https://www.cnblogs.com/johnsonzzz/p/15151634.html

https://github.com/YangJianshun/LINKVIEW

可以绘制两个基因组、三个基因组的染色体水平的共线性关系。

按染色体配置比对文件参数,配置-k参数可以调整染色体的位置。

Nucmer+LINKVIEW实现序列水平的共线性分析的更多相关文章

  1. 基因组共线性分析工具MCScanX

    软件简介 MCScanX工具集对MCScan算法进行了调整,用于检测共线性和同线性区域,还增加了可视化和下游分析..MCscanX有三个核心工具,以及12个下游分析工具. 软件安装 进入官网http: ...

  2. 共线性分析-MCscan - python (jcvi)

    本来是不会再写这个文档的,但是由于长时间没有用这个模块,这个模块不知道是我自己弄掉了,还是别的同学误删了,于是我重新安装一下. 首先下载conda,并下载好python which pip 直接安装 ...

  3. R语言实战(五)方差分析与功效分析

    本文对应<R语言实战>第9章:方差分析:第10章:功效分析 ================================================================ ...

  4. 搜索引擎case︱从搜索序列文本看高端商务车︱统计之都

    朱雪宁(北京大学光华管理学院)               王汉生(北京大学光华管理学院) 摘要:本文对100万搜索引擎用户的13亿搜索序列文本进行探索分析,对高端车用户以及商学院人群做了描述对比,并 ...

  5. R in action读书笔记(13)第十章 功效分析

    功效分析 功效分析可以帮助在给定置信度的情况下,判断检测到给定效应值时所需的样本量.反过来,它也可以帮助你在给定置信度水平情况下,计算在某样本量内能检测到给定效应值的概率.如果概率低得难以接受,修改或 ...

  6. 生物信息-McScan(Python-jcvi)共线性画图

    比较基因组学中,共线性的分析的图无疑是最漂亮的. 共线性分析可以很好地解释进化关系和多倍化事件. 本文主要介绍的是唐老师的Python版McScan(jcvi工具包),这个包很强大,但是其功能在官网的 ...

  7. 剑指Offer面试题:20.栈的压入、弹出序列

    一.题目:栈的压入.弹出序列 题目:输入两个整数序列,第一个序列表示栈的压入顺序,请判断第二个序列是否为该栈的弹出顺序.假设压入栈的所有数字均不相等.例如序列1.2.3.4.5是某栈的压栈序列,序列4 ...

  8. SPSS数据分析—生存分析

    生存分析是对生存时间进行统计分析的一种技术,所谓生存时间,就是指从某一时间点起到所关心的事件发生的这段时间.这里的时间不一定就是钟表日历上的时间,也有可能是其他的度量单位,比如长度单位等. 生存时间有 ...

  9. LR12.53—第7课:分析场景

    第7课:分析场景 在前面的课程中,您学习如何设计,控制和执行方案运行.一旦您已加载您的服务器,你要分析的运行,并确定需要被淘汰,以提高系统性能的问题. 在图表和报告中有关方案的性能您的分析会议上提出的 ...

  10. 《UNIX/Linux网络日志分析与流量监控》新书发布

    本书从UNIX/Linux系统的原始日志(Raw Log)采集与分析讲起,逐步深入到日志审计与计算机取证环节.书中提供了多个案例,每个案例都以一种生动的记事手法讲述了网络遭到入侵之后,管理人员开展系统 ...

随机推荐

  1. 基于C++的OpenGL 13 之Mesh

    1. 引言 本文基于C++语言,描述OpenGL的Mesh 前置知识可参考: 基于C++的OpenGL 12 之多光源 - 当时明月在曾照彩云归 - 博客园 (cnblogs.com) 笔者这里不过多 ...

  2. PYTHON编写程序练习-打印99乘法表

    使用for循环嵌套的知识点编写 for i in range(1,10):   #第一层循环,循环乘数 for j in range(1,i+1):   #第二层循环,循环被乘数 print(f&qu ...

  3. 补充人物pawn的旋转方向

    先找到控制pawn的控制器的Rotation GetControlRotaion() 然后获得控制器的Z轴旋转 创建新的Rotator YawRotaion(0,GetControlRotaion() ...

  4. Python中文官方文档

    Python 2.7.18 的中文文档:  https://docs.python.org/zh-cn/2.7/ Python 3.10.6 的官方文档:https://docs.python.org ...

  5. js-解决安卓手机软键盘弹出后,固定定位布局被顶上移问题

    分析:软键盘弹出后,导致页面高度变化 解决方案:软键盘弹出后,修复页面高度 // 监听窗口变化 resizeScreen(){ if (!this.state.isIOS && thi ...

  6. Dynamics365 DOC

    Sample: Early-bound table operationshttps://docs.microsoft.com/en-us/powerapps/developer/data-platfo ...

  7. 2.2 在resources目录下,新建applicationContext.xml

    <?xml version="1.0" encoding="UTF-8"?> <beans> <!-- 这个bean标签的作用是, ...

  8. SAP GGB1替换 发现没有替换的字段 解决

    需求 替代凭证中的付款方式为默认值 GGB1替代 如上图所示 并没有我们想到替换的zschl字段 这就需要我们去维护一张配置表 将这个字段放出来 sm30--VWTYGB01 将对应字段的勾去掉即可, ...

  9. 前端 ArrayBuffer 与 Blob 互转

    我们在使用ajax向后端发送请求时,responseType可以设置返回数据的格式,它支持的格式有"text"."arraybuffer"."blob ...

  10. rabbitmq监控与运维

    一.系统架构 二.监控 本指南涵盖了使用两个流行工具进行 RabbitMQ 监控: Prometheus,一个监控工具包:和Grafana,一个指标可视化系统.这些工具共同构成了一个强大的工具包,用于 ...