Gamit的安装

--2017-1-6修正

我这里用的是Gamit10.5，系统是Ubunt 14。

1：获取root权限（仅针对装好Ubunt后没有修改过root密码的用户，如果修改过密码，但是忘掉了，则请进入单用户模式进行修改）：打开命令行:ctrl+alt+t

输入sudo passwd 然后输入两次密码，这个就是修改好的root密码（再输入密码是屏幕不会有任何反应，所以不要以为键盘坏了或者系统有问题）。

然后在输入su root，紧接着输入修改好的root密码就获取root权限了。

2：Gamit安装需要csh（tcsh）环境、 GNU gfortran 4.2编译器和libx11－dev库支持。gfortran是软件推荐使用的编译器。libx11-dev是X11的程序开发库，它提供的lib.h和 libx11.a（libx11.so）是Gamit安装必须用到的两个库文件，主要是为Globk的提供图形库支持。以上三个条件却一不可（csh并不是b必须的，可以用bash  shell的，我感觉用bash shell 后面可能会简单点还）。

ubuntu系统没有csh，默认为bash。因此要先安装csh（可以不用chs，但是要有这个解释器）

ubuntu系统自带了gcc4.2，但是却没有安装gfortran编译器。

下面开始安装这些组件：

因为有的人是刚装完系统，所以下面有些组件在输入命令后，系统会提示找不到安装包，所以这里我们先更新一下系统软件列表

以root身份登录（按ctrl+alt+t，打开终端，如果是第一次刚装的系统，需要输入sudo passwd root，然后会提示让你输入当前用户密码，然后按照提示来

，就可以设置好root密码了，如果是已经设置好的，那么直接在终端中输入 su root，然后输入root密码，就切换到root了。）。

打开终端，输入

apt-get update （这一步是为了让你到系统更新一下它的软件列表，否则很有可能后面会发生找不到软件的情况。）

等更新完成后，接着输入：

apt-get install csh

系统自动下载并安装csh

======================接下来这些是切换csh，可以不切换的（个人建议跳过这一步）============================

安装完成后在终端输入

chsh

提示：正在更改 root 的 SHELL

输入当前用户密码后，开始登录 Shell [/bin/bash]:

紧接着输入命令：

/bin/csh

修改bash为csh。重新起动ubuntu，并以root身份登录，打开终端，输入

echo $SHELL

返回s“/bin/csh”,或者说返回的内容中包含chs，则说明SHELL修改成功

===============================ＥＮＤ=================================

接着输入

apt-get install gfortran

系统自动下载并安装gfortran。

再输入

apt-get install libx11-dev

系统自动下载并安装libx11-dev库。

3：首先右键将gamit10.5提取到当前文件夹下，然后将gamit10.5复制到/opt文件下，在root权限下用命令：

cp  –r  /home/wanghui(这里是你的用户名)/桌面/10.5  /opt

4：进入文件10.5 :   cd  /opt/10.5给install_software赋执行权限，输入命令：

chmod  777 ./install_software  （7就是可读可写可执行，三个7就是你，你的小组，外人都是这个权限）

5:运行安装脚本，输入命令：

./ install_software

这时会提示你输入y/n继续，按y继续，然后会安装，接着会再次提示你输入y/n，（10.6中会提示是否将更新应用到……，这时候按y就行）他是问你目录配置是否正确，这里先不要急着输入，首先看终端中的x11libpath和x11incpath后面有没有显示具体路径，如果有，就不要动，如果没有，就按下n，这时他会再次搜索，当完成后，终端上x11libpath和x11incpath应该就有路径了

(===注：如果这里仍然没有提示路径，就请回到第2步，在安装一下x11lib库

====如果实在找不到，就用这个：x11libPath:/usr/lib/x86_64-linux-gnu

x11incpath:/usr/include)，

这时候他会再次提示你输入y/n。这时不要动，把x11libpath和x11incpath后面的路径拷贝下来存起来，马上就用的到。现在我们来改一点东西：

再按ctrl+alt+t，新开一个终端，输入命令：

cd  /opt/gamit10.6/libraries

进入到这个目录中，输入命令：

sudo gedit Makefile.config  （也可以用sudo  vim Makefile.config，输入M后按Tab键会自动补全文件名的）

然后就会弹出一个文件编辑器，类似于windows下的记事本，我们需要修改一下三个地方：

第一点，如下图所示：

（我又用vim打开了一次，同时这也是修改好的，每个人到路径都不一定一样到。）

看到#generric……那一行没，记住是改那一行下面的，改其他的无效，改好以后保存一下。

第二点，需要修改gamit的内部参数了，在这里我们只需要将MAXATM改为25即可（也可以不改，以后用到再改，MAXATM就是最大测站数）。如图:

第三点也是最后一点就是修改操作系统的版本号。这个时候，在按一下ctrl+alt+t，新开一个终端，输入命令：

uname -a

可以查看到系统的版本号，如图：

这个图中，操作系统版本号4.4.0-45，我们只取前四位即4405，记住它。把文件往下拉，就能看到OS dependeent blocks字样，一直往下拉，找到for linux from 0.01 to 3.0.0字样，然后我们修改OS_ID Linux 0001 3001，中的3001字样，记住只修改它，把它替换为4005，然后保存关掉。

这里如果不修改，会立刻报错：

第四个（一般都是64位），如果你的电脑是32位的，那么就要将该文件中的全部m64改为m32，另外 /opt/10.6/gamit/solve/Makefile.generic该文件中的所有m64也要改为m32。

6：在返回到Linux的那个安装gamit终端中，按y继续安装，中间会让你等很长时间，最后它会问你是否创建gg的链接文件，实际就是windows下的快捷方式，按y确定。

装好后，它会提示你不要忘记设置环境变量，如图：

（Don't forget to set your : path to include /opt/gamit10.5/gamit/bin and /opt/gamit10.5/kf/bin
                         : HELP_DIR environment variable in you shell profile
                           (in .cshrc/.tcshrc add: setenv HELP_DIR /opt/gamit10.5/help/)
                         : INSTITUTE evnironment variable in your shell profile
                           (in your .cshrc/.tcshrc add: setenv INSTITUTE where_i_work)
                           where_i_work is a 3 character identifier for your solutions
）

====================环境变量需要配置好，如果配置不好，跟你没安装差不多一个效果＝＝＝＝＝＝＝＝＝＝＝＝＝＝＝＝

====================如果你用的是ｂｓｈ，就跳过第７步================================

7：配置gamit的命令路径，这一步也很重要，如果没配置好，上面的就都白做了。如果使用csh安装gamit的，则需要在主文件目录下，首先按一下ctrl+h，显示隐藏文件。然后新建一个空白文档，并重命名为.cshrc(带.表示是隐藏文件)（==因为你刚装到csh shell，还没有这个文件），双击那个新建的cshrc文件，复制下面的内容到该文件中：

# /etc/csh.cshrc: system-wide .cshrc file for csh(1) and tcsh(1)
# set prompt
#set prompt = "[`echo $USER@$cwd`]% "
set history = 50
#set system path
#set path = (. /bin /sbin /etc /usr/bin /usr/sbin /usr/bin/X11 /usr/X11R6/bin)
set path = (. /bin /sbin /etc /usr/bin /usr/sbin)
set path = (/usr/local/bin /usr/local/sbin /usr/local/lib /usr/lib $path)
setenv PATH "/usr/sbin:/sbin:${PATH}"
#setenv MANPATH  /usr/local/man:/usr/X11R6/man
setenv LIBPATH  /usr/lib:/usr/local/lib
#set Gamit/Globk path
set gamitpath = /opt/gg
set path = ($gamitpath/gamit/bin $gamitpath/kf/bin $gamitpath/com $path)
setenv HELP_DIR $gamitpath/help/
setenv _POSIX2_VERSION 199209
#set GMT path
#set gmtpath = /usr/lib/gmt
#set path = ($gmtpath/bin $gmtpath/include $gmtpath/lib $gmtpath/man $gmtpath/share $gmtpath/www $path)
#set path = (/etc/gmt /usr/include/gmt /usr/lib/gmt /usr/share/gmt /usr/share/doc/gmt $path)
#setenv MANPATH  "$gmtpath/man:$MANPATH"
#set full domain for GAMIT shell-scripts used to transfer data (sh_get_nav, sh_get_rinex, #sh_get_orbits, and
#  sh_get_hfiles)
set host = `\hostname | \awk -F. '{print $1}'`
set dom  = `\hostname | \awk -F. '{print $2}'`
if( $dom == '' ) then
   alias hostname 'echo $host.mit.edu'
endif

# set alias
# alias cd  'cd \!*; set prompt= '[`echo $USER@$cwd`]%''
alias pwd 'echo $cwd'

alias ls  'ls --classify'
alias ll  'ls -l'
alias la  'ls -a'
alias rm  'rm -i'
alias mv  'mv -i'
alias cls 'clear'

然后先不要关闭文件，先把set gamitpath=/opt/gamit10.6改成你自己的安装目录，然后保存。回到终端，输入命令：

source ~/.cshrc

然后输入命令：

echo $PATH

如果终端显示的path路径中有gamit路径，那么就表示成功。然后新开一个终端，输入命令：

doy

若显示command not found则表示安装失败，如果显示一大堆信息，则表示安装成功。

8：以上为csh的路径配置，这里说下bash的路径配置，如果有的同学用的默认bash安装的gamit则 需要在终端中输入

sudo gedit ~/.bashrc  或者sudo gedit /etc/profile  (可以用vim，不过建议不要修改profile，修改bashrc就足够了)

这时候会弹出一个文件编辑框，然后在文件末尾输入：

export PATH=$PATH:/opt/gamit10.5/gamit/bin:/opt/gamit10.5/com:/opt/gamit10.5/kf/bin:/opt/gamit10.5/lib  (中间就是 冒号 分割)

export HELP_DIR=/opt/gamit10.5/help/

然后保存即可。

还有最后一步就是改一下root到环境变量，要把你在root下用不了gamit的。

输入命令 sudo vim /root/.bashrc

翻到最后面，按i，进入插入模式，然后粘贴：

export PATH=$PATH:/opt/gamit10.5/gamit/bin:/opt/gamit10.5/com:/opt/gamit10.5/kf/bin:/opt/gamit10.5/lib  (中间就是 冒号 分割)

export HELP_DIR=/opt/gamit10.5/help/

最后 按esc 进入命令模式，然后输入：wq

重启一下，就装好啦。

9：如果中间安装失败，直接把安装目录删掉重新安装即可。

10：建议所有的操作均在root用户下进行，注意命令参数之间的空格

==================如果有问题欢迎联系我：wzxwhd@126.com