Differential expression analysis for paired RNA-seq data 抽象背景:RNA-Seq技术通过产生序列读数并在不同生物条件下计数其频率来测量转录本丰度. 为了鉴定两种条件之间差异表达的基因,重要的是要考虑实验设计以及数据的分布特性. 在许多RNA-Seq研究中,表达数据以多对获得,例如来自相同个体的治疗前和治疗后样品.我们寻求将配对结构纳入分析. 结果:我们提出了一个用于RNA-Seq数据的贝叶斯分层混合模型,以分别考虑变异性来自配对数据结构的…

RNA-Seq differential expression analysis: An extended review and a software tool   RNA-Seq差异表达分析: 扩展评论和软件工具 正确鉴定特定条件之间的差异表达基因(DEG)是理解表型变异的关键.高通量转录组测序(RNA-Seq)已成为这些研究的主要选择. 因此,用于RNA-Seq数据的差异表达分析的方法和软件的数量也迅速增加. 但是,对于最合适的管道还是没有达成共识用于从RNA-Seq数据鉴定差异表达基因的方…

业界良心啊,开源的单细胞课程. 随便看了几章,课程写得非常用心,非常适合新手. 课程地址:Analysis of single cell RNA-seq data 源码地址:hemberg-lab/scRNA.seq.course…

Sensitivity, specificity, and reproducibility of RNA-Seq differential expression calls RNA-Seq差异表达调用的灵敏度 特异性 重复性 抽象背景:MAQC / SEQC联盟最近编制了一个关键基准,可用于测试微阵列和RNA-seq表达谱分析工具的最新发展.这些客观基准是基础研究和应用研究所需,对临床和监管结果至关重要.超越原始SEQC研究中提出的第一次比较,我们在此提出包括效果的扩展基准常见实验的典型优势.…

-- 问题1 tablename使用主键索引反而比idx_ref_id慢的原因EXPLAIN SELECT SQL_NO_CACHE COUNT(id) FROM dbname.tbname FORCE INDEX (idx_ref_id)EXPLAIN SELECT SQL_NO_CACHE COUNT(id) FROM dbname.tbname FORCE INDEX (PRIMARY) 原因:可以看到走主键索引的时候效率比较差.那么是为什么呢.平时我们检索一列的时候,基本上等值或范围查询…

上一篇文章讲到,通过data loader去批量处理数据,那么这篇文章将主要讲解在Salesforce中通过dataloadercliq调用data loader来批量处理数据. 1): CLIq文件下载路径为 : http://code.google.com/p/dataloadercliq/  下载之后将cliq整体放置到Data Loader的安装目录下,如下图所示 2): 我们可以看到在cliq文件夹下是一个可执行 .bat 文件 3): 双击 .bat 文件,之后会显示相应的图形界面,…

jQuery.Data源码 jQuery.data的是jQuery的数据缓存系统 jQuery.data的是jQuery的数据缓存系统.它的主要作用就是为普通对象或者DOM元素添加数据. 1 内部存储原理 这个原理很简单,原本要添加在DOM元素本身的数据,现在被集中的存储在cache集合中.它们之间靠一个从开始的数字键来联系着.这样DOM元素就不会像以前那么笨重了,更不会出现以前那种循环引用而引起的内存泄漏.现在DOM只需要保存好这个数字键值即可.这个属性值被保存在DOM元素的一个属性里,该属性…

CYQ.Data 支持WPF相关的数据控件绑定(2013-08-09) 事件的结果 经过多天的思考及忙碌的开发及测试,CYQ.Data 终于在UI上全面支持WPF,至此,CYQ.Data 已经可以方便支持wpf的开发,同时,框架仍保留最低.net framework2.0版本的支持.   支持WPF的起因:   CYQ.Data 一直是基于2.0语法下支持开发的框架,在未直接支持WPF之前,对于控件列表的绑定,因为WPF竟然不支持DataTable,研究后发现需要从MDataTable.ToDa…

问:为什么在项目中data需要使用return返回数据呢? 答:不使用return包裹的数据会在项目的全局可见,会造成变量污染:使用return包裹后数据中变量只在当前组件中生效,不会影响其他组件.…

0. Data Lake Analytics(简称DLA)介绍 数据湖(Data Lake)是时下大数据行业热门的概念:https://en.wikipedia.org/wiki/Data_lake.基于数据湖做分析,可以不用做任何ETL.数据搬迁等前置过程,实现跨各种异构数据源进行大数据关联分析,从而极大的节省成本和提升用户体验.关于Data Lake的概念. 终于,阿里云现在也有了自己的数据湖分析产品:https://www.aliyun.com/product/datalakeanalyt…