LeDock是苏黎世大学Zhao HongTao在博士期间开发的一款分子对接软件,专为快速准确地将小分子灵活对接到蛋白质而设计.LeDock优于大部分商业软件,在Astex多样性集合上实现了大于90%的构象预测准确度,对接时间最快仅需三秒.LeDock同时支持Windows.Linux和MacOS三大操作系统. Linux版支持大规模虚拟筛选,需要通过代码操作才能实现目标. Windows版的图形界面极大简化了药物化学家常见多重复杂的对接过程,但每次任务只能对接一个分子,效率极低,只适用于少量对…

本文首发于“生信补给站”公众号,https://mp.weixin.qq.com/s/ZEjaxDifNATeV8fO4krOIQ更多关于R语言,ggplot2绘图,生信分析的内容,敬请关注小号. 为了能更方便的查看,检索,对文章进行了精心的整理.建议收藏,各取所需,当前没用也许以后就用到了呢! 一 R资料+计划 R语言精品资料年中无套路赠送 R-plotly|交互式甘特图(Gantt chart)-项目管理/学习计划 二 Bioinfo R|fastqcr QC数据处理 :测序结果的数据质控及…

各种生信工具: https://omictools.com/…

非原创 参考资料: 一文掌握GO和pathway分析 - 生物信息学讨论版 -丁香园论坛http://www.dxy.cn/bbs/thread/34904124#34904124 GO富集 GO是Gene ontology的缩写,GO数据库分别从功能.参与的生物途径及细胞中的定位对基因产物进行了标准化描述,即对基因产物进行简单注释,通过GO富集分析可以粗略了解差异基因富集在哪些生物学功能.途径或者细胞定位. Pathway Pathway指代谢通路,对差异基因进行pathway分析,可以了解实…

http://mp.weixin.qq.com/s/nK1Kkf9lfZStoX25Y7SzHQ 这篇文章主要适用于Linux平台,当然MacOS也行,不过它有更好安装方法. 此外网上也会许多更好的关于biconda的教程,这里还是抛砖应用,提供一种除了编译源码和直接下载二进制文件外安装生信软件的一种思路 bioconda是什么 官方介绍是: Bioconda is a channel for the conda package manager specializing in bioinform…

使用NCBI进行目的基因的引物设计 全文概述 利用生信工具进行目的基因的引物设计,使用了NCBI进行筛选与设计引物,使用 idtdna对筛选出的DNA进行检查.本文分享了如何筛选出高质量的基因引物,帮助想通过生信进行引物设计的学生.从业者找出合适的基因,毕竟购买引物也比较烧钱,避免设计出的基因质量偏低. NCBI查找基因 1.查询目的基因:https://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/?term=zbed3 备注:这里需要注意的是,要找到合适的目的基因!如果找智人,一…

前言 本文为[小小赫下士 blog]原创,搬运请保留本段,或请在醒目位置设置原文地址和原作者. 作者:小小赫下士 原文地址:Java对接拼多多开放平台API(加密上云等全流程) 本文章为企业ERP(ISV软件服务商)对接拼多多开放平台流程总结,文章包括开放平台入驻.商家授权接口流程.API调用流程(订单同步.发货回传以及其他接口的调用).密文改造流程.拼多多电子面单调用流程.密文环境下发货流程.拼多多云服务以及服务入云流程. (自研或者其他类型服务商请勿参考) 一.开放平台入驻 open平台地址…

阿里云RPA,作为阿里云自研8年的技术,在资本的热捧下,逐渐从幕后来到台前,成为企业服务市场的黑马.本文将从产品上全面剖析,阿里云RPA这款产品的现阶段情况,同时简单谈谈阿里云RPA的商业化进展. 阿里云RPA是什么? RPA,即Robotic Process Automation(机器人流程自动化),能代替人执行电脑端重复.有规则.大批量的跨系统.跨平台的操作工作,完成跟数据采集.数据搬运.数据填写.流程执行.准确规范性要求高的相关工作. 阿里云RPA在阿里巴巴集团内部“服役8年”,普遍赋能集…

罗杨老师带你了解谷歌编程之夏(GSoC)活动全流程 为了帮助同学们更好地参与开源,Casbin 决定做一期访谈节目,由小编作为一名开源初学者,用访谈的形式与北京大学工学博士.Casbin作者.Npcap作者罗杨老师进行交流.从介绍开源入手,然后帮助大家了解GSoC的活动流程. 为了更好地了解同学们对GSoC的疑惑,请大家填写下面的问卷. 点击链接:https://wenjuan.feishu.cn/m?t=s9FElSSSWvAi-30zh Google Summer of Code ,简称GS…

本文作者:源三.临石.张磊.莫源 业界要闻 1. K8s 1.16 将废弃一系列旧的 API 版本 影响面涉及 NetworkPolicy.PodSecurityPolicy.DaemonSet, Deployment, StatefulSet, ReplicaSet 和 Ingress.请各位 K8s 用户和开发者关注,相关 API 都是进行了如下迁移: NetworkPolicy: 在 v1.16 中不再使用 extensions/v1beta1: 迁移到 networking.k8s.io…