文献名:Integrative Analysis of MicroRNAome, Transcriptome, and Proteome during the Limb Regeneration of Cynops orientalis(东方蝾螈肢体再生的小RNA组,转录组,蛋白质组综合分析) 期刊名:Journal of Proteome Research 发表时间:(2019年1月4日) IF:3.950 单位: 西北大学生命科学学院组织工程实验室 陕西生物技术省级重点实验室 教育部西部资源…
题目:Peptidomics analysis of milk protein-derived peptides
released over time in the preterm infant stomach
 期刊:Journal of Proteome Research 发表时间:March 14, 2019 DOI:10.1021/acs.jproteome.8b00604 作者及单位: Robert L. Beverly--Nutrition Program, School of Bi…
题目:Clinically Applicable Deep Learning Algorithm Using Quantitative Proteomic Data 期刊:Journal of Proteome Research 发表时间:August 2, 2019 DOI:: 10.1021/acs.jproteome.9b00268 分享人:翁海玉 内容与观点: 本研究描述了一种优化的基于深度学习(DL)的胰腺癌诊断方法并测试了该方法的分类能力. 1.实验设计 1.1数据集构建:该方法使用…
文献名:Label-Free Proteomic Analysis of Exosomes Secreted from THP-1- Derived Macrophages Treated with IFN‑α Identifies Antiviral Proteins Enriched in Exosomes 期刊名:Journalof Proteome Research 发表时间:December 14, 2018 DOI: 10.1021/acs.jproteome.8b00514 单位:…
文献名:Quantitative proteomic analysis of small and large extracellular vesicles (EVs) reveals enrichment of adhesion proteins in small EVs(小型和大型胞外囊泡的定量蛋白质组学分析揭示小型胞外囊泡中粘附蛋白的富集) 期刊名:Journal of proteome research 发表时间:2019年1月 单位: 范德比尔特大学医学院 新墨西哥大学 莎拉坎农研究所…
https://github.com/Jialab-UCR/GDCRNATools GDCRNATools - An R package for downloading, organizing, and integrative analyzing lncRNA, mRNA, and miRNA data in GDC Introduction The Genomic Data Commons (GDC) maintains standardized genomic, clinical, and…
http://bioconductor.org/packages/devel/bioc/vignettes/TCGAbiolinks/inst/doc/tcgaBiolinks.html#gdcquery:_searching_tcga_open-access_data 举例: Working with TCGAbiolinks package Antonio Colaprico, Tiago Chedraoui Silva, Luciano Garofano, Catharina Olsen,…
DNA甲基化研究概述 生信技能树 已关注 2018.01.23 11:43 字数 993 阅读 183评论 0喜欢 1 DNA甲基化(DNA methylation)是最早被研究的重要表观遗传修饰之一,基于芯片和下一代测序的高通量技术为DNA甲基化的广泛检测提供了技术平台.包括,WGBS,RRBS,microarray (27K/450K/850K),MeDIP-seq,MRE-seq 甲基化芯片 Infinium HumanMethylation27 / 450 BeadChip芯片(以下简称…
##Genomic sequence variation ###1000 Genomes Projecthttp://www.1000genomes.org/Data collection and a catalog of human variation ###dbSNPhttp://www.ncbi.nlm.nih.gov/projects/SNP/A catalog ofSNPs and short indels ###dbVar and Database of Genomic Varian…
大家好,本周分享的是发表在Molecular & Cellular Proteomics上的一篇关于人的尿蛋白质组学的文章,题目是Comprehensive analysis of individual variation in the urinary proteome revealed significant gender differences,通讯作者是北京师范大学的Youhe Gao,北京肾病临床研究中心的Di Wu和北京协和医学院的Wei Sun. 尿液是一种无创可得的生物样本,它积累…