WRF 安装备忘

▶ n 年前在笔记本上安装 WRF 的一个过程

● 安装 cpp，csh，m4，quota，samba

 # apt-get install cpp csh m4 quota samba

● 网上教程有安装hdf5（.nc查看软件），并且版本与 netcdf 有关，不装的话 netcdf 安装时会报错 Error "Can't find or link to the hdf5 library"，实测不安装 hdf5 也没有报错

● 查看 glibc 安装状态，否则补装

 # ldd --version
 # apt-get install glibc

● 安装 zlib，解压zlib-XXX.tar.gz到主目录下，名字改成zlib

 # cd zlib
 # ./configure --prefix=/usr/local/zlib
 # make
 # make install

● 修改 /root/.bashrc，添加以下内容（当年不懂 Linux，居然是安装在 root 账号里？），保存退出后  # source /root/.bashrc

 # for zlib
 export ZLIB = /usr/local/zlib
 export ZLIBLIB = /usr/local/zlib/lib
 export ZLIBINC = /usr/local/zlib/include

● 安装 libpng，解压libpng-XXX.tar.gz到主目录下，名字改成 libpng

 # cd libpng
 # export LDFLAGS="-L /usr/local/zlib/lib"
 # export CPPFLAGS="-I /usr/local/zlib/include"
 # ./configure --prefix=/usr/local/libpng
 # make
 # make install

● 修改 /root/.bashrc，添加以下内容，保存退出后  # source /root/.bashrc

 # for libpng
 export LIBPNG=/usr/local/libpng
 export LIBPNGLIB=/usr/local/libpng/lib
 export LIBPNGINC=/usr/local/libpng/includ

● 安装jasper，解压 jasper-XXX.tar.gz 到主目录下，名字改成 jasper

 # cd jasper
 # ./configure --prefix=/usr/local/jasper
 # make
 # make install

● 修改 /root/.bashrc，添加以下内容，保存退出后  # source /root/.bashrc

 #for jasper
 JASPER=/usr/local/jasper;export JASPER
 JASPERLIB=/usr/local/jasper/lib;export JASPERLIB
 JASPERINC=/usr/local/jasper/include;export JASPERIN

● 安装 WPS 的一个综合库。就是简单的把 zlib、libpng、jasper 的 include 和 lib 合在一起，方便 WPS 编译时调用。新建一个目录 wps（网站教程上一般取名为 JASPER，以区分前面刚安装的的 jasper），下设子目录 include 和 lib）。当时对目录的引用可能有点问题，新建的 wps 似乎没有用上，最终方案是把 zlib 和 libpng 下的 include 和 lib 中的东西全部拷进 jasper 下 include 和 lib 中，才使 WPS 编译成功。

■ 新建大法：

 # mkdir /usr/local/wps
 # mkdir /usr/local/wps/include
 # mkdir /usr/local/wps/lib
 # cp /usr/local/zlib/include/* /usr/local/wps/include
 # cp /usr/local/libpng/include/* /usr/local/wps/include
 # cp /usr/local/jasper/include/* /usr/local/wps/include
 # cp /usr/local/zlib/lib/* /usr/local/wps/lib
 # cp /usr/local/libpng/lib/* /usr/local/wps/lib
 # cp /usr/local/jasper/lib/* /usr/local/wps/lib

■ 修改 /root/.bashrc，添加以下内容，保存退出后  # source /root/.bashrc

 # for WPS
 export WPS=/usr/local/wps
 export WPSLIB=/usr/local/wps/lib
 export WPSINC=/usr/local/wps/include

■ 拷贝大法，同样需要修改 /root/.bashrc不过目录名是 jasper

 # cp /usr/local/zlib/include/* /usr/local/jasper/include
 # cp /usr/local/libpng/include/* /usr/local/jasper/include
 # cp /usr/local/zlib/lib/* /usr/local/jasper/lib
 # cp /usr/local/libpng/lib/* /usr/local/jasper/lib

● 安装 netcdf-4.1.2，解压 netcdf-XXX.tar.gz 到主目录下，名字改成 netcdf

 # cd netcdf
 # ./configure --disable-dap --disable-netcdf- --prefix=/usr/local/netcdf

■ 网上教程要求两个--disable 必须都加，也有说法较新版本（多新不知道）的 WRF 已经支持 netcdf-4 可以不用去除掉，并且需要安装 hdf5 以提供压缩能力

 # make
 # make check
 # make install

● 修改 /root/.bashrc，添加以下内容（实测最后两行很重要，否则 WPS 的 configure 时报错：Your Fortran + NETCDF did not run successfully.

 # for netcdf
 export NETCDF=/usr/local/netcdf
 export PATH=$PATH:$NETCDF/bin:$NETCDF/include:$NETCDF/lib
 export MANPATH=$MANPATH:$NETCDF/share/man
 export LD_LIBRARY_PATH=${NETCDF}/lib:${LD_LIBRARY_PATH}
 export LD_RUN_PATH=${NETCDF}/lib:${LD_RUN_PATH}

● 保存退出后

 # source /root/.bashrc
 # ncdump                # 测试是否成功，成功时返回ncdump命令用法的简单说明

● 安装 ncl，解压 ncl-XXX.tar.gz 到目录 /usr/local，名字改成 ncl

● 修改 /root/.bashrc，添加以下内容

 export NCARG_ROOT=/usr/local/ncl
 export PATH=$NCARG_ROOT/bin:$PATH
 export NCARG_LIB=$NCARG_ROOT/lib
 export NCARG_INC=$NCARG_ROOT/include
 export MANPATH=$NCARG_ROOT/man:$MANPATH
 export DISPLAY=:0.0

● 保存退出后

 # source /root/.bashrc
 # ncl                   # 返回ncl版本信息
 # exit                  # 安全退出 ncl，网络教程说强行关闭可能导致下次无法正常启动
 # ng4ex gsun01n -clean  # 另一个测试，返回若干张图像，需要点击画图区自行加载下一张，不要强行点叉关闭画图窗口或终端，这之后测试文件会在目录 /usr/local 下生成一个叫 gsun01n 的文件，可以删除

● 安装 grib2，解压 grib2-XXX.tar.gz 到目录 /usr/local，名字改成grib2

 # make
 # ./wgrib -s /usr/local/grib2/fnl_20130313_18_00_c # 测试是否正确安装

■ 输出显示如下,表示安装成功

327:30587020:d=13031318:GPA:500 mb:anl:NAve=0

328:30725568:d=13031318:5WAVA:500 mb:anl:NAve=0

...

● 安装 WRFV，修改 /root/.bashrc，添加以下内容，保存退出后  # source /root/.bashrc

 # for WRF large file
 export WRFIO_NCD_LARGE_FILE_SUPPORT=

● 解压WRF3-XXX.tar.gz到主目录下，名字改成WRFV3

 # mkdir /home/cuan/WRF                              # 新建一个位置给WRF（注意文件路径）
 # mv -rf /home/cuan/WRFV3 /home/cuan/WRF
 # cd WRF/WRFV3
 # ./configure                                       # 注意选择编译设置
 # ./compile em_real >& /home/cuan/WRF/wrfv3log.txt  # 尝试编译 test 的一个程序em_real，将日志写入wrfv3log.txt中方便调试
 # cat ../wrfv3log.txt | grep "error:"               # 编译日志中查找报错（要加上“:”，因为可能有 *error.so 等文件干扰）
 # ls -ls /main/*.exe                                # 若没有报错，并在./main中找到ndown.exe，real.exe，tc.exe，wrf.exe 四个可执行文件，则说明成功，否则 debug

● 安装 WPS，解压 WPS-XXX.tar.gz 到主目录下，名字改成 WPS，放进 WRF 文件夹中，打开 /home/cuan/WRF/WPS/configure.wps，修改几个地方

 NCARG_LIBS        =    -L$(NCARG_ROOT)/lib -lncarg -lncarg_gks -lncarg_c \
                        -L/usr/lib:-L/usr/lib/x86_64-linux-gnu -lX11
     # 我的默认是“-L/usr/X16/lib -lX11”，可能安装程序针对的的其他linux版本，文件目录不一样

 COMPRESSION_LIBS    =  -L/usr/local/jasper/lib -ljasper \
                        -L/usr/local/zlib/lib -lz        \
                        -L/usr/local/libpng/lib -lpng
     # 前面使用新建大法的可以尝试或者补上 -L/usr/local/wps/lib -lz -lpng -jasper
     # 网络教程一般都是 /JASPER/lib -ljasper -lpng12 -lpng -lz 或者把 -lpng12 换成-lpng15，都报错“找不到 -lw3 -lpng12 -lpng -lz”

 COMPRESSION_INC        =  -I/usr/local/jasper/include \
                           -I/usr/local/zlib/include   \
                           -I/usr/local/libpng/include
     # 前面使用新建大法的可以尝试或者补上 -I/usr/local/wps/include

● 保存退出，

 # ./configure                               # 注意选择编译设置
 # ./compile wps >& wpslog.txt
 # cat ../wpslog.txt | grep "error:"         # 打开编译日志，查找“error:”报错（要加上“:”，因为可能有 *error.so 等文件干扰）
 # ls -ls *.exe                              # 若没有报错，并找到 geogrid.exe，metgrid.exe，ungrib.exe 三个可执行文件的硬链接，则说明成功，否则 debug

● 编译WPS自带的画图模块（可选，也可用 WPS 输出的数据用 ncl 或 grap 画图）

 # ./compile util >& utillog.txt

■ 报错信息如下，原因是没有找到 libX11.so 文件，但是我的lib X11.so.6，libX11.so.6.3.0，libX11.so.6，libX11-xcb.so.1，libX11-xcb.so.1.0.0 都在已经在 /usr/lib/x86_64-linux-gnu 下了；而且 /usr/bin/ld 是某个应用程序的硬链接，所以没有办法在/usr/bin下新建ld目录让WPS来读取

/usr/bin/ld: 找不到 -lX11
collect2: error: ld returned  exit status
Makefile:: recipe for target 'plotfmt.exe' failed
make[]: [plotfmt.exe] Error  (ignored)
...
/usr/bin/ld: 找不到 -lX11
collect2: error: ld returned  exit status
Makefile:: recipe for target 'plotgrids.exe' failed
make[]: [plotgrids.exe] Error  (ignored)

■ 网络教程指出 Programs 'plotgrids.exe' and 'plotfmt.exe' are no longer automatically compiled with WPS. The reason is that, instead of 'plotgrids.exe,'there is a program called 'plotgrids.ncl' that is compiled, and serves the exact same purpose. 发现 /WRF/WPS/util 下已经有了 plotgrids.ncl，所以放弃编译和安装 plotfmt.exe 和 plotgrids.exe

● 其他可能的报错：
■ 找不到 png.h。原因是 zlib，libpng 和 jasper 的头文件位置错误，参见日志中这个报错信息上一行的路径，把这三个文件夹下 include 内的所有内容拷贝一份放进去（例如我的日志中显示的路径是 /usr/local/jasper/include）
■ 找不到 -lpng -lw3 -lpng12 -lz。同上，这个是 lib 位置错误，同样需要合并

● 总结：WRFDA没有装，ARWpost没有装，WRFDomainWizard没有安装，GrADS没有装，RIP4没有装

● 参考网络教程

【http://bbs.06climate.com/forum.php?mod=viewthread&tid=32817】【http://bbs.06climate.com/forum.php?mod=viewthread&tid=33557】【http://bbs.06climate.com/forum.php?mod=viewthread&tid=3202】【http://bbs.06climate.com/forum.php?mod=viewthread&tid=20885】【http://bbs.06climate.com/archiver/?tid-19021.html】【http://bbs.06climate.com/forum.php?mod=viewthread&tid=32817】【http://blog.sina.com.cn/s/blog_3eac55fd010168ds.html】【http://bbs.06climate.com/forum.php?mod=viewthread&tid=29482】