bash脚本把A和B文件中有相同ID的B文件的内容输出到文件C.

Aid文件:
ID001.1
ID032.1
ID090.10

Bfilt文件:
XX XX XXX ID001.1 XXX
999999999999999999999999999999999999999
XX XX XXX ID055.1 XXX
6666666666666666666666666666666666666
XX XX XXX ID032.1 XXX
333333333333333333333333333333333333333

要得到Cnew文件:
XX XX XXX ID001.1 XXX
999999999999999999999999999999999999999
XX XX XXX ID032.1 XXX
333333333333333333333333333333333333333

awk 'NR==FNR{a[FNR]=$0} NR>FNR{for(i in a)if($0~a[i]){print;getline;print}}' Aid Bfilt >Cnew

这个十分慢;用 extractfastabyid 处理。

linux bash脚本把A和B文件中有相同ID的B文件的内容输出到文件C的更多相关文章

  1. shell编程学习笔记(七):Shell中将指定内容输出到文件中

    我们这里把echo要打印的内容输出到文件中 以下蓝色字体部分为Linux命令,红色字体的内容为输出的内容: # cd /opt/scripts # vim script06.sh 开始编写script ...

  2. 标准IO ——将A文件fpd第3个字节之后的内容复制到文件fps

    /* *使用标准IO ——将A文件fpd第3个字节之后的内容复制到文件fps 流程: 1.创建两个流,链接目标文件和源文件 2.输入流的基准点偏移四个单位然后输入缓冲区 3.输出流读取缓冲区数据送入文 ...

  3. 将windows控制台内容输出到文件中

    将windows控制台内容输出到文件中 dir>c:/file.txt 2>&1   对应的java  class   >c:/file.txt 2>&1   ...

  4. 【翻译自mos文章】对于每个文件的 file.id and file.incarnation number,重命名文件别名

    对于每个文件的 file.id and file.incarnation number,重命名文件别名 參考原文: Rename Alias of Datafile as Per file.id an ...

  5. Linux Bash脚本编程语言中的美学与哲学

    我承认,我再一次地当了标题党.但是不可否认,这一定是一篇精华随笔.在这一篇中,我将探讨Bash脚本语言中的美学与哲学. 这不是一篇Bash脚本编程的教程,但是却能让人更加深入地了解Bash脚本编程,更 ...

  6. linux过滤旧文件中的空行和注释行剩余内容组成新文件

    一.说明 在某些场景下我们想要将旧文件中空行和注释行过滤掉,将产生实际效果的行保留. 比如redis提供的配置示例文件中有很多用于说明的空行和注释行,我们想把产生实际效果的配置行筛选出来组成新的简洁的 ...

  7. Linux Bash 脚本:自己定义延迟代码块(裸数据保存方案)

    结合 alias 和 read 使用方法.能够保存一些将要延迟执行的脚本,或者裸数据(字符串不被扩展)到一个变量中.以备后用. $ alias BEGIN='read -d "" ...

  8. Linux bash脚本及常用命令--不断更新中

    1.如何在向alias命令传递参数: 这种用法的话就需要使用函数来配合使用. 如要cd到指定目录,并且ls当前目录下的文件可以使用:  alias cdls='cdls(){ cd $1; ls; } ...

  9. 一个java文件中有几个类,编译后有几个class文件?

    在一个源文件中用class关键字定义了几个类,编译的时候就会产生几个字节码文件

随机推荐

  1. SQL技巧之行列转换

    比如:id     姓名      状态  1      刘德华    12      刘德华    23      周华健    04      吴彦祖    1 在access中,用一条sql查询 ...

  2. SQL行列转换:报表_公司采购表_每个公司各采购了些什么产品

    有同学问了个比较典型行列转换的问题,想想,解答如下:数据库有一张表: 是个公司采购表,想转化成如下报表,显示每个公司各采购了些什么产品: 哪些公司采购哪些产品是不确定的,所以报表的列有哪几项是不确定的 ...

  3. python学习之js从0开始

    <html> <head> <title>js页面</title> <script src="js/old_boy.js"&g ...

  4. JS远程获取网页源代码的例子

    js代码获取网页源代码. 代码: <!DOCTYPE html PUBLIC "-//W3C//DTD HTML 4.01 Transitional//EN"> < ...

  5. Web开发——Http协议剖析

    Http,即超文本传输协议,是建立在TCP/IP协议的基础上.在Web开发的过程中,Http协议是十分重要的,浏览器与服务器之间的交互就是基于Http协议的.Http协议如果展开全面讲解会有很多内容, ...

  6. Describe the difference between repeater, bridge and router.

    中继器,路由器,网桥,网关的区别. 路由器:网络层设备,实现复杂的路径选择,控制IP包从源到目的地的路径:根据IP地址进行选路和转发IP数据包 中继器:物理层设备,物理信号的重新生成,对信号进行整形和 ...

  7. ubuntu中替代visio的软件 dia

    ubuntu 中 软件  dia 可以替代 ms-visio软件. 安装过程可以在线安装: sudo apt-get install dia

  8. fedora 20 PIL

    今天安装PIL花了我好多的时间. 刚开始,我手动下载PIL原码,编译安装. 启动我的django项目,报下面的错误,完全不懂是么意思. CommandError: One or more models ...

  9. SQL Server数据库备份(异机)

    简单的远程异机备份数据库功能,通过这个存储过程,讲远程其他机器上的数据库备份到本地.其主要原理为: 1.通过XP_CMDSHELL执行Windows命令,将本机的共享目录映射为远程机器的网络驱动器. ...

  10. POJ 2411 压缩状态DP

    这个题目非常赞! 给定一个矩形,要求用1*2 的格子进行覆盖,有多少种覆盖方法呢? dp[i][j] 当状态为j,且第i行已经完全铺满的情况下的种类数有多少种?j中1表示占了,0表示没有被占. 很显然 ...