转录本(transcript)长度范围  到

--3216021----

3UTR                       stop_codon                      CDS3         |      |           CDS2       |      |           CDS1                       start_codon                     5UTR

|      |                           |      |

3214482------------------------------------------------------------3216968----3421702--3421901----3670552-----------------------------------------------------------3671498

exon3(3UTR,stop_codon, CDS3)                                    exon3(CDS2)                                      exon1(5UTR,stop_codon, CDS1)

解释 transcript、UTR、stop_codon、exon、CDS、start_codon关系

CDS,是编码一段蛋白产物的序列。cds必定是一个orf。但也可能包括很多orf。反之,每个orf不一定都是cds。
开放阅读框(ORF)是基因序列的一部分,有内含子的,且包含一段可以编码蛋白的碱基序列。由于拥有特殊的起始密码子和直到可以从该段碱基序列产生合适大小蛋白才出现的终止密码子,该段碱基序列编码一个蛋白。OEF排除内含子就是CDS

25、转录本(transcript)组成(gtf文件的第三列)的更多相关文章

  1. 【转】C语言文件操作解析(三)

    原文网址:http://www.cnblogs.com/dolphin0520/archive/2011/10/07/2200454.html C语言文件操作解析(三) 在前面已经讨论了文件打开操作, ...

  2. Django文件上传三种方式以及简单预览功能

    主要内容: 一.文件长传的三种方式 二.简单预览功能实现 一.form表单上传 1.页面代码 <!DOCTYPE html> <html lang="en"> ...

  3. matlab之导入txt文件并取其中一列数据

    1.我想导入下面这个文件的内容,并且获取这个文件中的两列数据. 2.首先确保Matlab当前所在文件夹为txt文件所在文件夹,然后命令行执行: X = load('2019_03_21_08_59_0 ...

  4. linux清空文件内容的三种方法

    linux系统中清空文件内容的三种方法 1.使用vi/vim命令打开文件后,输入"%d"清空,后保存即可.但当文件内容较大时,处理较慢,命令如下:vim file_name:%d: ...

  5. Ajax文件上传三式

    文件上传(三式) 1.urls.py文件 url(r'^upload.html$', views.upload), 2.views.py文件 import os def upload(request) ...

  6. 文件上传三:base64编码上传

    介绍三种上传方式: 文件上传一:伪刷新上传 文件上传二:FormData上传 文件上传三:base64编码上传 Flash的方式也玩过,现在不推荐用了. 优点: 1.浏览器可以马上展示图像,不需要先上 ...

  7. GTF文件

    一.GTF文件格式 Fields must be tab-separated. Also, all but the final field in each feature line must cont ...

  8. 第18月第25天 github下载单个文件夹 git命令

    1. 用 SVN 即可. 举例说明: 譬如这个项目: Mooophy/Cpp-Primer · GitHub, 我只想看 ch03 文件夹的代码怎么办? 先打开 ch03, 其 URL 为: &quo ...

  9. Shell系列(25)- 条件判断之文件权限

    按照文件权限进行判断 读.写.执行等选项权限,只要有,就返回真 不会按照所属者,所属用户组,其他用户进行区分 先判断文件是否存在,再去判断选项权限 测试选项 作用(标红熟记) -r 文件 判断该文件是 ...

随机推荐

  1. Data Structure Linked List: Write a function to reverse a linked list

    iterative太简单不写了 http://www.geeksforgeeks.org/write-a-function-to-reverse-the-nodes-of-a-linked-list/ ...

  2. NCL windows系统安装

    http://www.doc88.com/p-192266283281.html NCL在Linux下的安装非常容易,只需下载适当版本的文件,设置好环境变量即可使用.NCL在Windows下的安装则要 ...

  3. Spark Structured Streaming框架(5)之进程管理

    Structured Streaming提供一些API来管理Streaming对象.用户可以通过这些API来手动管理已经启动的Streaming,保证在系统中的Streaming有序执行. 1. St ...

  4. grep egrep

    grep: Global search REgular expression and Print out the line. 作用: 文本搜索工具,根据用户指定的“模式”对目标文本逐行进行匹配检查:打 ...

  5. java深入探究05

    通讯录小程序 需求说明: 功能: 添加联系人 修改联系人 删除联系人 查询所有联系人 要求: console控制 数据保存在xml 1.创建联系人类 /** * 联系人实体对象 * @author A ...

  6. Provider org.apache.xerces.jaxp.DocumentBuilderFactoryImpl not found 问题排查

    自定义的classLoader启动spring容器,遇到 Provider org.apache.xerces.jaxp.DocumentBuilderFactoryImpl not subtype ...

  7. java打包命令

    (1)首先,必须保证java的所有路径都设置好,在dos提示符下输入jar -help 出现C:\Documents and Settings\dly>jar -help 非法选项:h 用法:j ...

  8. KISSY(JS)炫动导航,缓动应用实例(^_^)

    一个基于KISSY的简单的动画导航,效果还不错,有点像flash的效果.鼠标移到每一个连接上,背景滑块会迅速移到该链接下方,同时平滑改变大小,自适应链接尺寸,并伴随来回的轻微波动,动感相当不错,呵呵, ...

  9. ASP.WEB Form 几点知识

    1.GridView 行的多选 <asp:TemplateField ControlStyle-Width="30" HeaderText="选择" &g ...

  10. Python基础-MD5加密

    import hashlibm = hashlib.md5()#构造一个md5 m.update(b"Hello")#加密前必须转化成二进制字节类型print(m.hexdiges ...