摘要:如果不设置任何过滤标准的话,SOAPsnp会call出更多的SNVs:AtlasSNP2算法比较严格,因此call出来的SNVs数量是最少的,GATK 和 SAMtools call出来的数量位于SOAPsnp 和 Atlas-SNP2之间:四种calling算法的整体一致性是很低的,尤其在non-dbSNPs数据库中:GATK 和 Atlas-SNP2有较高的阳性call率和灵敏性,GATK call出来的SNVs数量比较多. 1.dbSNP数据库和non-dbSNPs在用四种不同软件c…

在代码维护中遇到过这种问题,CPU訪问了corePac的外部内存空间0x75510C55地址,即CPU向corePac的L2内存控制器发起了对该内存的訪问,然后L2内存控制器将该请求发给corePac的XMC模块,XMC模块依据配置好的寄存器(即32bit虚拟地址到36位物理地址的映射与内存权限寄存器,每一个大小为16M的内存段用一个寄存器设置,每一个CPU均有相同的多个此种寄存器)检查该地址是否合法.发现该地址没有在不论什么一个这种寄存器中设置,即XMC将该内存视为非法地址.然会会通过L2内存…

最近再学习算法和数据结构,推荐一本书:Data structures and Algorithm analysis in Java 3rd 以下的四种算法出自本书 四种最大子序列和的算法: 问题描述 给定(可能有负数)整数a(1).a(2).……a(n),求 a(1)+a(2)+……+a(j)的最大值.为方便起见,若所有的整数为负数,则最大子序列和为0. 也就是:在一系列整数中,找出连续的若干个整数,这若干个整数之和 最大. 第一种:穷举所有可能,由于嵌套三层for循环,运行时间O(N^3) p…

几种常见的排序 排序是一个程序员的基本功,对于初级phper,更是可以通过排序算法来锻炼自己的思维能力. 所谓排序,就是对一组数据,按照某个顺序排列的过程.下面就总结四种常用的php排序算法,分别是冒泡排序,选择排序,插入排序以及快速排序. 一,冒泡排序(Bubble sort) 在几种排序中,个人认为冒泡排序相对而言是比较简单也是非常常用的一种排序方法. 基本思想:如下图所示,将一组数据看作一排竖着的气泡,然后让最后一个数与倒数第二个数进行比较,大的就往前移.然后用相同的方法,将倒数第二个数与…

1.引用计数算法 引用计数(Reference Counting)算法是每个对象计算指向它的指针的数量,当有一个指针指向自己时计数值加1:当删除一个指向自己的指针时,计数值减1,如果计数值减为0,说明已经不存在指向该对象的指针了,所以它可以被安全的销毁了.可以很直观的用下面的图表示: 引用计数算法的优点在于内存管理的开销分布于整个应用程序运行期间,非常的“平滑”,无需挂起应用程序的运行来做垃圾回收:而它的另外一个优势在于空间上的引用局部性比较好,当某个对象的引用计数值变为0时,系统无需访问位于堆…

之前遇到了一篇好文(https://blog.csdn.net/wallwind/article/details/6889917)准备学习一下的,课程繁忙就忘记了,今日得闲,特来补一下. 自己写一遍加深一下印象. 1.引用计数算法 引用计数(Reference Counting)算法是每个对象计算指向它的指针的数量 当有一个指针指向自己时,计数器+1: 当删除一个指向自己的指针时,计数器-1 如果计数器减为0,说明不存在指向该对象的指针了所以它可以被安全地销毁了. 如图: 引用计数算法  优点:…

在虚拟化及云计算技术大规模应用于企业数据中心的科技潮流中,存储性能无疑是企业核心应用是否虚拟化.云化的关键指标之一.传统的做法是升级存储设备,但这没解决根本问题,性能和容量不能兼顾,并且解决不好设备利旧问题.因此,企业迫切需要一种大规模分布式存储管理软件,能充分利用已有硬件资源,在可控成本范围内提供最佳的存储性能,并能根据业务需求变化,从容量和性能两方面同时快速横向扩展.这就是Server SAN兴起的现实基础. Ceph作为Server SAN的最典型代表,可对外提供块.对象.文件服务的分布式…

Hive的几种常见的数据导入方式这里介绍四种:(1).从本地文件系统中导入数据到Hive表:(2).从HDFS上导入数据到Hive表:(3).从别的表中查询出相应的数据并导入到Hive表中:(4).在创建表的时候通过从别的表中查询出相应的记录并插入到所创建的表中. 一.从本地文件系统中导入数据到Hive表 先在Hive里面创建好表,如下: hive> create table wyp > (id int, name string, > age int, tel string) >…

转载请注明出处:http://blog.csdn.net/ns_code/article/details/17099981 守护线程   Java中有两类线程:User Thread(用户线程).Daemon Thread(守护线程) 用户线程即运行在前台的线程,而守护线程是运行在后台的线程. 守护线程作用是为其他前台线程的运行提供便利服务,而且仅在普通.非守护线程仍然运行时才需要,比如垃圾回收线程就是一个守护线程.当VM检测仅剩一个守护线程,而用户线程都已经退出运行时,VM就会退出,因为没有如…

Activity启动模式设置: <activity android:name=".MainActivity" android:launchMode="standard" /> Activity的四种启动模式: . standard 模式启动模式,每次激活Activity时都会创建Activity,并放入任务栈中. . singleTop 如果在任务的栈顶正好存在该Activity的实例, 就重用该实例,否者就会创建新的实例并放入栈顶(即使栈中已经存在该A…