大致题意: 给出n个长度为60的DNA基因(A腺嘌呤 G鸟嘌呤 T胸腺嘧啶 C胞嘧啶)序列,求出他们的最长公共子序列 使用后缀数组解决 #include<stdio.h> #include<string.h> ],res[]; ],loc[]; ],rank[],height[]; ],wb[],wv[],wd[]; ]; int seq_num; int cmp(int *r,int a,int b,int l){ return r[a]==r[b]&&r[a+l…

链接: http://poj.org/problem?id=3080 http://acm.hust.edu.cn/vjudge/contest/view.action?cid=88230#problem/E (密码0817) Blue Jeans Time Limit: 1000MS   Memory Limit: 65536K Total Submissions: 14544   Accepted: 6478 Description The Genographic Project is a…

多个字符串的相关问题 这类问题的一个常用做法是,先将所有的字符串连接起来, 然后求后缀数组 和 height 数组,再利用 height 数组进行求解. 这中间可能需要二分答案. POJ - 3294 题意: 给出n个串,求至少出现在n/2+1个串中的最长公共子串 题解: (摘自罗穗骞的国家集训队论文): 将 n 个字符串连起来,中间用不相同的且没有出现在字符串中的字符隔开, 求后缀数组. 然后二分答案,用和LCP将后缀分成若干组,判断每组的后缀是否出现在不小于 k 个的原串中. 这个做法的时间…

题目链接:http://poj.org/problem?id=3080 题意:给定n个DNA串,求最长公共子串.如果最长公共子串的长度小于3时输出no significant commonalities,否则输出该子串,如有多解请输出字典序最小的解 思路:是POJ 3405的弱化版.思路请参考 #define _CRT_SECURE_NO_DEPRECATE #include<iostream> #include<cstdio> #include<cstring> #i…

DNA序列 题目大意:给你m串字符串,要你找最长的相同的连续字串 这题暴力kmp即可,注意要按字典序排序,同时,是len<3才输出no significant commonalities #include <iostream> #include <functional> #include <algorithm> #include <string.h> #define MAX 60 using namespace std; typedef char* _…

题目大意:有M个串,每个串的长度都是60,查找这M个串的最长公共子串(连续的),长度不能小于3,如果同等长度的有多个输出字典序最小的那个.   分析:因为串不多,而且比较短,所致直接暴力枚举的第一个串的所有子串,比较暴力的做法,如果串的长度大一些就没法玩了. 代码如下: ====================================================================================   #include<stdio.h> #include…

Description The Genographic Project is a research partnership between IBM and The National Geographic Society that is analyzing DNA from hundreds of thousands of contributors to map how the Earth was populated. As an IBM researcher, you have been tas…

Maximum repetition substring Time Limit: 1000MS   Memory Limit: 65536K Total Submissions: 8669   Accepted: 2637 Description The repetition number of a string is defined as the maximum number R such that the string can be partitioned into R same conse…

题目链接:http://poj.org/problem?id=3415 题意:给定2个串[A串和B串],求两个串公共子串长度大于等于k的个数. 思路:首先是两个字符串的问题.所以想用一个'#'把两个字符串拼接起来.求后缀数组. 然后按照k把height数组分组.大于等于k的为一组,然后就是统计每组的贡献.对于每一组的贡献即是组内所有A串的后缀和B串的后缀的lcp值,即为val.那么val对于答案的贡献为(val-k+1).如果我们暴力每组的AB串后缀的组合.时间复杂度是O(n^2).不能满足要求…

题目链接:http://poj.org/problem?id=3450 题意:给定n个字符串,求n个字符串的最长公共子串,无解输出IDENTITY LOST,否则最长的公共子串.有多组解时输出字典序最小的解 思路:后缀数组的解法,我们把n个串都链接起来,中间用一些互不相同的且都没在原串中出现过的字符来分割开.然后求后缀数组.由于求的是最长公共子串,所以我们可以二分长度x,于是问题就转变成了是否有一个长度为x的子串在n个字符串中都出现过.判断的方式是:以height数组进行分组,height值不小…