在做Normalize的时候,报错“Cannot find T1 image (e.g. *.dcm in T1 Directory), Please Check again!”,但是Pipeline的时候不会报错。

背景:之前使用Gretna做批处理,进行到一半的时候报错,说“Something went bad... the pipeline has FAILED”,当时查了一下,发现是第84个被试出了问题,于是以为是第84个被试的数据有问题,就把第84个被试从DICOM和T1数据的文件夹中移除了,但是并没有删除GretnaFunNIfTI文件夹下的subj_0084。同时开始分步运行Gretna。

结果问题就出在“没有删除GretnaFunNIfTI文件夹下的subj_0084”,在Gretna的分步计算过程中,输入变成了GretnaFunNIfTI下的文件,这样一来,gretna就会在T1文件夹下寻找subj_0084,找不到就报错了。

【备注】调试GUI文件夹下的gretna_GUI_PreprocessInterface.m文件

为了避免这类问题,我把Gretna的源代码进行了修改,使其提示更加人性化,修改的代码如下:

% modify by supakito
FlagEmptyies = cellfun(@isempty, InputT1FileList);
if any(FlagEmptyies)
NoT1Subjs = strjoin(SList(find(FlagEmptyies)),',');
errordlg(['Cannot find T1 image (e.g. *.dcm in T1 Directory), Please Check ',NoT1Subjs]);
return;
end
% end of modify by supakito

用于替换Gretna的gretna_GUI_PreprocessInterface.m中735行的:

if any(cellfun(@isempty, InputT1FileList))
errordlg('Cannot find T1 image (e.g. *.dcm in T1 Directory), Please Check again!');
return;
end

Gretna2.0 使用过程中遇到的问题的更多相关文章

  1. source insight 4.0.86.0 安装过程中出现的问题

    1.sourceinsight_4.0.86.0-setup.exe 2.sourceinsight4.exe覆盖安装目录中的sourceinsight4.exe 3.导入lic文件 过程中360会将 ...

  2. 记录centos6.8安装Oracle10.2.0.1过程中的错误解决

    [root@hadoop01 database]# ./runInstaller ./runInstaller: /opt/database/install/.oui: /lib/ld-linux.s ...

  3. VMware虚拟机升级过程中遇到的一点问题

    在将VWware由9.0升级到10.0的过程中,出现如下图的错误:        failed to create the requested registry key Key:Installer e ...

  4. zabbix 3.0.3 (nginx)安装过程中的问题排错记录

    特殊注明:安装zabbix 2.4.8和2.4.6遇到2个问题,如下:找了很多解决办法,实在无解,只能换版本,尝试换(2.2.2正常 | 3.0.3正常)都正常,最后决定换3.0.3 1.Error ...

  5. iOS开发之#iPhone6与iPhone6Plus适配#Xcode6.0/Xcode6.1上传应用过程中一些变动以及#解决方案#

    更新时间2014年11月13日  本博文创建时,只有Xcode6.0, Xcode6.0尝试多次,确实如此 之后在6.1版本经博主少量尝试,确实也有如下问题,现更新下博客! iOS8发布之后,苹果强制 ...

  6. 已成功与服务器建立连接,但是在登录过程中发生错误。 (provider: SSL Provider, error: 0 - 接收到的消息异常,或格式不正确。)

    之前做好的asp.net部署后,发现 访问数据库时: 异常:已捕获: "已成功与服务器建立连接,但是在登录过程中发生错误. (provider: SSL Provider, error: 0 ...

  7. 关于火狐浏览器在开发调试过程中,出现javascript:void(0)的状态

    关于火狐浏览器在开发调试过程中,出现javascript:void(0)的状态 由于火狐浏览器没有安装 Adobe Flash Player 19 NPAPI这个插件 安装好了之后就可以直接运行了

  8. Android音视频通话过程中最小化成悬浮框的实现(类似Android8.0画中画效果)

    关于音视频通话过程中最小化成悬浮框这个功能的实现,网络上类似的文章很多,但是好像还没看到解释的较为清晰的,这里因为项目需要实现了这样的一个功能,今天我把它记录下来,一方面为了以后用到便于自己查阅,一方 ...

  9. SQL Server(解决问题)已成功与服务器建立连接,但是在登录过程中发生错误。(provider: Shared Memory Provider, error:0 - 管道的另一端上无任何进程。

    http://blog.csdn.net/github_35160620/article/details/52676416 如果你在使用新创建的 SQL Server 用户名和密码 对数据库进行连接的 ...

随机推荐

  1. 从谷歌官网下载android 6.0源码、编译并刷入nexus 6p手机

    版权声明:本文为博主原创文章,未经博主允许不得转载. https://blog.csdn.net/fuchaosz/article/details/52473660 1 前言 经过一周的奋战,终于从谷 ...

  2. JavaScriptResult

  3. P3805 【模版】manacher算法

    题目描述 给出一个只由小写英文字符a,b,c...y,z组成的字符串S,求S中最长回文串的长度. 字符串长度为n 输入输出格式 输入格式: 一行小写英文字符a,b,c...y,z组成的字符串S 输出格 ...

  4. Python框架、库和软件资源大全(整理篇)

    有少量修改,请访问原始链接.PythonWIn的exe安装包;http://www.lfd.uci.edu/~gohlke/pythonlibs/ 原文链接:codecloud.net/python- ...

  5. QT+VTK 对接使用

    由于MFC和pcl的不兼容问题,只能用QT和VTK进行程序开发,确实是一件蛋疼的事! 出自于QT与VTK结合系列:http://blog.csdn.net/tonylk/article/details ...

  6. swift Self

    'Self' is the type of a protocol/class/struct/enum.And the 'self' is a instance of a class/struct/en ...

  7. Jquery 研究 入口

    <script type="text/javascript"> //var jQuery = function () { // console.log(jQuery.f ...

  8. 常用 CSS 选择器

    // css 读取顺序从右到左,符合要求的都会匹配 // 通配符选择器 -- 选择所有元素 * // 通配符选择器 -- 选择某个元素下的所有元素 .demo * // 元素选择器 html,body ...

  9. .apply .call方法的区别及使用 .apply第二个参数为数组,.call第二个参数为参数列表, 相同点:第一个参数都为Function函数内部的this对象.

    Function.apply(obj,args)方法能接收两个参数 obj:这个对象将代替Function类里this对象 args:这个是数组,它将作为参数传给Function(args--> ...

  10. VMware虚拟机共享文件夹问题: /mnt下没有hgfs文件夹

    在使用vmware虚拟机共享文件夹功能的时候,发现在/mnt目录下面没有hgfs文件夹,但是vmware-tool的命令vmhgfs-fuse确实存在于系统中.在使用vmhgfs-fuse建立宿主机到 ...