洛谷P1140 相似基因【线性dp】
题目:https://www.luogu.org/problemnew/show/P1140
题意:
给定两串基因串(只包含ATCG),在其中插入任意个‘-’使得他们匹配。(所以一共是5种字符)
这5种字符两两之间有一个匹配数值,要求使这两个字符串的匹配值之和最大。
思路:
dp[i][j]表示匹配了s1中前i个字符和s2中前j个字符的最大匹配值。
完成s1[i]与s2[j]的匹配只有三种可能。
1.s1[i]之前已经匹配好,s2[j]配‘-’。即dp[i][j] = dp[i][j-1]+sco[s2[j]]['-']
2.s2[j]之前已经匹配好,s1[i]配‘-’。即d[i][j] = dp[i-1][j]+sco[s1[i]]['-']
3.s1[i]配s2[j]。即dp[i][j] = dp[i - 1][j - 1] + sco[s1[i]][s2[j]]
#include<cstdio>
#include<cstdlib>
#include<map>
#include<set>
#include<cstring>
#include<algorithm>
#include<vector>
#include<cmath>
#include<stack>
#include<queue>
#include<iostream> #define inf 0x7fffffff
using namespace std;
typedef long long LL;
typedef pair<string, string> pr; const int sco[][] =
{
{, -, -, -, -},
{-, , -, -, -},
{-, -, , -, -},
{-, -, -, , -},
{-, -, -, -, },
};
const int maxn = ;
int len1, len2;
char s1[maxn], s2[maxn];
int dp[maxn][maxn]; int main()
{
scanf("%d %s", &len1, s1 + );
scanf("%d %s", &len2, s2 + );
map<char, int>mp;
mp['A'] = ;mp['C'] = ;mp['G'] = ; mp['T'] = ;
for(int i = ; i <= len1; i++){
for(int j = ; j <= len2; j++){
dp[i][j] = -2e8;
}
} dp[][] = ;
for(int i = ; i <= len1; i++){
dp[i][] = dp[i - ][] + sco[mp[s1[i]]][];
}
for(int i = ; i <= len2; i++){
dp[][i] = dp[][i - ] + sco[mp[s2[i]]][];
}
for(int i = ; i <= len1; i++){
for(int j = ; j <= len2; j++){
dp[i][j] = max(dp[i][j], dp[i][j - ] + sco[mp[s2[j]]][]);
dp[i][j] = max(dp[i][j], dp[i - ][j] + sco[mp[s1[i]]][]);
dp[i][j] = max(dp[i][j], dp[i - ][j - ] + sco[mp[s1[i]]][mp[s2[j]]]);
}
}
printf("%d\n", dp[len1][len2]);
return ;
}
洛谷P1140 相似基因【线性dp】的更多相关文章
- 洛谷 P1140 相似基因 ( 线性DP || 类LCS )
题意 : 题目链接 分析 : 可以观察到给出的配对代价表中对角线部分是正数 其余的都是负数,也就是说让相同字母的匹配的越多越好 即找出 LCS 但是这里 DP 的过程需要记录一下代价 有关 LCS ...
- 洛谷P1140 相似基因 (DP)
洛谷P1140 相似基因 题目背景 大家都知道,基因可以看作一个碱基对序列.它包含了44种核苷酸,简记作A,C,G,TA,C,G,T.生物学家正致力于寻找人类基因的功能,以利用于诊断疾病和发明药物. ...
- 洛谷P1140 相似基因(线性DP)
题目背景 大家都知道,基因可以看作一个碱基对序列.它包含了444种核苷酸,简记作A,C,G,TA,C,G,TA,C,G,T.生物学家正致力于寻找人类基因的功能,以利用于诊断疾病和发明药物. 在一个人类 ...
- 2018.08.16 洛谷P2029 跳舞(线性dp)
传送门 简单的线性dp" role="presentation" style="position: relative;">dpdp. 直接推一推 ...
- 洛谷 P1140 相似基因(DP)
传送门 https://www.cnblogs.com/violet-acmer/p/9852294.html 参考资料: [1]:https://www.cnblogs.com/real-l/p/9 ...
- 2018.11.04 洛谷P2679 子串(线性dp)
传送门 为什么前几年的noipnoipnoip总是出这种送分题啊? 这个直接线性dpdpdp不就完了吗? f[i][j][k][0/1]f[i][j][k][0/1]f[i][j][k][0/1]表示 ...
- 洛谷P1140 相似基因
题目:https://www.luogu.org/problemnew/show/P1140 分析: 本题一看就知道是一道动归,其实和字串距离非常的像,只不过多了题目规定的匹配相似度罢了. 匹配的相似 ...
- 洛谷 P1140 相似基因 题解
每日一题 day23 打卡 Analysis dp[i][j]表示序列A中前i个与序列B中前j个匹配的相似度最大值 所以,dp方程很容易想到: 1.让a[i]与b[j]匹配 2.让a[i]与B序列中一 ...
- 洛谷P1052 过河【线性dp】【离散化】
题目:https://www.luogu.org/problemnew/show/P1052 题意: 青蛙要从0跳到超过$l$的地方,每一次可以跳$s$到$t$之间的任意数. 在河中有m个石头,要求在 ...
随机推荐
- *#【Python】【基础知识】【模块】【datetime】【使用datetime模块 】
datetime模块 的介绍: 用于调取时间.日期 datetime包含的 方法: >>> dir(datetime) ['MAXYEAR', 'MINYEAR', '__built ...
- SQL中的关键词
AS的用法及妙用 https://www.cnblogs.com/zhaotiancheng/p/6692553.html
- vue中可以自定义动画的前缀
vue中可以自定义动画的前缀1.只需在中加入name属性即可 <transition name="my"> <h6 v-if="flag2"& ...
- 三种SpringSecurity方法级别权限控制
一 JSR-250注解 1.在pom.xml添加 <dependency> <groupId>javax.annotation</groupId> <arti ...
- hdu 6319 逆序建单调队列
题目传送门//res tp hdu 维护递增单调队列 根据数据范围推测应为O(n)的. 我们需要维护一个区间的信息,区间内信息是"有序"的,同时需要在O(1)的时间进行相邻区间的信 ...
- 【静态延迟加载】self关键字和static关键字的区别
先来看下代码,从代码中发现问题.解决问题 //先实现一个手机工厂类 class Phone{ public static function setBrand(){ echo "Main Ph ...
- Oracle 表分区介绍与使用
什么是表分区 分区表是将大表的数据分成称为分区的许多小的子集,类型有FAT32,NTFST32,NTFS.另外,分区表的种类划分主要有:range,list,和hash分区.划分依据主要是根据其表内部 ...
- javaIO——CharArrayReader & CharArrayWriter
上一篇学习了StringReader和StringWriter,CharArrayReader和CharArrayWriter的实现跟他们很像,拥有的方法也基本一样.区别只是,后者两个的数据操作目标是 ...
- requests模块高级操作之proxies
一.代理proxy 概念:代理服务器 作用:请求和响应的转发 免费代理 www.goubanjia.com 快代理 西祠代理 代理精灵(付费) 匿名度: 透明:对方服务器知道你使用代理也知道你真实ip ...
- Nginx如何配置基础缓存
// /path/to/cache/:用于缓存的本地磁盘目录 // levels :在 /path/to/cache/ 设置了一个两级层次结构的目录. // 将大量的文件放置在单个目录中会导致文件访问 ...