bash脚本把A和B文件中有相同ID的B文件的内容输出到文件C.

Aid文件:
ID001.1
ID032.1
ID090.10

Bfilt文件:
XX XX XXX ID001.1 XXX
999999999999999999999999999999999999999
XX XX XXX ID055.1 XXX
6666666666666666666666666666666666666
XX XX XXX ID032.1 XXX
333333333333333333333333333333333333333

要得到Cnew文件:
XX XX XXX ID001.1 XXX
999999999999999999999999999999999999999
XX XX XXX ID032.1 XXX
333333333333333333333333333333333333333

awk 'NR==FNR{a[FNR]=$0} NR>FNR{for(i in a)if($0~a[i]){print;getline;print}}' Aid Bfilt >Cnew

这个十分慢;用 extractfastabyid 处理。

linux bash脚本把A和B文件中有相同ID的B文件的内容输出到文件C的更多相关文章

  1. shell编程学习笔记(七):Shell中将指定内容输出到文件中

    我们这里把echo要打印的内容输出到文件中 以下蓝色字体部分为Linux命令,红色字体的内容为输出的内容: # cd /opt/scripts # vim script06.sh 开始编写script ...

  2. 标准IO ——将A文件fpd第3个字节之后的内容复制到文件fps

    /* *使用标准IO ——将A文件fpd第3个字节之后的内容复制到文件fps 流程: 1.创建两个流,链接目标文件和源文件 2.输入流的基准点偏移四个单位然后输入缓冲区 3.输出流读取缓冲区数据送入文 ...

  3. 将windows控制台内容输出到文件中

    将windows控制台内容输出到文件中 dir>c:/file.txt 2>&1   对应的java  class   >c:/file.txt 2>&1   ...

  4. 【翻译自mos文章】对于每个文件的 file.id and file.incarnation number,重命名文件别名

    对于每个文件的 file.id and file.incarnation number,重命名文件别名 參考原文: Rename Alias of Datafile as Per file.id an ...

  5. Linux Bash脚本编程语言中的美学与哲学

    我承认,我再一次地当了标题党.但是不可否认,这一定是一篇精华随笔.在这一篇中,我将探讨Bash脚本语言中的美学与哲学. 这不是一篇Bash脚本编程的教程,但是却能让人更加深入地了解Bash脚本编程,更 ...

  6. linux过滤旧文件中的空行和注释行剩余内容组成新文件

    一.说明 在某些场景下我们想要将旧文件中空行和注释行过滤掉,将产生实际效果的行保留. 比如redis提供的配置示例文件中有很多用于说明的空行和注释行,我们想把产生实际效果的配置行筛选出来组成新的简洁的 ...

  7. Linux Bash 脚本:自己定义延迟代码块(裸数据保存方案)

    结合 alias 和 read 使用方法.能够保存一些将要延迟执行的脚本,或者裸数据(字符串不被扩展)到一个变量中.以备后用. $ alias BEGIN='read -d "" ...

  8. Linux bash脚本及常用命令--不断更新中

    1.如何在向alias命令传递参数: 这种用法的话就需要使用函数来配合使用. 如要cd到指定目录,并且ls当前目录下的文件可以使用:  alias cdls='cdls(){ cd $1; ls; } ...

  9. 一个java文件中有几个类,编译后有几个class文件?

    在一个源文件中用class关键字定义了几个类,编译的时候就会产生几个字节码文件

随机推荐

  1. oracle pl/sql的操作大全

    --删除该用户及下面的所有关联 DROP USER fspdrs CASCADE; --创建一个用户 create user fspdrs identified " default tabl ...

  2. Qt模拟C#的File类对文件进行操作

    其实只是QT菜鸟为了练习而搞出来的 文件头: #include <QFile> #include <QString> #include <iostream> #in ...

  3. PHPCMS 错误日志 Only variables should be passed by ...

    有几个网站是PHPCMS V9做的,但这两天发现一个问题,PHPCMS 的错误日志超过了20M ,后台报警,然后我看了下错误日志,其中两万多行都是一个错误,错误信息如下: 1 <?php exi ...

  4. DHT网络第一部分研究结果 加入长期在线的node

    源码:http://jijiea.com/upfile/DHT_Part1_How_To_Join_In_DHT.zip

  5. 1054. The Dominant Color (20)

    时间限制 100 ms 内存限制 65536 kB 代码长度限制 16000 B 判题程序 Standard 作者 CHEN, Yue Behind the scenes in the compute ...

  6. UVA 725

    Description   Write a program that finds and displays all pairs of 5-digit numbers that between them ...

  7. Flasback数据库(闪回数据库)

    数据库闪回原理: 一旦启用了闪回数据库,修改的块映像会不时从数据库缓冲区复制到闪回缓冲区.通过新的后台恢复写入器(Recovery Writer, RVWR)将此闪回缓冲区内容刷新到磁盘和闪回日志接着 ...

  8. VC++入门精通视频教程

    1.1.Windows程序运行原理-1 上传日期:2012-03-19 09:18:50  相关摘要:  - 在关闭一个windows窗口时,也关闭另一个吗 - 对纯面向对象的PHP程序有何看法? - ...

  9. MBProgressHUD ---

    1,MBProgressHUD常用属性和用法Demo - (void)testMBProgressHUD { NSLog(@"test MBProgressHUD "); /* 要 ...

  10. xcode设置 - App内存暴增

    当你发现你的项目中什么没有写,只是启动App内存就飙升到50M甚至60M以上,那么请你接着往下看吧,本文对你绝对非常有用! 1. Enable zombie object: 为了方便我们调试程序,我们 ...