import sys

infile = sys.argv[1]
outfile = sys.argv[2]

gff_list = []
fh = open(infile)
for x in fh:
    if x[0] == '#': continue
    y = x.strip().split('\t')
    gff_list.append(y)

gff_list.sort(key=lambda a:int(a[3]))
gff_list.sort(key=lambda a:a[0])

fh = open(outfile,'w')
for x in gff_list:
    fh.write("\t".join(x) + "\n")

sort_gff.py的更多相关文章

  1. python调用py中rar的路径问题。

    1.python调用py,在py中的os.getcwd()获取的不是py的路径,可以通过os.path.split(os.path.realpath(__file__))[0]来获取py的路径. 2. ...

  2. Python导入其他文件中的.py文件 即模块

    import sys sys.path.append("路径") import .py文件

  3. import renumber.py in pymol

    cp renumber.py /usr/local/lib/python2.7/dist-packages/pymol import renumber or run /path/to/renumber ...

  4. python gettitle.py

    #!/usr/bin/env python # coding=utf-8 import threading import requests import Queue import sys import ...

  5. 解决 odoo.py: error: option --addons-path: The addons-path 'local-addons/' does not seem to a be a valid Addons Directory!

    情况说明 odoo源文件路径-/odoo-dev/odoo/: 我的模块插件路径 ~/odoo-dev/local-addons/my-module 在my-module中创建了__init__.py ...

  6. caffe机器学习自带图片分类器classify.py实现输出预测结果的概率及caffe的web_demo例子运行实例

    caffe机器学习环境搭建及python接口编译参见我的上一篇博客:机器学习caffe环境搭建--redhat7.1和caffe的python接口编译 1.运行caffe图片分类器python接口 还 ...

  7. 【转】Windows下使用libsvm中的grid.py和easy.py进行参数调优

    libsvm中有进行参数调优的工具grid.py和easy.py可以使用,这些工具可以帮助我们选择更好的参数,减少自己参数选优带来的烦扰. 所需工具:libsvm.gnuplot 本机环境:Windo ...

  8. MySqlNDB使用自带的ndb_setup.py安装集群

    在用Mysql做集群时,使用Mysql的NDB版本更易于集群的扩展,稳定和数据的实时性. 我们可以使用Mysql自带的工具进行集群安装与管理:ndb_setup.py.位于Mysql的安装目录bin下 ...

  9. 将做好的py文件打包成模块，供别人安装调用

    现在要将写完的3个py文件,打包. 步骤: 1.新建一个文件夹setup(名字随便取),在setup文件夹下,再新建一个文件夹financeapi. 2.将上面4个py文件拷贝至financeapi文 ...

随机推荐

  1. MySQL数据库再回首

    前言: 数据库是程序员的数据源泉,加上近期 要开发DB可视化.性能分析的功能 重新回顾一下MySQL知识,以下是笔记: MySQL架构 MySQL基础理论 1.什么是关系型数据库? 关系型数据库,这个 ...

  2. js 批量提交数据

    // 批量提交数据 let pageSize = 100, total = dataTmp.length, list = dataTmp let totalPage = Math.ceil(total ...

  3. Linux getopt/getopts解析命令行参数教程

    一.说明 shell中获取参数可以直接使用$1.$2等形式来获取,但这种方式有明显的限制:每个参数的位置是固定的.比如如果在设计上$1是ip地址$2是端口,那在执行时就必须第一个参数是ip第二个参数是 ...

  4. sqlserver 数据库关于存储xml字段里内容的查找与替换

    1.传送门 :   http://www.cnblogs.com/GuoPeng/archive/2009/12/11/1621527.html 2.复制原帖的修改部分: 修改:@xml . modi ...

  5. JS-3

    运算符 数学运算符 + - * / %(取模运算符) js内置一个对象叫Math,Math提供了很多关于计算的方法,常见的 // 随机数 console.log(Math.random()); // ...

  6. bzoj2369

    题解: 显然把每一个环求出来 然后做一个lcm即可 代码: #include<cstdio> using namespace std; ],f[],n; int gcd(int x,int ...

  7. 201671010142 2017-2 《java第十一章学习感悟》

    事件处理基础 事件源,事件监听器,事件监听器  监听器接口的实现,监听器对象所属类必须实现与事件源相对应的接口,即必须提供接口中方法的实现. 适配器类 当程序用户试图关闭一个框架窗口时,Jframe对 ...

  8. servlet获取request数据的乱码解决

    例如请求中有: /score?type=Mana&name=${user.name} ***************************************************** ...

  9. sqoop碰到的问题

    sqoop碰到的问题 背景:从Oracle接入数据,一张表一千多万,数据量13G左右. 报错,表名找不到,将表名改成大写的 Exception in thread "main" j ...

  10. SpringMVC云题库错题及答案汇总

    试题分析:D,BeanNameViewResolver:这个视图解析器跟XmlViewResolver基本相同,它是通过把返回的逻辑视图名称去匹配定义好的视图bean对象 @ModelAttribut ...