.jp/hinv/
NONCODE
http://noncode.org/NONCODERv3/guide.htm
RefSeq
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/projects/RefSeq/
Ultra-conserved
http://users.soe.ucsc.edu/~jill/ultra.html
UCSC_lincRNAsTranscripts
http://genome.ucsc.edu
LncRNA的更多相关文章
- Systematic LncRNA Classification
Systematic LncRNA Classification From: http://www.arraystar.com/Services/Services_main.asp?ID=307 An ...
- lncRNA研究
------------------------------- Long noncoding RNAs are rarely translated in two human cell lines. ( ...
- 长链非编码RNA(lncRNA)
长链非编码RNA(lncRNA) 转自:http://blog.sina.com.cn/s/blog_909da11301010bkz.html 长链非编码RNA(lncRNA)是一类转录本长 ...
- lncRNA表达定量方法评估
见文章:Benchmark of lncRNA Quantification for RNA-Seq of Cancer Samples Overall, 10-16% of lncRNAs can ...
- 七种常见的核酸序列蛋白编码能力预测工具 | ncRNAs | lncRNA
注:这些工具的应用都是受限的,有些本来就是只能用于预测动物,在使用之前务必用ground truth数据来测试一些.我想预测某一个植物的转录本,所以可以拿已经注释得比较好的拟南芥来测试一下.(测试的结 ...
- lncRNA芯片重注释
.caret,.dropup>.btn>.caret{border-top-color:#000!important}.label{border:1px solid #000}.table ...
- 关于lncRNA数据收集
最近需要自己收集数据库里的核酸序列,于是直接面对一些神文 http://www.360doc.com/content/17/0120/08/30227855_623625901.shtml http: ...
- Hairpin|Bulge|Loop|假结|共变化(进化)|单序列预测|snRNA|snoRNA|siRNA|microRNA|piRNA|LncRNA|antisense RNAs|cis-NATs|trans-NATs|假基因|环形RNA
生物信息学 GU也可以配对,即“wobble” pairing GU. Hairpin发夹结构,最少不能少于3个碱基.没有配对 Bulge 单侧配对 Loop双侧配对 假结,游离的leading ed ...
- SAGE|DNA微阵列|RNA-seq|lncRNA|scripture|tophat|cufflinks|NONCODE|MA|LOWESS|qualitile归一化|permutation test|SAM|FDR|The Bonferroni|Tukey's|BH|FWER|Holm's step-down|q-value|
生物信息学-基因表达分析 为了丰富中心法则,研究人员使用不断更新的技术研究lncRNA的方方面面,其中技术主要是生物学上的微阵列芯片技术和表达数据分析方法,方方面面是指lncRNA的位置特征. Bac ...
随机推荐
- 结合ajax 的表单验证
浪费了我两天的时间 我也是醉了 html 结构 <!-- 密码修改 --> <div class="modal fade" id="operatePa ...
- FastJson(阿里巴巴)基础
一.所需jar包: fastjson-x.x.xx.jar(本例使用fastjson-1.1.36.jar). 二.解析转化: 1.json字符串 < ------ > js trin ...
- linux常用命令:which 命令
我们经常在linux要查找某个文件,但不知道放在哪里了,可以使用下面的一些命令来搜索: which 查看可执行文件的位置. whereis 查看文件的位置. locate 配合数据库查看文件位置 ...
- linux服务器---代理认证
代理认证 proxy代理服务被广泛的使用,为了安全起见,可以在服务器上增加一层安全认证机制.这里使用htpasswd建立认证账号和密码 1.创建认证账号和密码 [root@localhost wj]# ...
- Ubuntu系统下在github中新增库的方法
上一篇介绍了Ubuntu16.04系统下安装git的方法.本博客介绍怎么在github上怎么新建库. 如图 root@ranxf:/home/ranxf/learnGit/ranran_jiekou# ...
- 如何使用Unity制作虚拟导览(一)
https://www.cnblogs.com/yangyisen/p/5108289.html Unity用来制作游戏已经是目前市场上的一个发展趋势,而且有越来越多的公司与开发者不断的加入,那么Un ...
- ELK学习笔记之Logstash和Filebeat解析对java异常堆栈下多行日志配置支持
0x00 概述 logstash官方最新文档.假设有几十台服务器,每台服务器要监控系统日志syslog.tomcat日志.nginx日志.mysql日志等等,监控OOM.内存低下进程被kill.ngi ...
- Python之os.path路径模块中的操作方法总结
#os.path模块主要集成了针对路径文件夹的操作功能,这里我们就来看一下Python中的os.path路径模块中的操作方法总结,需要的朋友可以参考下 解析路径路径解析依赖与os中定义的一些变量: o ...
- 高可用Mysql架构_Mysql主从复制、Mysql双主热备、Mysql双主双从、Mysql读写分离(Mycat中间件)、Mysql分库分表架构(Mycat中间件)的演变
[Mysql主从复制]解决的问题数据分布:比如一共150台机器,分别往电信.网通.移动各放50台,这样无论在哪个网络访问都很快.其次按照地域,比如国内国外,北方南方,这样地域性访问解决了.负载均衡:M ...
- JS四舍五入保留两位小数
//四舍五入保留2位小数(若第二位小数为0,则保留一位小数) function keepTwoDecimal(num) { var result = parseFloat(num); if (isNa ...