Gretna2.0 使用过程中遇到的问题
在做Normalize的时候,报错“Cannot find T1 image (e.g. *.dcm in T1 Directory), Please Check again!”,但是Pipeline的时候不会报错。
背景:之前使用Gretna做批处理,进行到一半的时候报错,说“Something went bad... the pipeline has FAILED”,当时查了一下,发现是第84个被试出了问题,于是以为是第84个被试的数据有问题,就把第84个被试从DICOM和T1数据的文件夹中移除了,但是并没有删除GretnaFunNIfTI文件夹下的subj_0084。同时开始分步运行Gretna。
结果问题就出在“没有删除GretnaFunNIfTI文件夹下的subj_0084”,在Gretna的分步计算过程中,输入变成了GretnaFunNIfTI下的文件,这样一来,gretna就会在T1文件夹下寻找subj_0084,找不到就报错了。
【备注】调试GUI文件夹下的gretna_GUI_PreprocessInterface.m文件
为了避免这类问题,我把Gretna的源代码进行了修改,使其提示更加人性化,修改的代码如下:
% modify by supakito
FlagEmptyies = cellfun(@isempty, InputT1FileList);
if any(FlagEmptyies)
NoT1Subjs = strjoin(SList(find(FlagEmptyies)),',');
errordlg(['Cannot find T1 image (e.g. *.dcm in T1 Directory), Please Check ',NoT1Subjs]);
return;
end
% end of modify by supakito
用于替换Gretna的gretna_GUI_PreprocessInterface.m中735行的:
if any(cellfun(@isempty, InputT1FileList))
errordlg('Cannot find T1 image (e.g. *.dcm in T1 Directory), Please Check again!');
return;
end
Gretna2.0 使用过程中遇到的问题的更多相关文章
- source insight 4.0.86.0 安装过程中出现的问题
1.sourceinsight_4.0.86.0-setup.exe 2.sourceinsight4.exe覆盖安装目录中的sourceinsight4.exe 3.导入lic文件 过程中360会将 ...
- 记录centos6.8安装Oracle10.2.0.1过程中的错误解决
[root@hadoop01 database]# ./runInstaller ./runInstaller: /opt/database/install/.oui: /lib/ld-linux.s ...
- VMware虚拟机升级过程中遇到的一点问题
在将VWware由9.0升级到10.0的过程中,出现如下图的错误: failed to create the requested registry key Key:Installer e ...
- zabbix 3.0.3 (nginx)安装过程中的问题排错记录
特殊注明:安装zabbix 2.4.8和2.4.6遇到2个问题,如下:找了很多解决办法,实在无解,只能换版本,尝试换(2.2.2正常 | 3.0.3正常)都正常,最后决定换3.0.3 1.Error ...
- iOS开发之#iPhone6与iPhone6Plus适配#Xcode6.0/Xcode6.1上传应用过程中一些变动以及#解决方案#
更新时间2014年11月13日 本博文创建时,只有Xcode6.0, Xcode6.0尝试多次,确实如此 之后在6.1版本经博主少量尝试,确实也有如下问题,现更新下博客! iOS8发布之后,苹果强制 ...
- 已成功与服务器建立连接,但是在登录过程中发生错误。 (provider: SSL Provider, error: 0 - 接收到的消息异常,或格式不正确。)
之前做好的asp.net部署后,发现 访问数据库时: 异常:已捕获: "已成功与服务器建立连接,但是在登录过程中发生错误. (provider: SSL Provider, error: 0 ...
- 关于火狐浏览器在开发调试过程中,出现javascript:void(0)的状态
关于火狐浏览器在开发调试过程中,出现javascript:void(0)的状态 由于火狐浏览器没有安装 Adobe Flash Player 19 NPAPI这个插件 安装好了之后就可以直接运行了
- Android音视频通话过程中最小化成悬浮框的实现(类似Android8.0画中画效果)
关于音视频通话过程中最小化成悬浮框这个功能的实现,网络上类似的文章很多,但是好像还没看到解释的较为清晰的,这里因为项目需要实现了这样的一个功能,今天我把它记录下来,一方面为了以后用到便于自己查阅,一方 ...
- SQL Server(解决问题)已成功与服务器建立连接,但是在登录过程中发生错误。(provider: Shared Memory Provider, error:0 - 管道的另一端上无任何进程。
http://blog.csdn.net/github_35160620/article/details/52676416 如果你在使用新创建的 SQL Server 用户名和密码 对数据库进行连接的 ...
随机推荐
- 使用Aliyun Docker 容器镜像/注册表服务
1.前往阿里云容器镜像服务创建相关资源. 2.登录你的仓库,账户名+公共地址 docker login --username=xxxxxxxxx@aliyun.com registry.cn-hang ...
- poj 1161 Floyd+枚举
题意是: 给出n个点,围成m个区域.从区域到另一个区域间需穿过至少一条边(若两区域相邻)——边连接着两点. 给出这么一幅图,并给出一些点,问从这些点到同一个区域的穿过边数最小值. 解题思路如下: 将区 ...
- WPF全球化与本地化
当一个App需要推出多语言版本时,就需要使用到[全球化与本地化]服务. 原理及过程 资源文件中包含了所有的控件信息,通过导出这些控件信息,修改其对应的相关属性(比如TextBlock的Text属性)的 ...
- JavaScript命名空间的理解与实现
命名空间有效防止函数名/类名和其他人的冲突,在使用多个第三方框架或类库的时候,一旦冲突,唯一能作的就是放弃其中一个.从事Web开发不可避免要接触JavaScript,目前最新版本的JavaScript ...
- map使用
// map使用 1 #include <iostream> #include "insertVal.h" #include "sort.h" us ...
- 修改织梦plus目录名
1.修改plus目录名 修改inlclude文件夹下common.inc.php 140行 //插件目录,这个目录是用于存放计数器.投票.评论等程序的必要动态程序 $cfg_plus_dir = $c ...
- Android AlertDialog 动态更新里面的ListView数据
1:和ListView的数据跟新是基本一样的. 2:Activity代码示例 public class MainActivity extends AppCompatActivity { AlertDi ...
- hdu2647 Reward 拓扑排序
此题的关键在于分层次,最低一层的人的奖金是888,第二层是888+1 …… 分层可以这样实现.建立反向图.在拓扑排序的时候,第一批入度为0的点就处于第一层,第二批处于第二层 …… 由于是逐个遍历入度为 ...
- Walking on the path of Redis --- Data structure
废话开篇 相比于其他内存数据库,Redis最大的特点就是拥有丰富的数据结构, 经常被称为Date Structure Server.Redis支持的数据结构包含strings, hashes, lis ...
- Boost锁~临界区保护和临界资源共享
前言: 除了thread,boost::thread另一个重要组成部分是mutex,以及工作在mutex上的boost::mutex::scoped_lock.condition和barrier,这些 ...