B(Baseline):峰在基线处开始或结束V(Valley):峰在谷点线处开始或结束P(Peak): 峰开始或结束与基线贯穿点BB就代表标准的峰:从基线开始出峰,最后峰到基线结束(from baseline to baseline)BP或PB就代表峰一端在基线之下,其中,BP代表峰的尾端在基线之下,而PB代表峰的前端在基线之下.BV代表峰起始于基线但结束在峰的谷点,在基线之上.VB相对于BV则反之,即代表峰起始于峰的谷点但结束在基线,在基线之下.其中BB代表峰型最好,最对称,理想,是对称的流出…

snow 255 250 250 #fffafa ghostwhite 248 248 255 #f8f8ff whitesmoke 245 245 245 #f5f5f5 gainsboro 220 220 220 #dcdcdc floralwhite 255 250 240 #fffaf0 oldlace 253 245 230 #fdf5e6 linen 250 240 230 #faf0e6 antiquewhite 250 235 215 #faebd7 papayawhip 255…

Hashtable 是一个很常见的数据结构类型,前段时间阿里的面试官说只要搞懂了HashTable,hashMap,HashSet,treeMap,treeSet这几个数据结构,阿里的数据结构面试没问题. 一查才发现,这里面的知识确实不少,都很经典,因此做一个专题 通过此文章,可以了解到一下内容(我去美团,京东,阿里基本每次都问这几个问题) (1) Hashtable的存储结构 (数组+链表) (2)Hashtable的扩容原理,扩容因子0.75,bucket的初始大小11.(扩容的函数为2N+…

生物医学大数据-蛋白质定量 现今肽段定量效率存在巨大差异.比如相同质量蛋白质,但是肽段和蛋白信号不均一,在物理条件一致时,仅有70%的重复率,并且当重复次数变多时,overlapping在变少. 无标定量法 方法一是针对二级色谱的谱图计数,即统计二级色谱的数量,数量越多则蛋白丰度越高,但相同丰度蛋白也有不同的二级色谱数,所以算法目的是减少噪音. 方法二是针对一级色谱的离子流色谱峰XIC,即每个肽段的离子流色谱峰,可以取同一个肽段不同时间点上的信号强度,连接成峰,通过求该曲线的曲线下面积获取曲线信…

文献名: DIAlignR provides precise retention time alignment across distant runs in DIA and targeted proteomics(DIAlignR 为DIA和靶向蛋白质组学提供了准确的保留时间对齐的算法) 期刊名:MCP 发表时间:(2019年1月) 单位: 多伦多大学 斯坦福大学   一. 概述:(用精炼的语言描述文章的整体思路及结果) 我们提出了一种新的保留时间算法,直接比对原始swathm – ms的二级色…

文献名:Data-independent acquisition improves quantitative cross-linking mass spectrometry (DIA方法可提升定量交联质谱分析) 期刊名:Mol Cell Proteomics 发表时间:(2019年4月) IF:5.232 单位: 1.      德国柏林技术大学生物技术研究所 2.      英国爱丁堡大学生命科学学院 3.      瑞典 Biognosys 公司 技术:DIA交联质谱定量 一.概述:(用精炼…

介绍 一般来说,编译器是一个黑箱,源代码从一端进入,然后箱子中发生一些奇妙的变化,最后从另一端出来目标文件或程序集.编译器施展它们的魔法,它们必须对所处理的代码进行深入的理解,不过相关知识不是每个人都需要知道,除了实现编译器的大法师.因此在转换输出完成后相关的信息就会被遗忘. 对编译器来说,几十年来一直很好地为我们所用,但只是会用编译器已经不够.我们越来越依赖于集成开发环境(IDE)的特性,比如智能感知.重构.智能重命名.“查找所有引用”和“转到定义”来提高我们的生产率.我们依赖于代码分析工具来…

介绍 一般来说,编译器是一个黑箱,源代码从一端进入,然后箱子中发生一些奇妙的变化,最后从另一端出来目标文件或程序集.编译器施展它们的魔法,它们必须对所处理的代码进行深入的理解,不过相关知识不是每个人都需要知道,除了实现编译器的大法师.因此在转换输出完成后相关的信息就会被遗忘. 对编译器来说,几十年来一直很好地为我们所用,但只是会用编译器已经不够.我们越来越依赖于集成开发环境(IDE)的特性,比如智能感知.重构.智能重命名.“查找所有引用”和“转到定义”来提高我们的生产率.我们依赖于代码分析工具来…

编译器管道功能区 .NET编译器平台(“Roslyn”)通过提供一个API层,是一个传统编译器管道镜像,向你这样的消费者揭示了C#和Visual Basic编译器的代码分析. 这条管道的每一部分,现在都是单独的组件.首先,在解析阶段,其中原始码被记号化和解析成不同语言的句法.第二,声明阶段,即从源代码和输入的metadata进行分析,以形成命名符号.下一个阶段,原始码中的标示符(identifier)被匹配成符号(symbol).最后发布(emit)阶段,所有编译器构建的信息作为一个程序集被发布…

目录 1. 简介 2. 近几年发表的主要工具 1.DeepRT 2.Prosit 3. DIANN 4.DeepDIA 1. 简介 基于串联质谱的蛋白质组学大部分是依赖于数据库(database search)的bottom-up策略研究.也就是实际谱图和理论谱图进行匹配打分,从而实现肽段和蛋白的鉴定和定量.如果是DDA的数据,因为一张二级谱是一条肽段,直接将数据库理论酶切碎裂后的理论谱和实际谱图匹配即可.但如果是DIA的数据,因为二级谱是混合谱,即来源于很多肽段,而且碎片离子还会受到未碎裂的母…