Motif discovery is in loose terms the problem of finding interesting patterns in sequences.

motif: interest patterns/ subsequences in sequences.

two ways:

1. operate directly on sequences of real numbers,

2. operate on sequences of symbols.

time series ======> SAX

Motif的更多相关文章

  1. homer进行motif分析 ChIP-seq

    http://homer.salk.edu/homer/ [怪毛匠子-整理] 使用HOMER分析CLIP-SEQ数据 24 5 2月 2013   | 程序员 Tags: 生物信息学 · 软件 HOM ...

  2. ChIP-seq motif ROC 相关资料

    [怪毛匠子]独家整理 不可以转载 MEME工具 http://meme-suite.org DNA motif 搜索算法总结 http://www.bbioo.com/lifesciences/40- ...

  3. DNA binding motif比对算法

    DNA binding motif比对算法 2012-08-31 ~ ADMIN 之前介绍了序列比对的一些算法.本节主要讲述motif(有人翻译成结构模式,但本文一律使用基模)的比对算法. 那么什么是 ...

  4. DNA motif 搜索算法总结

    DNA motif 搜索算法总结 2011-09-15 ~ ADMIN 翻译自:A survey of DNA motif finding algorithms, Modan K Das et. al ...

  5. 16 Finding a Protein Motif

    Problem To allow for the presence of its varying forms, a protein motif is represented by a shorthan ...

  6. 14 Finding a Shared Motif

    Problem A common substring of a collection of strings is a substring of every member of the collecti ...

  7. 09 Finding a Motif in DNA

    Problem Given two strings ss and tt, tt is a substring of ss if tt is contained as a contiguous coll ...

  8. 根据motif binding来确定target gene | HOMER | FIMO | MEME

    主流的motif数据库 JASPAR dbcorrdb - SCENIC使用的 TRANSFAC® 7.0 Public 2005 and TRANSCompel 7.0 Public 2005 - ...

  9. 化学键|甘氨酸|谷氨酸|半胱胺酸|motif|domain|疏水相互作用|序列相似性|clustering analysis|Chou and Fasman|GOR|PHD|穿线法|first-principle ab initio folding|

    化学键|甘氨酸|谷氨酸|半胱胺酸|motif|domain|疏水相互作用|序列相似性|clustering analysis|Chou and Fasman|GOR|PHD|穿线法|first-pri ...

随机推荐

  1. 00 - PXE | 环境准备

    00 - PXE | 环境准备 TFTP PXE 1. TFTP服务搭建 安装环境Centos7.3 1.1 安装 # yum install xinetd # yum install tftp # ...

  2. The ADB binary found at ... 虚拟机运行错误

    虚拟机问题,可以说差点扼杀我开发 APP 的乐趣,哼,最后请教了一下辉哥(学长),终于解决 —— 用真机调试.下面是步骤: 首先,检查一下真机连接需要的 SDK 是否安装,未安装,勾选进行安装 接着用 ...

  3. Android_Service的一些零散知识点_1

    service与线程不甚相同,service是Android提供的可供一个允许常驻后台的组件. 可通过StartService()启动Service和BindService()启动Service St ...

  4. LVS负载均衡工作模式和调度算法

    原文链接:https://blog.csdn.net/weixin_40470303/article/details/80541639 一.LVS简介 LVS(Linux Virtual Server ...

  5. mysql 零基础 开始过程

    2016-11-07 算是差不多是两个月的学习,我也马上要结课了.今天才勉强把mysql装上,之前还有因为用户权限的问题,以及用户为创建的问题.应该早点就把该准备的开发平台准备好,而不是在最后快考试了 ...

  6. Python Django文件上传

    文件保存本地 view视图 def update(request): if request.method =='GET': return render(request,'update.html') e ...

  7. 替换 MyEclipse 中已有的项目

    一.删除 tomcat 中的项目 1.停止 tomcat 2.删除 tomcat 中的项目 选中项目,然后右键 - Remove deployment,这个可能需要一点时间 二.删除 MyEclips ...

  8. 使用Beautiful Soup爬取猫眼TOP100的电影信息

    使用Beautiful Soup爬取猫眼TOP100的电影信息,将排名.图片.电影名称.演员.时间.评分等信息,提取的结果以文件形式保存下来. import time import json impo ...

  9. Subway POJ - 2502 spfa

    #include<cstdio> #include<cmath> #include<cstring> #include<cstring> #includ ...

  10. @HystrixCommand 不能被导包

    添加pom文件 <dependency>  <groupId>com.netflix.hystrix</groupId>  <artifactId>hy ...