bash脚本把A和B文件中有相同ID的B文件的内容输出到文件C.

Aid文件：
ID001.1
ID032.1
ID090.10

Bfilt文件：
XX XX XXX ID001.1 XXX
999999999999999999999999999999999999999
XX XX XXX ID055.1 XXX
6666666666666666666666666666666666666
XX XX XXX ID032.1 XXX
333333333333333333333333333333333333333

要得到Cnew文件：
XX XX XXX ID001.1 XXX
999999999999999999999999999999999999999
XX XX XXX ID032.1 XXX
333333333333333333333333333333333333333

awk 'NR==FNR{a[FNR]=$0} NR>FNR{for(i in a)if($0~a[i]){print;getline;print}}' Aid Bfilt >Cnew

这个十分慢；用 extractfastabyid 处理。

linux bash脚本把A和B文件中有相同ID的B文件的内容输出到文件C的更多相关文章

  1. shell编程学习笔记（七）：Shell中将指定内容输出到文件中

    我们这里把echo要打印的内容输出到文件中 以下蓝色字体部分为Linux命令,红色字体的内容为输出的内容: # cd /opt/scripts # vim script06.sh 开始编写script ...

  2. 标准IO ——将A文件fpd第3个字节之后的内容复制到文件fps

    /* *使用标准IO ——将A文件fpd第3个字节之后的内容复制到文件fps 流程: 1.创建两个流,链接目标文件和源文件 2.输入流的基准点偏移四个单位然后输入缓冲区 3.输出流读取缓冲区数据送入文 ...

  3. 将windows控制台内容输出到文件中

    将windows控制台内容输出到文件中 dir>c:/file.txt 2>&1   对应的java  class   >c:/file.txt 2>&1   ...

  4. 【翻译自mos文章】对于每个文件的 file.id and file.incarnation number，重命名文件别名

    对于每个文件的 file.id and file.incarnation number,重命名文件别名 參考原文: Rename Alias of Datafile as Per file.id an ...

  5. Linux Bash脚本编程语言中的美学与哲学

    我承认,我再一次地当了标题党.但是不可否认,这一定是一篇精华随笔.在这一篇中,我将探讨Bash脚本语言中的美学与哲学. 这不是一篇Bash脚本编程的教程,但是却能让人更加深入地了解Bash脚本编程,更 ...

  6. linux过滤旧文件中的空行和注释行剩余内容组成新文件

    一.说明 在某些场景下我们想要将旧文件中空行和注释行过滤掉,将产生实际效果的行保留. 比如redis提供的配置示例文件中有很多用于说明的空行和注释行,我们想把产生实际效果的配置行筛选出来组成新的简洁的 ...

  7. Linux Bash 脚本：自己定义延迟代码块（裸数据保存方案）

    结合 alias 和 read 使用方法.能够保存一些将要延迟执行的脚本,或者裸数据(字符串不被扩展)到一个变量中.以备后用. $ alias BEGIN='read -d "" ...

  8. Linux bash脚本及常用命令--不断更新中

    1.如何在向alias命令传递参数: 这种用法的话就需要使用函数来配合使用. 如要cd到指定目录,并且ls当前目录下的文件可以使用:  alias cdls='cdls(){ cd $1; ls; } ...

  9. 一个java文件中有几个类，编译后有几个class文件？

    在一个源文件中用class关键字定义了几个类,编译的时候就会产生几个字节码文件

随机推荐

  1. C#语言的Image和byte数组的互相转换

    /// <summary> /// 字节数组转换为图片 /// </summary> /// <param name="buffer">字节数组 ...

  2. Linux系统下ssh的相关配置详细解析

    Linux系统下ssh的相关配置进行了详细的分析介绍. ssh是大家常用的登录linux服务器的方式,但是为了安全考虑,有时候我们需要针对ssh做一些特殊处理,本文记录笔者曾经做过的一些修改,供大家参 ...

  3. Demo学习： Cookies Demo

    Cookies Demo 浏览器Cookies的读写,最常用的就是记录用户的登录信息,在项目里做登录界面时也用到了Cookies功能. procedure TMainForm.UniButton2Cl ...

  4. Oracle SGA参数调整

    一. SGA的组成: 自动 SGA 管理后,Oracle 可以自动为我们调整以下内存池的大小: shared pool buffer cache large pool java pool stream ...

  5. 1043. Is It a Binary Search Tree

    http://www.patest.cn/contests/pat-a-practise/1043 #include <stdio.h> #include <vector> u ...

  6. android 注销

    1.在个人中心退出系统MainActivity 2.清空保存的登录数据 3.打开登录LoginActivity 方法: SharedPreferencesManager.getInstance(mCo ...

  7. 1197: [HNOI2006]花仙子的魔法 - BZOJ

    Description Input 包含两个整数,并用一个空格隔开,第一个整数表示实施魔法的次数m,第二个整数表示空间的维数n.其中,1≤m≤100,1≤n≤15. Output 仅包含一个整数,表示 ...

  8. TIANKENG’s restaurant

    Problem B:http://codeforces.com/contest/616/problem/B B. Dinner with Emma 题意:一对夫妻要去餐厅吃晚饭,Emma 想去最豪华( ...

  9. SqlServer日志

    Sqlserver 2005日志查看.恢复工具 log exploer4.1 SqlServer2008 日志查看  系统函数 select * from fn_dblog(null,null) 参考 ...

  10. 一个只需要点 「下一步」就完成监控 Windows

    Cloud Insight 此前已然支持 Linux 操作系统,支持20多中数据库中间件等组件,多种操作,多种搭配,服务器监控玩的其乐无穷啊!但想想还有许多 Windows 的小伙伴没有体验过,所以在 ...