DNA repair Problem Description   Biologists finally invent techniques of repairing DNA that contains segments causing kinds of inherited diseases. For the sake of simplicity, a DNA is represented as a string containing characters 'A', 'G' , 'C' and '…

题目链接 能AC还是很开心的...此题没有POJ2778那么难,那个题还需要矩阵乘法,两个题有点相似的. 做题之前,把2778代码重新看了一下,回忆一下当时做题的思路,回忆AC自动机是干嘛的... 状态表示dp[i][j]长度为i的以j串为结束的最小改变数目.AC自动机预处理一下,然后DP. 卡内存+不知道状态数,MLE+RE+WA了多次. #include <iostream> #include <cstring> #include <cstdio> #include…

题目链接:https://vjudge.net/problem/HDU-2457 DNA repair Time Limit: 5000/2000 MS (Java/Others)    Memory Limit: 32768/32768 K (Java/Others)Total Submission(s): 3126    Accepted Submission(s): 1661 Problem Description Biologists finally invent techniques…

题意:给出一些不合法的模式DNA串,给出一个原串,问最少需要修改多少个字符,使得原串中不包含非法串. 解题关键:多模式串匹配->AC自动机,求最优值->dp,注意在AC自动机上dp的套路. AC自动机上的每个节点其实就是一种状态,进行模式匹配其实就是进行边的匹配 令$dp[i][j]$表示字符串长度为$i$时到达AC自动机上某个状态所需要修改的最小值. 转移方程:$dp[i + 1][Next[j][k]] = \min (dp[i][j] + (k! = str[i]),dp[i + 1][…

DNA Sequence Time Limit: 1000MS   Memory Limit: 65536K Total Submissions: 11860   Accepted: 4527 Description It's well known that DNA Sequence is a sequence only contains A, C, T and G, and it's very useful to analyze a segment of DNA Sequence,For ex…

题意 : 给出 n 个病毒串,最后再给出一个主串,问你最少改变主串中的多少个单词才能使得主串中不包含任何一个病毒串 分析 : 做多了AC自动机的题,就会发现这些题有些都是很套路的题目.在构建 Trie 图的时候给病毒串末尾打上标记,最后定义DP[i][j] = 长度为 i 的串在 j 这个状态节点最少改变数使得其不包含病毒串,则状态转移方程 if(Trie[k]不是被标记的病毒节点) DP[i+1][j] = min( DP[i+1][j], DP[i][k] + (mp[S[i]] != k)…

给定N个长度不超过20的模式串,再给定一个长度为M的目标串S,求在目标串S上最少改变多少字符,可以使得它不包含任何的模式串 建立Trie图,求得每个节点是否是不可被包含的串,然后进行DP dp[i][j]表示在Trie图上行走i步到达节点j的要修改的最小次数,则 dp[i + 1][chi[j][k]] = min(dp[i + 1][chi[j][k]], dp[i][j] + (ACGT[k] != str[i])) chi[j][k]表示节点j的第k个子节点 #include<cstdio…

题意:给N个串,一个大串,要求在最小的改变代价下,得到一个不含上述n个串的大串. 思路:dp,f[i][j]代表大串中第i位,AC自动机上第j位的最小代价. #include<algorithm> #include<cstdio> #include<cmath> #include<cstring> #include<iostream> #include<queue> std::queue<int>Q; ][],end[],…

题意:给定一些串,然后让你构造出一个长度为 m 的串,并且不包含以上串,问你有多少个. 析:很明显,如果 m 小的话 ,直接可以用DP来解决,但是 m 太大了,我们可以认为是在AC自动机图中,根据离散中的矩阵的幂可以表示 从 i 到 j 需要 x 步的有多少条.比如A[1][2]^5 = 10,表示从结点 1 到结点 2 走五步有10种方法,利用这种方法,就可以直接进行矩阵快速幂了. 代码如下: #pragma comment(linker, "/STACK:1024000000,1024000…

DNA repair Time Limit: 2000MS   Memory Limit: 65536K Total Submissions: 4815   Accepted: 2237 Description Biologists finally invent techniques of repairing DNA that contains segments causing kinds of inherited diseases. For the sake of simplicity, a…