我生信入门,老师就要求我学好blast比对,说得也确实是很有道理,是个人都知道比对是最基本的东西,现在再想想那老师的建议,也只能呵呵一笑。

北大生物信息公开课有一章专门讲得序列数据库搜索,可以好好看看,快速入门。

序列数据库搜索

BLAST算法

Basic Local Alignment Search Tool

BLAST使用

BLAST - 序列数据库搜索的更多相关文章

  1. 序列联配(alignment)和数据库搜索方法简介

    根据一个打分系统,怎么样排对起来打分能够最大.就认为历史上应该是这样子的. 数据同源搜索软件Fasta和Blast 是目前功能最全,使用最广的同源性数据库搜索软件包.他们在Needleman的动态算法 ...

  2. 时序列数据库武斗大会之什么是 TSDB ?

    本文选自 OneAPM Cloud Insight 高级工程师刘斌博客 . 刘斌,一个才思敏捷的程序员,<第一本 Docker 书>.<GitHub 入门与实践>等书籍译者,D ...

  3. [转]时序列数据库武斗大会之什么是TSDB

    由于工作上的关系,最近看了一些关于时序列数据库的东西,当然,我所看的也都是以开源方案为主. 趁着这股热劲还没退,希望能整理一些资料出来.如果正好你也有这方面的需求,那么希望这一系列的介绍能够帮助到你. ...

  4. Uncovering thousands of new peptides with sequence-mask-search hybrid de novo peptide sequencing framework (使用序列掩码搜索结合肽段从头测序框架发现了数千个新肽段)-解读人:刘佳维

    期刊名:Molecular & Cellular Proteomics 发表时间:(2019年12月) IF:4.828 单位: 朱拉隆功大学 费城威斯塔研究所 物种:人 技术:de novo ...

  5. 时序列数据库武斗大会之 OpenTSDB 篇

    [编者按] 刘斌,OneAPM后端研发工程师,拥有10多年编程经验,参与过大型金融.通信以及Android手机操作系的开发,熟悉Linux及后台开发技术.曾参与翻译过<第一本Docker书> ...

  6. 时序列数据库武斗大会之TSDB名录 Part 2

    [编者按] 刘斌,OneAPM后端研发工程师,拥有10多年编程经验,参与过大型金融.通信以及Android手机操作系的开发,熟悉Linux及后台开发技术.曾参与翻译过<第一本Docker书> ...

  7. 时序列数据库武斗大会之 TSDB 名录 Part 1

    [编者按] 刘斌,OneAPM后端研发工程师,拥有10多年编程经验,参与过大型金融.通信以及Android手机操作系的开发,熟悉Linux及后台开发技术.曾参与翻译过<第一本Docker书> ...

  8. LeetCode 81. Search in Rotated Sorted Array II(在旋转有序序列中搜索之二)

    Follow up for "Search in Rotated Sorted Array":What if duplicates are allowed? Would this ...

  9. LeetCode 33. Search in Rotated Sorted Array(在旋转有序序列中搜索)

    Suppose an array sorted in ascending order is rotated at some pivot unknown to you beforehand. (i.e. ...

随机推荐

  1. Android onMeasure方法介绍

    onMeasure方法在控件的父元素正要放置它的子控件时调用.它会问一个问题,“你想要用多大地方啊?”,然后传入两个参数——widthMeasureSpec和heightMeasureSpec. 它们 ...

  2. 制作图表二、使用图片工厂设置RGB改变图标颜色

    亮绿 RGB:76 175 80灰色 RGB:151 151 153

  3. kafka 安装

    kafka是一个分布式的消息缓存系统 kafka集群中的服务器都叫做broker kafka有两类客户端,一类叫producer(消息生产者),一类叫做consumer(消息消费者),客户端和brok ...

  4. RDIFramework.NET ━ 9.2 员工管理 ━ Web部分

    RDIFramework.NET ━ .NET快速信息化系统开发框架 9.2  员工管理 -Web部分 员工(职员)管理主要是对集团.企事业内部员工进行管理.在后面的章节可以看到有一个用户管理,这两者 ...

  5. spring MVC配置详解

    现在主流的Web MVC框架除了Struts这个主力 外,其次就是Spring MVC了,因此这也是作为一名程序员需要掌握的主流框架,框架选择多了,应对多变的需求和业务时,可实行的方案自然就多了.不过 ...

  6. Tomcat8启动报there was insufficient free space available after evicting expired cache entries - consider increasing the maximum size of the cache

    09-Dec-2016 10:57:49.150 WARNING [localhost-startStop-1] org.apache.catalina.webresources.Cache.getR ...

  7. erlang httpc

    1,set proxy 10.100.1.76 :8888 httpc:set_options([{proxy,{{"10.100.1.76",8888},[]}}]). 2,se ...

  8. Redis缓存之Set使用

    在Redis中,我们可以将Set类型看作为没有排序的字符集合,和List类型一样,我们也可以在该类型的数据值上执行添加.删除或判断某一元素是否存在等操作.需要说明的是,这些操作的时间复杂度为O(1), ...

  9. PHP的serialize序列化数据与JSON格式化数据

    serialize序列化 我们在一些老的WEB系统中可能会看到在数据库或在文本文件中存储着一大串貌似有着特殊含义的字符串文本内容.我们仔细看会发现它具有数据类型和结构等信息,但是它并不容易人工阅读,它 ...

  10. 。。。在学习新框架Spring MVC的感受。。。

    已经学习一遍Spring MVC了,感觉还是懵懵懂懂的,特别是重定向,路径,参数的这些问题,心好乱,不过,这,都不是问题!!! 继续努力,努力到会为止!!!加油!!!