I.4 Where the rare alleles are found

p是基因A的频率，N是个体数目（也就是基因型个数，所以基因个数是2n，所以全部个体的基因A的个数是2np），p方是PAA，np2是：基因型是AA的个体数目，所以所有基因型是AA的个体的基因A的个数是2pn2；得到：

该比值是全部A基因中处于AA纯合基因型中的含量，为p（通常该值极小），处于杂合中为1-p。

所以：

因为基因频率小的基因被称作罕见基因，也就是p很小，就是说该基因在纯合基因型中的概率极小。而常见基因的基因频率大，就是说在纯合基因型中的概率大。

rare alleles的更多相关文章

  1. haploview出现“more than two alleles”的解决方法

    弹出“more than two alleles”的错误是因为ped文件中一个SNP位点上存在两个以上的等位基因,haploview连锁分析时默认为只有两个等位基因,因此我们要去掉超过两位等位基因的S ...

  2. Multiple alleles|an intuitive argument|

    I.5 Multiple alleles. 由两个等位基因拓展到多个等位基因,可以得到更多种二倍体基因型: 所以单个等位基因的概率(用i代指某个基因,pi*是该基因的频率)是(以计数的方法表示) 所以 ...

  3. UVa 10633 - Rare Easy Problem

    题目:给定一个数N.去掉末尾的数变成M.如今已知N-M,确定N. 分析:数论.简单题. 设N = 10*a + b { 当中0 ≤ b ≤ 9 }.则M = a: N - M = N - a = 9* ...

  4. 15 Independent Alleles

    Problem Figure 2. The probability of each outcome for the sum of the values on two rolled dice (blac ...

  5. Rare But Powerful Vim Commands.

    @1: We all know about :wq, but we usually ignore :x. :x和:wq都是保存当前文件并退出. 这两个命令实际上并不完全等价,当文件被修改时两个命令时相 ...

  6. GATK-BWA-MEM handle GRCh38 alternate contig mappings

    1. For the Impatient # Download bwakit (or from <http://sourceforge.net/projects/bio-bwa/files/bw ...

  7. ctDNA 相关网站-liquid-biopsy

    http://www.gene-quantification.de/liquid-biopsy.html Liquid Biopsy -- Definitions Liquid Biopsy -- r ...

  8. 关于 minor allele frequency（次等位基因频率）的理解

    引用自NCBI的概念(https://www.ncbi.nlm.nih.gov/projects/SNP/docs/rs_attributes.html#gmaf) Global minor alle ...

  9. GWAS | 全基因组关联分析 | Linkage disequilibrium (LD)连锁不平衡 | 曼哈顿图 Manhattan_plot | QQ_plot | haplotype phasing

    现在GWAS已经属于比较古老的技术了,主要是碰到严重的瓶颈了,单纯的snp与表现的关联已经不够,需要具体的生物学解释,这些snp是如何具体导致疾病的发生的. 而且,大多数病找到的都不是个别显著的snp ...

随机推荐

  1. <老古董>1962年的线性支持向量机解法

    我们说“训练”支持向量机模型,其实就是确定"最大间隔超平面". 用数学语言来说就是确定一个最优的W.好比训练一个逻辑回归模型的目的是确定最优的W和b. 输入 X,为一个n维向量 输 ...

  2. 剑指offer_1.19_Day_3

    替换空格 请实现一个函数,将一个字符串中的每个空格替换成“%20”.例如,当字符串为We Are Happy.则经过替换之后的字符串为We%20Are%20Happy. Javascript_V8 f ...

  3. 【分类问题中模型的性能度量(一)】错误率、精度、查准率、查全率、F1详细讲解

    文章目录 1.错误率与精度 2.查准率.查全率与F1 2.1 查准率.查全率 2.2 P-R曲线(P.R到F1的思维过渡) 2.3 F1度量 2.4 扩展 性能度量是用来衡量模型泛化能力的评价标准,错 ...

  4. Android进阶——Android消息机制之Looper、Handler、MessageQueen

    Android消息机制可以说是我们Android工程师面试题中的必考题,弄懂它的原理是我们避不开的任务,所以长痛不如短痛,花点时间干掉他,废话不多说,开车啦 在安卓开发中,常常会遇到获取数据后更新UI ...

  5. 工程日记之HelloSlide(3)：如何使用Core Data数据库，以及和sqlite之间的对应关系

    Core Data 和 SQLite 是什么关系 core data是对sqlite的封装,因为sqlite是c语言的api,然而有人也需要obj-c的api,所以有了core data ,另外,co ...

  6. Java 使用控制台操作实现数据库的增删改查

    使用控制台进行数据库增删改查操作,首先创建一个Java Bean类,实现基础数据的构造,Get,Set方法的实现,减少代码重复性. 基本属性为 学生学号 Id, 学生姓名 Name,学生性别 Sex, ...

  7. Vue-router（5）之 路由的before家族

    beforeEach方法 import Vue from 'vue' import Router from 'vue-router' import Son1 from '@/view/New/son1 ...

  8. 使用classList和dataset实现tab切换

    显示效果: 代码实现: <!DOCTYPE html> <html lang="en"> <head> <meta charset=&qu ...

  9. Jenkins 插件中心国内镜像源发布

    以下文章来源于Jenkins,作者LinuxSuRen Jenkins 社区的网络基础设施都是架设在国外的服务器上,而且,并没有在国内有 CDN 或者负载均衡的配置.对所有的 Jenkins 用户而言 ...

  10. Java学习——代理模式

    Java中的三种代理模式 一,什么是代理模式? 代理模式是一种设计模式,简单的来说就是在不改变源码的情况下,实现对目标对象的功能扩展. 比如有个歌手对象叫Singer,这个对象有一个唱歌方法叫sing ...