数据格式如下

这里选择fold值最大的前20个作图进行展示

代码如下


import seaborn as sns
import pandas as pd
import numpy as np
import matplotlib.pyplot as plt infpkm="gene_diff2019102206.xls"
genename="Aoc1"
picpathname="Aoc1.test" df = pd.read_csv(infpkm,header=0,sep="\t") #根据绝对值大小从大到小进行排序
df = df.reindex(df['log2FoldChange'].abs().sort_values(ascending=False).index) #取前20行
df = df.iloc[:20,:] #获取最大的fold绝对值作为x轴的上下限
txlim = np.abs(df.loc[:,'log2FoldChange'].tolist()[0]) #获取作图的两列
pre_draw=df[['Datebase_type','log2FoldChange']]
#选择绝对值大于0.58496的数据
pre_draw = pre_draw[np.abs(pre_draw['log2FoldChange'])>0.58496] #将所有绝对值大于3的整数设置3,绝对值大于3的负数,设置为-3
#df[np.abs(df)>3] = np.sign(df)*3 logfold = [float(n) for n in pre_draw['log2FoldChange'].tolist()]
ngroup = [str(n) for n in pre_draw['Datebase_type'].tolist()]
ax = sns.barplot(x=logfold, y=ngroup, color='blue', orient='h') ax.set_title('20 Top FoldChange of Gene '+str(genename)+' expression in different dataset', fontsize=15)
ax.set_ylabel('Datebase name', fontsize=15)
ax.set_xlabel('Log2(Fold change)', fontsize=15)
ax.set_xlim([-txlim-0.25, txlim+0.25])
plt.savefig(picpathname+'.png', format='png', dpi=50, bbox_inches='tight')
plt.savefig(picpathname+'.pdf', format='pdf', dpi=100, bbox_inches='tight')

图片效果如下:

seaborn做横向条形图的更多相关文章

  1. [转载] ul li css 做横向菜单

    原文地址: http://www.cnblogs.com/amylis_chen/archive/2011/09/24/2188398.html 第一步:建立一个无序列表 我们先建立一个无序列表,来建 ...

  2. 使用CollectionView做横向滑动分页效果:

    一开始几页滑动是没有问题的,等滑到三四个页面之后,就出现奇怪的缝隙,一开始死活找不到原因,最后在layout的代理方法minimumLineSpacingForSectionAtIndex返回值设置为 ...

  3. LinearLayout遇到的问题——利用LinearLayout做横向滑动冲突

    问题:当我添加两个TextView的时候,然后滑动,发现只生成了一个TextView. 就是 <?xml version="1.0" encoding="utf-8 ...

  4. 用ul、li做横向导航

    /* ul li以横排显示 */ /* 所有class为menu的div中的ul样式 */ div.menu ul { list-style:none; /* 去掉ul前面的符号 */ margin: ...

  5. ul li做横向导航栏例子

    /* ul li以横排显示 */ /* 所有class为menu的div中的ul样式 */ div.menu ul { list-style:none; /* 去掉ul前面的符号 */ margin: ...

  6. SignalR学习笔记(五) 横向扩展之SQL Server

    当一个Web应用程序达到一台服务器能力限制,即请求处理数量限制之后,有2种解决方案:纵向扩展和横向扩展. 纵向扩展即用更强的服务器(或虚拟机),或为当前的服务器添加更多的内存,CPU等 横向扩展即添加 ...

  7. 3.matplotlib绘制条形图

    plt.bar() # coding=utf-8 from matplotlib import pyplot as plt from matplotlib import font_manager my ...

  8. matplotlib系列——条形图

    import matplotlib.pyplot as plt import numpy as np import matplotlib x = ["战狼2","激情8& ...

  9. 5行Python代码就能实现刷爆全网的动态条形图!

    说起动态图表,最火的莫过于动态条形图了. 在B站上搜索「数据可视化」这个关键词,可以看到很多与动态条形图相关的视频. 好多视频都达到了上百万的播放量,属实厉害. 目前网上实现动态条形图现成的工具也很多 ...

随机推荐

  1. reshape()函数

    """ 1.当原始数组A[4,6]为二维数组,代表4行6列. A.reshape(-1,8):表示将数组转换成8列的数组,具体多少行我们不知道,所以参数设为-1.用我们的 ...

  2. Python的可变类型和不可变类型?

    Python的每个对象都分为可变和不可变可变:列表.字典   不可变:数字.字符串.元组

  3. LeetCode 935. Knight Dialer

    原题链接在这里:https://leetcode.com/problems/knight-dialer/ 题目: A chess knight can move as indicated in the ...

  4. file 的类型 input

    上传你选择的文件和相关信息.在 HTML 文档中 <input type="file"> 标签每出现一次,一个 FileUpload 对象就会被创建.该元素包含一个文本 ...

  5. jaeger使用yugabyte作为后端存储的尝试以及几个问题

    前边写过使用scylladb 做为jaeger 的后端存储,还是一个不错选择的包括性能以及 兼容性,对于 yugabyte 当前存在兼容性的问题,需要版本的支持,或者尝试进行一些变动 create 语 ...

  6. redis 设置为只读模式

    数据库的只读模式,对于在系统出现重大故障,但是又不影响用户的查询操作还是很重要的 对于redis 设置只读模式需要分不同的场景 master-slave cluster single master-s ...

  7. 原创:协同过滤之spark FP-Growth树应用示例

    上一篇博客中,详细介绍了UserCF和ItemCF,ItemCF,就是通过用户的历史兴趣,把两个物品关联起来,这两个物品,可以有很高的相似度,也可以没有联系,比如经典的沃尔玛的啤酒尿布案例.通过Ite ...

  8. python 获取 一个正整数的二进制

    #coding=utf- def getbin(a): out = "" # 辗转相除法 ): div = a mod = a % out += str(mod) ): break ...

  9. 【POJ1321】棋盘问题

    本题传动门 本题知识点:深度优先搜索 + 枚举 + 回溯 题意是要求我们把棋子放在棋盘的'#'上,但不能把两枚棋子放在同一列或者同一行上,问摆好这k枚棋子有多少种情况. 我们可以一行一行地找,当在某一 ...

  10. D3.js的v5版本入门教程(第四章)—— 理解Update、Enter、Exit

    D3.js的v5版本入门教程(第四章) Update.Enter.Exit是D3.js中很重要的概念,下面来讲一下它们到底是什么?(当你看完后.你就会知道如果数据集个数和选择集个数不匹配的情况下使用d ...