转录本(transcript)长度范围  到

--3216021----

3UTR                       stop_codon                      CDS3         |      |           CDS2       |      |           CDS1                       start_codon                     5UTR

|      |                           |      |

3214482------------------------------------------------------------3216968----3421702--3421901----3670552-----------------------------------------------------------3671498

exon3(3UTR,stop_codon, CDS3)                                    exon3(CDS2)                                      exon1(5UTR,stop_codon, CDS1)

解释 transcript、UTR、stop_codon、exon、CDS、start_codon关系

CDS,是编码一段蛋白产物的序列。cds必定是一个orf。但也可能包括很多orf。反之,每个orf不一定都是cds。
开放阅读框(ORF)是基因序列的一部分,有内含子的,且包含一段可以编码蛋白的碱基序列。由于拥有特殊的起始密码子和直到可以从该段碱基序列产生合适大小蛋白才出现的终止密码子,该段碱基序列编码一个蛋白。OEF排除内含子就是CDS

25、转录本(transcript)组成(gtf文件的第三列)的更多相关文章

  1. 【转】C语言文件操作解析(三)

    原文网址:http://www.cnblogs.com/dolphin0520/archive/2011/10/07/2200454.html C语言文件操作解析(三) 在前面已经讨论了文件打开操作, ...

  2. Django文件上传三种方式以及简单预览功能

    主要内容: 一.文件长传的三种方式 二.简单预览功能实现 一.form表单上传 1.页面代码 <!DOCTYPE html> <html lang="en"> ...

  3. matlab之导入txt文件并取其中一列数据

    1.我想导入下面这个文件的内容,并且获取这个文件中的两列数据. 2.首先确保Matlab当前所在文件夹为txt文件所在文件夹,然后命令行执行: X = load('2019_03_21_08_59_0 ...

  4. linux清空文件内容的三种方法

    linux系统中清空文件内容的三种方法 1.使用vi/vim命令打开文件后,输入"%d"清空,后保存即可.但当文件内容较大时,处理较慢,命令如下:vim file_name:%d: ...

  5. Ajax文件上传三式

    文件上传(三式) 1.urls.py文件 url(r'^upload.html$', views.upload), 2.views.py文件 import os def upload(request) ...

  6. 文件上传三:base64编码上传

    介绍三种上传方式: 文件上传一:伪刷新上传 文件上传二:FormData上传 文件上传三:base64编码上传 Flash的方式也玩过,现在不推荐用了. 优点: 1.浏览器可以马上展示图像,不需要先上 ...

  7. GTF文件

    一.GTF文件格式 Fields must be tab-separated. Also, all but the final field in each feature line must cont ...

  8. 第18月第25天 github下载单个文件夹 git命令

    1. 用 SVN 即可. 举例说明: 譬如这个项目: Mooophy/Cpp-Primer · GitHub, 我只想看 ch03 文件夹的代码怎么办? 先打开 ch03, 其 URL 为: &quo ...

  9. Shell系列(25)- 条件判断之文件权限

    按照文件权限进行判断 读.写.执行等选项权限,只要有,就返回真 不会按照所属者,所属用户组,其他用户进行区分 先判断文件是否存在,再去判断选项权限 测试选项 作用(标红熟记) -r 文件 判断该文件是 ...

随机推荐

  1. javascript箭头函数把函数给简写了[0403]

    箭头函数把函数给简写了[0403]        我不是很喜欢箭头函数,总觉得它让原本就不那么严谨的js更加不严谨了,所以有时候看js程序也是一件很头痛的事情,不过在ES6中加入了这么一个新的方法,已 ...

  2. Delphi 的进制转换

    1.10进制转16进制 intTohex(10,4);  //第一个参数为要转换的数据,第二个参数为要转换后的16进制位数:得到:000A; 2. 16进制转10进制 strToInt('$'+'64 ...

  3. redis配置参数的热修改

    Redis使用config命令,可以对配置项参数热修改,不必重启. Redis最好不要重启,重启一次会引发如下问题: 如果数据很多(例如几个G),读起来很慢: 重启风险很大,Redis有内存陷阱 重启 ...

  4. 《python基础教程(第二版)》学习笔记 语句/循环/条件(第5章)

    <python基础教程(第二版)>学习笔记 语句/循环/条件(第5章) print 'AB', 123 ==> AB 123 # 插入了一个空格print 'AB', 'CD' == ...

  5. 分治思想求解X的M次幂方

    package main import ( "fmt" ) //递归形式分治求解 func power(x, m int) int { { } else { y := power( ...

  6. 命令行 -- 命令"%cd%"

    1. @echo off echo 当前盘符:%~d0 echo 当前盘符和路径:%~dp0 echo 当前批处理全路径:%~f0 echo 当前盘符和路径的短文件名格式:%~sdp0 echo 当前 ...

  7. Codeforces 900D Unusual Sequences:记忆化搜索

    题目链接:http://codeforces.com/problemset/problem/900/D 题意: 给定x,y,问你有多少个数列a满足gcd(a[i]) = x 且 ∑(a[i]) = y ...

  8. java: jsp:param中文乱码

    java: jsp:param中文乱码 假如a.jsp/b.jsp文件中 a.jsp代码: 需要加入:request.setCharacterEncoding("UTF-8")  ...

  9. 分享知识-快乐自己:Java中各种集合特点

    Java中各种集合特点: Collection[单列集合]: List(有序,可重复): ArrayList: 底层数据结构是数组,查询快,增删慢.线程不安全,效率高. Vector: 底层数据结构是 ...

  10. cf 429B Working out(简单dp)

    B. Working out time limit per test 2 seconds memory limit per test 256 megabytes input standard inpu ...