FASTQ 数据质量统计工具】的更多相关文章

主流工具: FastQC fqcheck readfq 拿到测序数据的第一步就是做质量控制 fqcheck之后得到的结果: 它会统计每条reads,按read 1-100位点计算每个位置的ACGTN含量,以及0-41质量值的个数 最终会得到整体的错误率,GC,Q20,Q30 the default quality , sequences, total , average length:100.00 Standard deviations at 0.25: total 0.00%, per bas…
1.利用Kettle的"分组","JavaScript代码","字段选择"组件,实现数据质量统计.2.熟练掌握"JavaScript代码","分组"等组件的使用,实现数据质量统计. [实验原理]通过"JavaScript代码"对表格的记录进行质量分类,然后通过"字段选择"生成带质量标志位字段的数据,再通过"分组"统计数据的质量问题. [实验环境]操…
提到格里芬-Griffin,大家想到更多的是篮球明星或者战队名,但在大数据领域Apache Griffin(以下简称Griffin)可是数据质量领域响当当的一哥.先说一句:Griffin是大数据质量监控领域唯一的Apache项目,懂了吧. ​ 在不重视数据质量的大数据发展时期,Griffin并不能引起重视,但是随着数据治理在很多企业的全面开展与落地,数据质量的问题开始引起重视. ​ 还是那句话,商用版的解决方案暂时不在本文的讨论范围内,目前大数据流动公众号对于数据治理工具的研究还是在开源方向,希…
V 站曾经有个热帖说为何我的开源项目只有 Fork 没有 Star,楼下有个热评说开源项目关注的不应该是 Commit 数据吗?先不论 Star.Fork 和 Commit,issue .pr 也应是一个开源项目社区关注的数据. 下面我们来看看市面上有哪些 GitHub 数据统计工具 GitHub Star 数据统计工具 Chrome 插件-- Star History 顾名思义你可以通过 Star History这个项目看到一个项目的趋势增长,安装上此插件之后你可以直接在某个开源项目主页,如下…
本篇文章内容来自2016年TOP100summit Microsoft资深产品经理邢国冬的案例分享.编辑:Cynthia 邢国冬(Tony Xing):Microsoft资深产品经理.负责微软应用与服务集团的大数据平台构建,数据产品与服务. 导读:微软的ASG (应用与服务集团)包含Bing,.Office,.Skype.每天产生多达5 PB以上数据,如何构建一个高扩展性的data audit服务来保证这样量级的数据完整性和实时性非常具有挑战性.本文将介绍微软ASG大数据团队如何利用Kafka.…
随着企业信息化建设的不断深入进行,我们的企业将逐步地发展成为数字化企业.其中作为最基本构成的CATIA数模已经是产品开发制造的唯一依据,CATIA数模的质量就是加工的质量,就是制造的质量,就是生产出的产品的质量.     数模中不可避免地存在许多缺陷,这些缺陷大部分是不能被设计人员察觉的.我们需要一个工具使我们能够迅速检测出数模中有哪些问题.知道它们在什么地方.并快速消除掉这些缺陷.     德国TRANSCAT公司基于CATIA开发的Q-CHECKER和Q-Monitor是CATIA数据质量控…
MATLAB数据分析工具箱 MATLAB工具箱主要含有的类别有: 数学类.统计与优化类.信号处理与通信类.控制系统设计与分析类.图像处理类.测试与测量类.计算金融类.计算生物类.并行计算类.数据库访问与报告类. MATLAB 代码生成类. MATLAB 应用发布类. 每个类别内含有一个或多个工具箱. 比如数学.统计与优化类别就包含有曲线拟合工具箱.优化工具箱.神经网络工具箱.统计工具箱等. MATLAB 应用发布类别主要包含MATLAB和其他语言的混合编译.编程,包括C.C#.Java等. MA…
https://zhuanlan.zhihu.com/p/64418072 源数据常常包含各种差错值,为了进行下一步的分析,我们必须先找出并更正这些差错,做这些工作几乎不会有什么快乐感可言,但却往往需要耗费很多精力.如果利用数据准备工具就能够发现这些数据质量问题,我们就可以节省大量时间. PowerQuery恰好有个功能就是做这个的:列分析,下面就来看看这个功能如何帮助我们进行数据清洗的. 首先更新到最新版的 PowerBI Desktop,在预览功能中启用列分析. 然后在 Power Quer…
一.如何评估测试过程的测试情况? 很多时候完成功能测试后就会发布上线,甚至交叉和回归都没有足够的时间去执行,然后通过线上的补丁对遗漏的问题进行修复.如果可以在发布前了解本次测试过程所覆盖代码执行的比例情况,那么就可以一定程度上反应测试的执行情况和系统的质量情况.     代码执行覆盖率是一种很好评估测试人员在执行测试过程中,所命中技术编码情况的手段,并可以从侧面评估系统的质量情况.我所在的项目前后端都是用Lua进行逻辑业务开发,这里分享如何使用Lua的debug模块进行代码执行覆盖率统计的实现.…
1.什么是HotApp小程序统计 HotApp小程序统计是第一个微信第三方小程序统计工具,就像做android 和 ios开发的人知道友盟统计一样,小程序也需要有个统计工具. 通过这个工具,可以知道小程序的每日新增,每日启动次数,总用户,每天的活跃用户,很多人可能就会说,微信已经提供了,那还需要这个工具做什么? 因为微信只能看到前一天的新增用户,启动次数等数据,而当日的数据,微信的统计还不能提供. HotApp小程序统计 网址:https://weixin.hotapp.cn 2.HotApp小…