bash脚本把A和B文件中有相同ID的B文件的内容输出到文件C.

Aid文件:
ID001.1
ID032.1
ID090.10

Bfilt文件:
XX XX XXX ID001.1 XXX
999999999999999999999999999999999999999
XX XX XXX ID055.1 XXX
6666666666666666666666666666666666666
XX XX XXX ID032.1 XXX
333333333333333333333333333333333333333

要得到Cnew文件:
XX XX XXX ID001.1 XXX
999999999999999999999999999999999999999
XX XX XXX ID032.1 XXX
333333333333333333333333333333333333333

awk 'NR==FNR{a[FNR]=$0} NR>FNR{for(i in a)if($0~a[i]){print;getline;print}}' Aid Bfilt >Cnew

这个十分慢;用 extractfastabyid 处理。

linux bash脚本把A和B文件中有相同ID的B文件的内容输出到文件C的更多相关文章

  1. shell编程学习笔记(七):Shell中将指定内容输出到文件中

    我们这里把echo要打印的内容输出到文件中 以下蓝色字体部分为Linux命令,红色字体的内容为输出的内容: # cd /opt/scripts # vim script06.sh 开始编写script ...

  2. 标准IO ——将A文件fpd第3个字节之后的内容复制到文件fps

    /* *使用标准IO ——将A文件fpd第3个字节之后的内容复制到文件fps 流程: 1.创建两个流,链接目标文件和源文件 2.输入流的基准点偏移四个单位然后输入缓冲区 3.输出流读取缓冲区数据送入文 ...

  3. 将windows控制台内容输出到文件中

    将windows控制台内容输出到文件中 dir>c:/file.txt 2>&1   对应的java  class   >c:/file.txt 2>&1   ...

  4. 【翻译自mos文章】对于每个文件的 file.id and file.incarnation number,重命名文件别名

    对于每个文件的 file.id and file.incarnation number,重命名文件别名 參考原文: Rename Alias of Datafile as Per file.id an ...

  5. Linux Bash脚本编程语言中的美学与哲学

    我承认,我再一次地当了标题党.但是不可否认,这一定是一篇精华随笔.在这一篇中,我将探讨Bash脚本语言中的美学与哲学. 这不是一篇Bash脚本编程的教程,但是却能让人更加深入地了解Bash脚本编程,更 ...

  6. linux过滤旧文件中的空行和注释行剩余内容组成新文件

    一.说明 在某些场景下我们想要将旧文件中空行和注释行过滤掉,将产生实际效果的行保留. 比如redis提供的配置示例文件中有很多用于说明的空行和注释行,我们想把产生实际效果的配置行筛选出来组成新的简洁的 ...

  7. Linux Bash 脚本:自己定义延迟代码块(裸数据保存方案)

    结合 alias 和 read 使用方法.能够保存一些将要延迟执行的脚本,或者裸数据(字符串不被扩展)到一个变量中.以备后用. $ alias BEGIN='read -d "" ...

  8. Linux bash脚本及常用命令--不断更新中

    1.如何在向alias命令传递参数: 这种用法的话就需要使用函数来配合使用. 如要cd到指定目录,并且ls当前目录下的文件可以使用:  alias cdls='cdls(){ cd $1; ls; } ...

  9. 一个java文件中有几个类,编译后有几个class文件?

    在一个源文件中用class关键字定义了几个类,编译的时候就会产生几个字节码文件

随机推荐

  1. JavaScript null and undefined

    http://stackoverflow.com/questions/6429225/javascript-null-or-undefined var x; x == null // true x = ...

  2. Notepad++ 运行脚本快捷键设置

    php:cmd /k /path/to/php.exe "$(FULL_CURRENT_PATH)" & ECHO. & PAUSE & EXIT pyth ...

  3. centos架设FTP服务器

    1.安装vsftp在这里,我们架设的是虚拟用户,所谓虚拟用户就是没有使用真实的帐户,只是通过某种手段达到映射帐户和设置权限的目的.yum -y install vsftpd在CentOS中,这样就可以 ...

  4. Android图像处理1

    项目开发要用,在慕课中学习了一下关于Android图像处理的相关功能,并进行了整理. 在Android中,我们通过最基本的改变图像的RGBA值,改变图像的颜色与饱和度. Android中有ColorM ...

  5. Python 基础篇:介绍

    1. Python 发展 1989年,为了打发圣诞节假期,Guido开始写Python语言的编译器.Python这个名字,来自Guido所挚爱的电视剧Monty Python's Flying Cir ...

  6. Java学习之路:2、Mysql 链接与查询

    1.事实上我发现有了php的功力在里面,学习java起来还是不是很费劲,只是java就没有面向过程这一说 package second; import java.sql.*;//导入 public c ...

  7. WCF 傻瓜教程

    第一步,新建WCF服务应用程序 第二步,定义接口: 修改接口类,定义你要的方法接口默认文件名:IService1.cs 第三步,实现接口: 在svc文件里实现接口方法,默认文件名:Service1.s ...

  8. Cube and EarthDistance

    前言:项目中用到了postgreSQL中的earthdistance()函数功能计算地球上两点之间的距离,中文的资料太少了,我找到了一篇英文的.讲的很好的文章 ,特此翻译,希望能够帮助到以后用到ear ...

  9. 【IOS】分享下近一年IOS开发的经验总结

    从上个暑假末到现在,自己做IOS开发也快一年了.从一开始的什么都不知道,到现在大多事都能搭上一两手,期间经历了很多事情.下面来和大家分享一下心得和感触. 1.现在移动领域的知识更新的很快,无论是IOS ...

  10. iOS百度地图路径规划和POI检索详细总结-b

    路径规划.png 百度地图的使用 百度地图API的导入网上说了许多坑,不过我遇到的比较少,这里就放两个比较常见的吧.坑一: 奥联WIFI_xcodeproj.png 如上图所示,在infoplist里 ...