Nucmer+LINKVIEW实现序列水平的共线性分析
https://www.cnblogs.com/johnsonzzz/p/15151634.html
https://github.com/YangJianshun/LINKVIEW
可以绘制两个基因组、三个基因组的染色体水平的共线性关系。
按染色体配置比对文件参数,配置-k参数可以调整染色体的位置。
Nucmer+LINKVIEW实现序列水平的共线性分析的更多相关文章
- 基因组共线性分析工具MCScanX
软件简介 MCScanX工具集对MCScan算法进行了调整,用于检测共线性和同线性区域,还增加了可视化和下游分析..MCscanX有三个核心工具,以及12个下游分析工具. 软件安装 进入官网http: ...
- 共线性分析-MCscan - python (jcvi)
本来是不会再写这个文档的,但是由于长时间没有用这个模块,这个模块不知道是我自己弄掉了,还是别的同学误删了,于是我重新安装一下. 首先下载conda,并下载好python which pip 直接安装 ...
- R语言实战(五)方差分析与功效分析
本文对应<R语言实战>第9章:方差分析:第10章:功效分析 ================================================================ ...
- 搜索引擎case︱从搜索序列文本看高端商务车︱统计之都
朱雪宁(北京大学光华管理学院) 王汉生(北京大学光华管理学院) 摘要:本文对100万搜索引擎用户的13亿搜索序列文本进行探索分析,对高端车用户以及商学院人群做了描述对比,并 ...
- R in action读书笔记(13)第十章 功效分析
功效分析 功效分析可以帮助在给定置信度的情况下,判断检测到给定效应值时所需的样本量.反过来,它也可以帮助你在给定置信度水平情况下,计算在某样本量内能检测到给定效应值的概率.如果概率低得难以接受,修改或 ...
- 生物信息-McScan(Python-jcvi)共线性画图
比较基因组学中,共线性的分析的图无疑是最漂亮的. 共线性分析可以很好地解释进化关系和多倍化事件. 本文主要介绍的是唐老师的Python版McScan(jcvi工具包),这个包很强大,但是其功能在官网的 ...
- 剑指Offer面试题:20.栈的压入、弹出序列
一.题目:栈的压入.弹出序列 题目:输入两个整数序列,第一个序列表示栈的压入顺序,请判断第二个序列是否为该栈的弹出顺序.假设压入栈的所有数字均不相等.例如序列1.2.3.4.5是某栈的压栈序列,序列4 ...
- SPSS数据分析—生存分析
生存分析是对生存时间进行统计分析的一种技术,所谓生存时间,就是指从某一时间点起到所关心的事件发生的这段时间.这里的时间不一定就是钟表日历上的时间,也有可能是其他的度量单位,比如长度单位等. 生存时间有 ...
- LR12.53—第7课:分析场景
第7课:分析场景 在前面的课程中,您学习如何设计,控制和执行方案运行.一旦您已加载您的服务器,你要分析的运行,并确定需要被淘汰,以提高系统性能的问题. 在图表和报告中有关方案的性能您的分析会议上提出的 ...
- 《UNIX/Linux网络日志分析与流量监控》新书发布
本书从UNIX/Linux系统的原始日志(Raw Log)采集与分析讲起,逐步深入到日志审计与计算机取证环节.书中提供了多个案例,每个案例都以一种生动的记事手法讲述了网络遭到入侵之后,管理人员开展系统 ...
随机推荐
- StatefulWidget 组件的参数时(widget.xxx)报 Invalid Constant Value
一个 Flutter 组件(Widget)在很多情况下都需要接收一些参数.Flutter 插件通常提示使用 const 关键字包裹某 Widget(很多人接受建议且执行),导致通过 widget.xx ...
- LeetCode-23 合并K个升序链表
来源:力扣(LeetCode)链接:https://leetcode-cn.com/problems/merge-k-sorted-lists 题目描述 给你一个链表数组,每个链表都已经按升序排列. ...
- Spring cloud Sleuth 分布式链路跟踪
在微服务框架种. 一个由客户端发起的请求在后端系统种会经过不同的服务节点来调用协同产生的最后的请求结果. 每一个前端请求都会形成一条复杂的分布式服务调用的链路.链路种出现任何一环出现高延时或者错误都会 ...
- golang输出字母a-z
方法1: func main() { for i := 0; i < 10; i++ { ss := 'a' + i fmt.Printf("==%c", ss) } }
- mybatis处理一对多的映射关系
实体类 package org.example.entity; import java.util.List; public class Dept { private Integer deptId; p ...
- 野火FreeRTOS第九章(任务延时列表)实验意外解决办法
书中说:main()函数内容与第8章一样,无需改动. 但实际代码中,添加了在开启调度前关闭中断的函数,如下红色代码所示: int main(void) { /* 硬件初始化 */ /* 将硬件相关的初 ...
- WDA学习(27):RoadMap使用
1.20 UI Element:RoadMap使用 本实例测试创建RoadMap; 运行结果: 点击2,Input显示输入航班Id 点击3,根据input输入,查询航班信息 1.创建Component ...
- NRF52832中文资料+蓝牙芯片
[产品应用] Nordic Semiconductor发布采用微型封装尺寸的高性能单芯片低功耗蓝牙SoC器件,瞄准新一代可穿戴产品和空间受限的loT应用.[产品说明]nRF52832晶圆级芯片尺寸封装 ...
- linux磁盘读写速度测试
磁盘读写速度标准 1.机械硬盘读写速度平均60---80M每秒. 2.固态硬盘不同品牌型号之间,平均大约在150---300M每秒. 3.5400转的笔记本硬盘:50-90MB每秒. 4.7200转的 ...
- hyper给linux扩容空间
1.hyper操作 (1)关机后,在设置中,查看硬盘驱动器中的虚拟磁盘及编号, (2)编辑磁盘->查找磁盘中选中刚才的编号磁盘 (3)操作时扩容(大小填的不是增量 ,是扩容以后的空间) 2.li ...