Gretna2.0 使用过程中遇到的问题
在做Normalize的时候,报错“Cannot find T1 image (e.g. *.dcm in T1 Directory), Please Check again!”,但是Pipeline的时候不会报错。
背景:之前使用Gretna做批处理,进行到一半的时候报错,说“Something went bad... the pipeline has FAILED”,当时查了一下,发现是第84个被试出了问题,于是以为是第84个被试的数据有问题,就把第84个被试从DICOM和T1数据的文件夹中移除了,但是并没有删除GretnaFunNIfTI文件夹下的subj_0084。同时开始分步运行Gretna。
结果问题就出在“没有删除GretnaFunNIfTI文件夹下的subj_0084”,在Gretna的分步计算过程中,输入变成了GretnaFunNIfTI下的文件,这样一来,gretna就会在T1文件夹下寻找subj_0084,找不到就报错了。
【备注】调试GUI文件夹下的gretna_GUI_PreprocessInterface.m文件
为了避免这类问题,我把Gretna的源代码进行了修改,使其提示更加人性化,修改的代码如下:
% modify by supakito
FlagEmptyies = cellfun(@isempty, InputT1FileList);
if any(FlagEmptyies)
NoT1Subjs = strjoin(SList(find(FlagEmptyies)),',');
errordlg(['Cannot find T1 image (e.g. *.dcm in T1 Directory), Please Check ',NoT1Subjs]);
return;
end
% end of modify by supakito
用于替换Gretna的gretna_GUI_PreprocessInterface.m中735行的:
if any(cellfun(@isempty, InputT1FileList))
errordlg('Cannot find T1 image (e.g. *.dcm in T1 Directory), Please Check again!');
return;
end
Gretna2.0 使用过程中遇到的问题的更多相关文章
- source insight 4.0.86.0 安装过程中出现的问题
1.sourceinsight_4.0.86.0-setup.exe 2.sourceinsight4.exe覆盖安装目录中的sourceinsight4.exe 3.导入lic文件 过程中360会将 ...
- 记录centos6.8安装Oracle10.2.0.1过程中的错误解决
[root@hadoop01 database]# ./runInstaller ./runInstaller: /opt/database/install/.oui: /lib/ld-linux.s ...
- VMware虚拟机升级过程中遇到的一点问题
在将VWware由9.0升级到10.0的过程中,出现如下图的错误: failed to create the requested registry key Key:Installer e ...
- zabbix 3.0.3 (nginx)安装过程中的问题排错记录
特殊注明:安装zabbix 2.4.8和2.4.6遇到2个问题,如下:找了很多解决办法,实在无解,只能换版本,尝试换(2.2.2正常 | 3.0.3正常)都正常,最后决定换3.0.3 1.Error ...
- iOS开发之#iPhone6与iPhone6Plus适配#Xcode6.0/Xcode6.1上传应用过程中一些变动以及#解决方案#
更新时间2014年11月13日 本博文创建时,只有Xcode6.0, Xcode6.0尝试多次,确实如此 之后在6.1版本经博主少量尝试,确实也有如下问题,现更新下博客! iOS8发布之后,苹果强制 ...
- 已成功与服务器建立连接,但是在登录过程中发生错误。 (provider: SSL Provider, error: 0 - 接收到的消息异常,或格式不正确。)
之前做好的asp.net部署后,发现 访问数据库时: 异常:已捕获: "已成功与服务器建立连接,但是在登录过程中发生错误. (provider: SSL Provider, error: 0 ...
- 关于火狐浏览器在开发调试过程中,出现javascript:void(0)的状态
关于火狐浏览器在开发调试过程中,出现javascript:void(0)的状态 由于火狐浏览器没有安装 Adobe Flash Player 19 NPAPI这个插件 安装好了之后就可以直接运行了
- Android音视频通话过程中最小化成悬浮框的实现(类似Android8.0画中画效果)
关于音视频通话过程中最小化成悬浮框这个功能的实现,网络上类似的文章很多,但是好像还没看到解释的较为清晰的,这里因为项目需要实现了这样的一个功能,今天我把它记录下来,一方面为了以后用到便于自己查阅,一方 ...
- SQL Server(解决问题)已成功与服务器建立连接,但是在登录过程中发生错误。(provider: Shared Memory Provider, error:0 - 管道的另一端上无任何进程。
http://blog.csdn.net/github_35160620/article/details/52676416 如果你在使用新创建的 SQL Server 用户名和密码 对数据库进行连接的 ...
随机推荐
- guice基本使用,guice整合guice-servlet,web scope注解(六)
guice servlet提供了几个比较有用的web scope,类似与传统servlet 的session,request这些提供的范围等. guice servlet 提供的web scope 如 ...
- arttemplate.js简洁写法案例
<!DOCTYPE html> <html> <head lang="en"> <meta charset="UTF-8&quo ...
- (转载)Android常用的Dialog对话框用法
Android常用的Dialog对话框用法 Android的版本有很多通常开发的时候对话框大多数使用自定义或是 Google提供的V4, V7 兼容包来开发保持各个版本的对话框样式统一,所以这里使用的 ...
- 8) 十分钟学会android--Activity的生命周期之停止与重启
恰当的停止与重启我们的activity是很重要的,在activity生命周期中,他们能确保用户感知到程序的存在并不会丢失他们的进度.在下面一些关键的场景中会涉及到停止与重启: 用户打开最近使用app的 ...
- 【Oracle】闪回drop后的表
本文介绍的闪回方式只适用于:删除表的表空间非system,drop语句中没有purge关键字(以上两种情况的误删除操作只能通过日志找回): 1.删除表后直接从回收站闪回 SCOTT@LGR> d ...
- [转]Git入门与实践(一)
git入门与实践(一) · March 10th, 2010 · Posted in UNIX环境编程 · By ghosTM55 Write comment ...
- WPF 解决拼接屏全屏的问题
需求: 8块1920*1080屏幕拼接 橙色4个框每个框(1920*1080)拼接成一个1920*1080 红色4个框每个框(1920*1080)拼接成一个1920*1080 橙色和红色作为displ ...
- 搞不懂的算法-排序篇<2>
上一篇排序算法<1>中,排序算法的时间复杂度从N2到NlgN变化,但他们都有一个共同的特点,基于比较和交换数组中的元素来实现排序,我们称这些排序算法为比较排序算法.对于比较排序算法,所有的 ...
- win系统如何在桌面显示我的电脑
如果是在Windows Server 2012本地控制台下,直接按Win(键盘上的微软徽标键)+R,输入: rundll32.exe shell32.dll,Control_RunDLL desk.c ...
- concurrently - npm 同时运行前端和后台服务
项目基于vue(前端)+node(后台),需要启动两个服务 0.文件夹结构及package.json内容: 1.客户端 npm run dev 2.服务器 cd server npm run serv ...