R代码展示各种统计学分布 | 生物信息学举例

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regression | p-value | Simple (bivariate) linear model | 线性回归 | 多重检验 | FDR | BH | R代码

P122, 这是IQR method课的第一次作业,需要统计检验,x和y是否显著的有线性关系. Assignment 1 1) Find a small bivariate dataset (preferably from your own discipline) and produce a scatterplot (this is easy using any spreadsheet) 2) Use any statistics tool (a calculator, spreadsheet…

<转>机器学习系列(9)_机器学习算法一览（附Python和R代码）

转自http://blog.csdn.net/han_xiaoyang/article/details/51191386 – 谷歌的无人车和机器人得到了很多关注,但我们真正的未来却在于能够使电脑变得更聪明,更人性化的技术,机器学习. – 埃里克施密特(谷歌首席执行官) 当计算从大型计算机转移至个人电脑再转移到云的今天,我们可能正处于人类历史上最关键的时期.之所以关键,并不是因为已经取得的成就,而是未来几年里我们即将要获得的进步和成就. 对我来说,如今最令我激动的就是计算技术和工具的普及,从而带…

建模分析之机器学习算法（附python&R代码）

0序随着移动互联和大数据的拓展越发觉得算法以及模型在设计和开发中的重要性.不管是现在接触比较多的安全产品还是大互联网公司经常提到的人工智能产品(甚至人类2045的的智能拐点时代).都基于算法及建模来处理. 常见的词汇:机器学习.数据建模.关联分析.算法优化等等,而这些种种又都是基于规律的深度开发(也难怪道德经的首篇就提出道可道非常道,名可名非常名的说法),不管是线性还是非线性,总之存在关联关系,而我们最好理解的就是线性关系,简单的用个函数就能解决.比如我们生活中应用的比较的归纳总结,其…

R 代码积累

R 代码积累不定期更新 1.阶乘.递归.reduce.sprintf #NO.1 # 阶乘函数 fact <- function(n){ if(n==0) return(1) #基例在这 else return(n*fact(n-1)) } #1+2!+3!+...+20!的和 #测试 Reduce('+', lapply(1:3,fact)) 结果是9 Reduce('+', lapply(1:20,fact)) #NO.2 #判断101-200之间有多少个素数,并输出所有素数 is.prim…

似然函数 | 最大似然估计 | likelihood | maximum likelihood estimation | R代码

学贝叶斯方法时绕不过去的一个问题,现在系统地总结一下. 之前过于纠结字眼,似然和概率到底有什么区别?以及这一个奇妙的对等关系(其实连续才是f,离散就是p). 似然函数 | 似然值 wiki:在数理统计学中,似然函数是一种关于统计模型中的参数的函数,表示模型参数中的似然性. 这里我们讨论的范围已经界定了,那就是在指定模型下(比如二项分布),我们观测数据和可能的模型参数之间的关系. (传统的贝叶斯定理的适用范围很广,是高度的总结推广,在似然函数里就不要过于推广了) 似然函数在直觉上就很好理解了,L(…

机器学习算法的基本知识（使用Python和R代码）

本篇文章是原文的译文,然后自己对其中做了一些修改和添加内容(随机森林和降维算法).文章简洁地介绍了机器学习的主要算法和一些伪代码,对于初学者有很大帮助,是一篇不错的总结文章,后期可以通过文中提到的算法展开去做一些实际问题. Google的自驾车和机器人得到了很多新闻,但公司的真正未来是机器学习,这种技术使计算机变得更智能,更个性化.-Eric Schmidt (Google Chairman) 我们可能生活在人类历史上最具影响力的时期--计算从大型主机到PC移动到云计算的时期. 但是使这段时期有…

神经网络模型及R代码实现

神经网络基本原理一.神经元模型图中x1~xn是从其他神经元传来的输入信号,wij表示表示从神经元j到神经元i的连接权值,θ表示一个阈值 ( threshold ),或称为偏置( bias ).则神经元i的输出与输入的关系表示为: 图中 yi表示神经元i的输出,函数f称为激活函数 ( Activation Function )或转移函数 ( Transfer Function ) ,net称为净激活(net activation).若将阈值看成是神经元i的一个输入x0的权重wi0,则上面的式子…

可以编辑R代码的eclipse插件

说到强大的IDE,eclipse肯定是首先会被想到的几个之一,幸运地是,R也能使用它.在http://www.walware.de/goto/statet上有个StatET的插件,专门为R而做,从此R就能在eclipse的平台上享用一切eclipse的功能. 如果机器上没有eclipse,可以在网上JAVA相关的社区找到很多很详细的教程,JRE和R中的rJava包是必需的,建议最好顺便把JDK也装上,eclipse的环境都搭好了,不用JAVA太可惜了,能写R程序的人肯定也能写JAVA程序,R和J…

关于html5与jsp页面同样的html代码展示的页面效果不一样的问题

原文:关于html5与jsp页面同样的html代码展示的页面效果不一样的问题 html5默认的声明为 <!DOCTYPE html> jsp默认的声明头部为 <%@ page contentType="text/html;charset=UTF-8" language="java" %> <html> 这里就不一样了,如果两个页面写同样的html代码及样式,jsp页面展示的效果会跟html5页面不一样,这时只要在jsp页面的声明改…