蒙特·卡罗分子模拟计算

使用蒙特·卡罗方法进行分子模拟计算是按照以下步骤进行的:
1. 使用随机数发生器产生一个随机的分子构型。
2. 对此分子构型的其中粒子坐标做无规则的改变,产生一个新的分子构型。
3. 计算新的分子构型的能量。
4. 比较新的分子构型于改变前的分子构型的能量变化,判断是否接受该构型。
若新的分子构型能量低于原分子构型的能量,则接受新的构型,使用这个构型重复再做下一次迭代。 若新的分子构型能量高于原分子构型的能量,则计算玻尔兹曼因子,并产生一个随机数。若这个随机数大于所计算出的玻尔兹曼因子,则放弃这个构型,重新计算。 若这个随机数小于所计算出的玻尔兹曼因子,则接受这个构型,使用这个构型重复再做下一次迭代。
5. 如此进行迭代计算,直至最后搜索出低于所给能量条件的分子构型结束。
 

模拟退火

原理:模拟退火的原理也和金属退火的原理近似:将热力学的理论套用到统计学上,将搜寻空间内每一点想像成空气内的分子;分子的能量,就是它本身的动能;而搜寻空间内的每一点,也像空气分子一样带有“能量”,以表示该点对命题的合适程度。演算法先以搜寻空间内一个任意点作起始:每一步先选择一个“邻居”,然后再计算从现有位置到达“邻居”的概率

模拟退火模型

模拟退火算法新解的产生和接受可分为如下四个步骤:
第一步是由一个产生函数从当前解产生一个位于解空间的新解;为便于后续的计算和接受,减少算法耗时,通常选择由当前新解经过简单地变换即可产生新解的方法,如对构成新解的全部或部分元素进行置换、互换等,注意到产生新解的变换方法决定了当前新解的邻域结构,因而对冷却进度表的选取有一定的影响。
第二步是计算与新解所对应的目标函数差。因为目标函数差仅由变换部分产生,所以目标函数差的计算最好按增量计算。事实表明,对大多数应用而言,这是计算目标函数差的最快方法。
第三步是判断新解是否被接受,判断的依据是一个接受准则,最常用的接受准则是Metropolis准则: 若Δt′<0则接受S′作为新的当前解S,否则以概率exp(-Δt′/T)接受S′作为新的当前解S。
第四步是当新解被确定接受时,用新解代替当前解,这只需将当前解中对应于产生新解时的变换部分予以实现,同时修正目标函数值即可。此时,当前解实现了一次迭代。可在此基础上开始下一轮试验。而当新解被判定为舍弃时,则在原当前解的基础上继续下一轮试验。
模拟退火算法与初始值无关,算法求得的解与初始解状态S(是算法迭代的起点)无关;模拟退火算法具有渐近收敛性,已在理论上被证明是一种以概率收敛于全局最优解的全局优化算法;模拟退火算法具有并行性

Monte Carlo simulated annealing的更多相关文章

  1. History of Monte Carlo Methods - Part 1

    History of Monte Carlo Methods - Part 1 Some time ago in June 2013 I gave a lab tutorial on Monte Ca ...

  2. Introduction To Monte Carlo Methods

    Introduction To Monte Carlo Methods I’m going to keep this tutorial light on math, because the goal ...

  3. Monte Carlo方法简介(转载)

    Monte Carlo方法简介(转载)       今天向大家介绍一下我现在主要做的这个东东. Monte Carlo方法又称为随机抽样技巧或统计实验方法,属于计算数学的一个分支,它是在上世纪四十年代 ...

  4. 增强学习(四) ----- 蒙特卡罗方法(Monte Carlo Methods)

    1. 蒙特卡罗方法的基本思想 蒙特卡罗方法又叫统计模拟方法,它使用随机数(或伪随机数)来解决计算的问题,是一类重要的数值计算方法.该方法的名字来源于世界著名的赌城蒙特卡罗,而蒙特卡罗方法正是以概率为基 ...

  5. PRML读书会第十一章 Sampling Methods(MCMC, Markov Chain Monte Carlo,细致平稳条件,Metropolis-Hastings,Gibbs Sampling,Slice Sampling,Hamiltonian MCMC)

    主讲人 网络上的尼采 (新浪微博: @Nietzsche_复杂网络机器学习) 网络上的尼采(813394698) 9:05:00  今天的主要内容:Markov Chain Monte Carlo,M ...

  6. Monte Carlo Approximations

    准备总结几篇关于 Markov Chain Monte Carlo 的笔记. 本系列笔记主要译自A Gentle Introduction to Markov Chain Monte Carlo (M ...

  7. (转)Markov Chain Monte Carlo

    Nice R Code Punning code better since 2013 RSS Blog Archives Guides Modules About Markov Chain Monte ...

  8. [其他] 蒙特卡洛(Monte Carlo)模拟手把手教基于EXCEL与Crystal Ball的蒙特卡洛成本模拟过程实例:

    http://www.cqt8.com/soft/html/723.html下载,官网下载 (转帖)1.定义: 蒙特卡洛(Monte Carlo)模拟是一种通过设定随机过程,反复生成时间序列,计算参数 ...

  9. Introduction to Monte Carlo Tree Search (蒙特卡罗搜索树简介)

    Introduction to Monte Carlo Tree Search (蒙特卡罗搜索树简介)  部分翻译自“Monte Carlo Tree Search and Its Applicati ...

随机推荐

  1. [转]Emmet使用详解

    Emmet的前身是大名鼎鼎的Zen coding,如果你从事Web前端开发的话,对该插件一定不会陌生.它使用仿CSS选择器的语法来生成代码,大大提高了HTML/CSS代码编写的速度,而且作为一款插件能 ...

  2. ffmpeg转码器移植VC的project:ffmpeg for MFC

    本文介绍一个自己做的FFMPEG移植到VC下的开源project:ffmpeg for MFC.本project将ffmpegproject中的ffmpeg转码器(ffmpeg.c)移植到了VC环境下 ...

  3. rm -rf python 实现 v0.1

    #coding=utf- import os def join(arr,join_falg): res = "" for a in arr: res += a+join_falg ...

  4. 会使用基本的Render函数后,就会想,这怎么用 v-for/v-if/v-model;我写个vue Render函数进阶

    https://blog.csdn.net/wngzhem/article/details/54291024

  5. 想拥有一款钢铁侠Jarvis管家的软件吗?

    漫威的<钢铁侠>电影很好看,里面钢铁侠的管家Jarvis,可以说非常酷.既能管理日常生活,还能组装钢铁战衣.跟随托尼出生入死,形影不离. 那么现实生活中,想不想拥有这一款软件?看看下面这个 ...

  6. 解决vscode无法安装golang相关插件的问题 - 即无法直连golang.org的问题

    喜欢挂vpn或者代理的请无视本文. 其实golang.org上的插件在github.com上都有镜像,直接 git clone https://github.com/golang/tools git ...

  7. [2]朝花夕拾-JAVA注解、PHP注解?

    一.Java注解概述 注解,也被称为元数据,为我们在代码中添加信息提供了一种形式化的方法,是我们可以在稍后某个时刻非常方便地使用这些数据. 注解在一定程度上是把元数据与源代码文件结合在一起,而不是保存 ...

  8. 利用PowerShell监控Win-Server性能

    Q:如何系统层面的去监控一下Windows Server? A:额……一时间的话……能想到的可能也就是PowerShell+SQL Server+job,试试. 1.关于PowerShell 2.Po ...

  9. 机器人学 —— 机器人感知(Location)

    终于完成了Robotic SLAM 所有的内容了.说实话,课程的内容比较一般,但是作业还是挺有挑战性的.最后一章的内容是 Location. Location 是 Mapping 的逆过程.在给定ma ...

  10. PGP NO_PUBKEY

    horizon@horizon-pc ~ $ sudo apt-get update Ign http://packages.linuxmint.com rebecca/upstream Transl ...