更新时间:2019.09.23

1. 序言

之前曾经用过一段时间的R(一直忍受着原生R那个超级“简洁”的界面),但是后来重装了系统并且学习了Python,就没有再怎么碰过R了。然而这两学期又开个R语言的课(统计狗一枚),只能再重新装一下。
这次有点不同的是,是想直接将R的内核嵌入到jupyter notebook中,用jupyter notebook来写R。为了方便起见,记录一些安装的过程,以便不时之需。

2. R的下载

其实,R的下载十分的简单,一种方法是直接进入R的官网-->选择download R-->选择China的镜像(像清华源)-->Download R for Windows(我的是windows系统)-->选择base版的直接下载就可以了

3. IDE---RStudio

从官网上下载下来的R界面极其“简洁”,除了jupyter notebook以外,我们也可以使用RStudio(从官网上下载,点击安装包,无脑点击下一步就可以了)。当然需要注意的是一定要先安装R,才能使用RStudio。

  • ps:从官网上下载RStudio的速度很慢,有时还下不了(毕竟是国外的网站),也试一下用conda来安装。

3. jupyter notebook中的R内核嵌入

将jupyter notebook中的R内核嵌入主要有两种方法,其中强烈建议anaconda的用户用第一种方法。
方法1:利用anaconda进行安装

  1. 安装R的命令:conda install -c r r-essentials,使用这个命令可以直接将R下载并嵌入jupyter notebook中,此外还能对R的各种包进行管理,可谓是一举多得。
  2. 安装RStudio的命令:conda install -c r rstudio
  3. 安装R的包:conda install -c r r-vcd,以安装vcd包为例
  4. 删除R的包:conda remove r-vcd,以删除vcd包为例
  5. 更新R的包:conda update r-vcd, 以更新vcd包为例

方法2:手动嵌入R的内核
主要是参考这篇文章:Jupyter Notebook/Lab中添加R Kernel的详细步骤,为了方便查看,把内容转载到下面:

  1. 打开R安装相关的包(没有选择镜像的需要选择),输入install.packages(c('repr', 'IRdisplay', 'evaluate', 'crayon', 'pbdZMQ', 'devtools', 'uuid', 'digest'))
  2. 安装 IRkernel包,输入devtools::install_github('IRkernel/IRkernel'),其中更新该包时也需要使用devtools::,而R中其他包使用update.packages()命令进行更新即可。
  3. 通过intallspec()函数,使Jupyter能找到刚刚安装的R核:
    • 可以直接安装在当前用户中:IRkernel::installspec()
    • 通过设置user=FALSE安装在系统中,建议使用第二种:IRkernel::installspec(user = FALSE)
  4. ps:值得注意的是,手动嵌入内核的时候,第三步可能会发生错误,其中一个原因是jupyter与R没有安装在同一个环境

R的安装的更多相关文章

  1. 如何将R包安装到自定义路径

    参考  设置环境变量R_LIBS将R包安装到自定义路径   实际上是可以解决问题的, #环境变量完成以后,启动(重启)R,运行 .libPaths() 加载R包时,发现路径仍然未变成自定义的. 那么参 ...

  2. R语言安装xlsx包,读入excel表格

    开学的时候,男神给了数据(.xlsx格式)让用R语言分析分析,作为编程小白,读了一天都没读近R,更别提如何分析了. 现在小伙伴们都喜欢读txt 和csv格式的,好多xlsx的表格读不进R,将xlsx格 ...

  3. R 语言安装

    在linux下,对于手动安装的软件,当时间长了,我们就会忘记安装这个软件的细节.这就不利于以后软件的卸载工作了.而yum则会帮我们记住相关安装细节,当软件被卸载的时候,没用的文件也会一并被删除.因此, ...

  4. linux ubuntu R 无法安装rggobi包的原因及解决方案

    错误信息 Package'libxml-2.0',requiredby'ggobi',notfound     错误原因 ggobi缺乏libxml依赖 解决方案 sudo apt install l ...

  5. linux-ubuntu 下R无法安装HH包的原因及解决方案

    错误信息: configure: error: GNU MP not found, or not 4.1.4 or up, see http://gmplib.org ERROR: configura ...

  6. R简易安装

    post={"title":"my Blog post","content":"Here's my blog post" ...

  7. 在linux中用同一个版本的R 同时安装 Seurat2 和 Seurat3

    在linux中用同一个版本的R 同时安装 Seurat 2 和 Seurat 3 Seurat  作为单细胞分析中的重量级R包,有多好用用,用过的人都知道.Seurat 分析流程基本涵盖了单细胞分析中 ...

  8. Linux下R环境安装

    R环境的两种安装方式,源码编译安装和yum在线安装 第一种:源码编译安装 1.首先,从官网上下载3.5.0版本 2.下载完后记得解压,我的习惯是解压在/usr/local下面 tar -zxvf R- ...

  9. R的安装以及包安装

        今天看论文,需要用到R语言的库,于是又折腾了半天..     其实并没有什么太大的问题,只是在第三方包的下载方面还有python中使用R方面遇到了问题: 第三方包的导入      其实在网上有 ...

随机推荐

  1. 【linux】【elasticsearch】解决docker pull error pulling image configuration: Get https://d2iks1dkcwqcbx.cloudfront.net/

    网络原因导致的问题: error pulling image configuration: Get https://d2iks1dkcwqcbx.cloudfront.net/docker/regis ...

  2. Mybatis源码解析,一步一步从浅入深(一):创建准备工程

    Spring SpringMVC Mybatis(简称ssm)是一个很流行的java web框架,而Mybatis作为ORM 持久层框架,因其灵活简单,深受青睐.而且现在的招聘职位中都要求应试者熟悉M ...

  3. 3分钟掌握GIt常用命令

    一.常用命令 git config [-l] 配置 git --help  帮助 git diff 文件  比较文件修改的内容 git add . 添加当前目录所有文件到暂存区 git add --u ...

  4. Promise核心原理解析

    作者: HerryLo 本文永久有效链接: https://github.com/AttemptWeb...... Promises对象被用于表示一个异步操作的最终完成 (或失败), 及其结果值.主要 ...

  5. Emacs 入门(https://www.zybuluo.com/eqyun/note/40788)

    下载地址 基本操作(C=Ctrl, M=Alt) C-f 向右移动一个字符 C-b 向左移动一个字符 C-n 移动到下一行 C-p 移动到上一行 M-f 向右移动一个词[对中文是移动到下一个标点符号] ...

  6. python-字符编码、字符串格式化、进制转化、数据类型、列表、元组、字典总结

    目录: 一.字符编码 二.字符串格式化 三.进制转换 四.数据类型及其操作 五.字符串转换 六.列表 七.元组 八.字典 一.字符编码: 计算机由美国人发明,最早的字符编码为ASCII,只规定了英文字 ...

  7. javaweb技术入门

    JavaWeb巩固和进阶 1.如何配置外部应用? 方法一: server.xml 在<Host>中添加如下配置 <Context path="/xxx" docB ...

  8. Angular 表单嵌套、动态表单

    说明: 组件使用了ng-zorro (https://ng.ant.design/docs/introduce/zh) 第一类:嵌套表单 1. 静态表单嵌套 demo.component.html & ...

  9. PHP 正则表达式的简单应用以 preg_match_all 抓取HTML元素为例 [转载]

    PHP 正则表达式的简单应用以 preg_match_all 抓取HTML元素为例 2011-12-02 17:09:39|  分类: PHP|举报|字号 订阅     下载LOFTER我的照片书   ...

  10. 一个企图用来进行前端交流的qq群

    我建了一个企图用来进行前端交流的qq群! 希望各位前端开发攻城狮们加入! 大佬.小白都欢迎! 禁广告党! 只是想有一个纯净的环境去讨论一下大家遇到的问题和行业前景之类的话题. 661270378 期待 ...