WGS和WES测序和分析会产生大量的variant数据. 显然直接分析全部的variant是非常不靠谱的. 做疾病的话,有一些常用的过滤套路. variant作用于基因表达主要分两大类: 1. coding,可以直接影响RNA的形成,以及后面蛋白的折叠组装: 2. non-coding,现在最流行的就是enhancer这个媒介,已经有比较好的结果了. 过滤的必要性 首先GWAS已经做了,要理解GWAS产生了哪些结果,GWAS的局限性在哪? Our previous meta-analysis o…

转:http://www.cnblogs.com/lifepoem/archive/2011/11/16/2250676.html 在本系列博客前面的篇章中,已经对LINQ的作用.C# 3.0为LINQ提供的新特性,还有几种典型的LINQ技术:LINQ to Objects.LINQ to SQL.Entity Framework进行了比较详细的介绍,至此,我们应该了解了各种LINQ技术之间的联系和区别.千里之行始于足下,这些基础理论是理解和使用LINQ 的关键.但是我们在前面的文章中对于LIN…

在本系列博客前面的篇章中,已经对LINQ的作用.C# 3.0为LINQ提供的新特性,还有几种典型的LINQ技术:LINQ to Objects.LINQ to SQL.Entity Framework进行了比较详细的介绍,至此,我们应该了解了各种LINQ技术之间的联系和区别.千里之行始于足下,这些基础理论是理解和使用LINQ的关键.但是我们在前面的文章中对于LINQ查询运算符(LINQ Operators)并没有完整的介绍,这就是接下来这几篇博客中所要做的工作.大家可以按顺序依次对各个LINQ…

variant主要分为两类: coding noncoding 这两大类的分析方法截然不同,coding主要直接影响了mRNA和蛋白:而noncoding,主要是影响调控. coding编码区如何分析? 通常有很多pipeline来预测WGS等得到的SNP的功能,如annovar等数据库. protein binding domain 综述: Mapping genetic variations to three-dimensional protein structures to enhance…

maven用可以利用如下配置进行资源过滤,pom.xml的配置如下: <build> <!-- 主资源目录 --> <resources> <resource> <!-- 设定主资源目录  --> <directory>src/main/resources</directory> <!-- maven default生命周期,process-resources阶段执行maven-resources-plugin插件的…

因为接下来的功能中需要使用到登陆功能,所以我们使用django内置admin站点并创建一个管理员. python manage.py createsuperuser 创建管理员以后,访问admin站点,先修改站点的语言配置 settings.py 访问admin 站点效果: 一. 认证Authentication 可以在配置文件中配置全局默认的认证方案 REST_FRAMEWORK = { 'DEFAULT_AUTHENTICATION_CLASSES': ( 'rest_framework.a…

认证Authentication 准备工作:(需要结合权限用) 1. 需要使用到登陆功能,所以我们使用django内置admin站点并创建一个管理员. python manage.py createsuperuser 2. 配置  settings.py 1.站点语言配置: # LANGUAGE_CODE = 'en-us' LANGUAGE_CODE = 'zh-hans' # 配置中文 开始认证Authentication 配置文件: (1)可以在配置文件中配置全局默认的认证方案: REST…

1. 认证Authentication 在配置文件中配置全局默认的认证方案 REST_FRAMEWORK = { 'DEFAULT_AUTHENTICATION_CLASSES': ( 'rest_framework.authentication.BasicAuthentication', # 基本认证 'rest_framework.authentication.SessionAuthentication', # session认证 ) } 也可以在每个视图中通过设置authenticatio…

4. 过滤Filtering 对于列表数据可能需要根据字段进行过滤,我们可以通过添加django-fitlter扩展来增强支持. pip install django-filter 在配置文件setting.py中增加过滤后端的设置: INSTALLED_APPS = [ ... 'django_filters', # 需要注册应用, ] ​ REST_FRAMEWORK = { ... 'DEFAULT_FILTER_BACKENDS': ('django_filters.rest_frame…

认证Authentication 可以在配置文件中配置全局默认的认证方案 REST_FRAMEWORK = { 'DEFAULT_AUTHENTICATION_CLASSES': ( 'rest_framework.authentication.BasicAuthentication', # 基本认证 'rest_framework.authentication.SessionAuthentication', # session认证 ) } 也可以在每个视图中通过设置authentication…