sparse matrix是用来存储大型稀疏矩阵用得,单细胞表达数据基本都用这个格式来存储,因为单细胞很大部分都是0,用普通文本矩阵存储太占空间。

使用也是相当简单:

library("Matrix")
readsCount <- read.csv("data/count.csv", header = T, row.names = 1)
readsCountSM <- as(as.matrix(readsCount), "dgCMatrix")
# str(M1)

  

想转回去,as.matrix() 就可以了。

参考:

Coercion of matrix tosparsematrix (dgCMatrix) and maintainingdimnames.

用R的dgCMatrix包来构建稀疏矩阵 | sparse matrix by dgCMatrix的更多相关文章

  1. R语言 ggplot2包

    R语言  ggplot2包的学习   分析数据要做的第一件事情,就是观察它.对于每个变量,哪些值是最常见的?值域是大是小?是否有异常观测? ggplot2图形之基本语法: ggplot2的核心理念是将 ...

  2. R语言rvest包网络爬虫

    R语言网络爬虫初学者指南(使用rvest包) 钱亦欣 发表于 今年 06-04 14:50   5228 阅读   作者 SAURAV KAUSHIK 译者 钱亦欣 引言 网上的数据和信息无穷无尽,如 ...

  3. R语言-神经网络包RSNNS

    code{white-space: pre;} pre:not([class]) { background-color: white; }if (window.hljs && docu ...

  4. R语言-Knitr包的详细使用说明

    R语言-Knitr包的详细使用说明 by 扬眉剑 来自数盟[总舵] 群:321311420 1.相关资料 1:自动化报告-谢益辉 https://github.com/yihui/r-ninja/bl ...

  5. ASP.NET Core的身份认证框架IdentityServer4(5)- 包和构建

    包和构建 IdentityServer有许多nuget包 IdentityServer4 nuget | github 包含IdentityServer核心对象模型,服务和中间件. 仅支持内存配置和用 ...

  6. R语言dplyr包初探

    昨天学了一下R语言dplyr包,处理数据框还是很好用的.记录一下免得我忘记了... 先写一篇入门的,以后有空再写一篇详细的用法. #dplyr learning library(dplyr) #fil ...

  7. R+NLP︱text2vec包——四类文本挖掘相似性指标 RWMD、cosine、Jaccard 、Euclidean (三,相似距离)

    要学的东西太多,无笔记不能学~~ 欢迎关注公众号,一起分享学习笔记,记录每一颗"贝壳"~ --------------------------- 在之前的开篇提到了text2vec ...

  8. IdentityServer4(5)- 包和构建

    包和构建 IdentityServer有许多Nuget包组件 IdentityServer4 nuget | github 包含IdentityServer核心对象模型.服务和中间件.默认只包含了基于 ...

  9. R语言扩展包dplyr——数据清洗和整理

    R语言扩展包dplyr——数据清洗和整理 标签: 数据R语言数据清洗数据整理 2015-01-22 18:04 7357人阅读 评论(0) 收藏 举报  分类: R Programming(11)  ...

随机推荐

  1. (6CBIR模拟问题)自己动手,编写神经网络程序,解决Mnist问题,并网络化部署

    个方面: 最初的图像检索研究主要集中在如何选择合适的全局特征去描述图像内容和采用什么样的相似性度量方法进行图像匹配. 第二个研究热点是基于区域的图像检索方法,其主要思想是图像分割技术提取出图像中的物体 ...

  2. centos6.9 svn提交更新到网站根目录

    一.首先创建网站根目录 ~] # mkdir -pv /export/home/cms/www_dyrs ~] # svn co svn://127.0.0.1/svn1 /export/home/c ...

  3. overture里设置踏板标记

    在学习如何设置踏板标记之前,我们先来了解什么是踏板标记.踏板标记一般是使用在乐谱上,众所周知,钢琴有三个踏板,每个踏板的作用都不一样:右边的踏板称为“延音踏板”,是用来延长琴弦振动的时间,使音延长的效 ...

  4. 【Python043-魔法方法:算术方法2】

    一. 反运算符 当对应的操作数不支持调用时,反运算数被调用(参考资料Lhttps://fishc.com.cn/thread-48793-1-1.html ) 1.对象(a+b)相加,如果对象a有__ ...

  5. Cannot add foreign key constraint @ManyToMany @OneToMany

    最近在使用shiro做权限管理模块时,使用的时user(用户)-role(角色)-resource(资源)模式,其中user-role 是多对多,role-resource 也是多对多.但是在使用sp ...

  6. JQ插入节点方法

    1.append()  appendTo()  prepend() prependTo() 2. before() insertBefore() after() insertAfter()

  7. Entity Framework Core导航属性加载问题

    前言 今天下午在开发的时候发现EF Core实体模型中的导航属性为 null,经排查既不是没有加 virtual 关键字,也不是外键关系映射错误. 解决方法 通过查询官网文档,发现,原因在于EF Co ...

  8. NOI1999 生日蛋糕

    #include<iostream> #include<cstdio> #include<cmath> using namespace std; #define I ...

  9. 51nod 1351 吃点心(贪心)

    http://www.51nod.com/onlineJudge/questionCode.html#!problemId=1351 题意: 思路: 要么先选low值大的,要么先选high值大的,分两 ...

  10. 51nod 1215 数组的宽度(单调栈)

    http://www.51nod.com/onlineJudge/questionCode.html#!problemId=1215 题意: 思路: 计算出以第i个数为最大值的区间范围,l_max[i ...