[Python]-pydicom模块处理DICOM数据】的更多相关文章

在处理医疗数据时,经常要跟DICOM文件打交道.在使用Python处理时,不得不提常用的pydicom模块. import pydicom DICOM文件读取 pydicom.read_file()读取dicom文件信息: dcm = pydicom.read_file(dicom_path) pydicom.dcmread()读取dicom文件信息: dcm = pydicom.dcmread(dicom_path) 以上两种方法得到的dcm没有区别. 输出dicom中某个信息: print(…
import json 函数 json.dumps() json.dumps()函数是将字典转化为字符串 json.loads() json.loads()函数是将字符串转化为字典 注意: 从json文件读取多层嵌套的字典,每一层都需要进行json.loads(). 区分是字符串还是字典,看输出的键值,是单引号',说明是字典,双引号"说明还是字符串. 用法实例 存入json文件 在把字典存入json文件之前要转换成字符串 csv_dict = json.dumps(csv_dict) with…
psutil模块 1.介绍 psutil是一个跨平台库(http://code.google.com/p/psutil/),能够轻松实现获取系统运行的进程和系统利用率(包括CPU.内存.磁盘.网络等)信息.它主要应用于系统监控,分析和限制系统资源及进程的管理.它实现了同等命令行工具提供的功能如ps.top.lsof.netstat.ifconfig.who.df.kill.free.nice.ionice.iostat.iotop.uptime.pidof.tty.taskset.pmap等.目…
python xlrd 模块(获取Excel表中数据) 一.安装xlrd模块   到python官网下载http://pypi.python.org/pypi/xlrd模块安装,前提是已经安装了python 环境. 二.使用介绍  1.常用单元格中的数据类型    0 empty,1 string(text), 2 number, 3 date, 4 boolean, 5 error, 6 blank 2.导入模块      import xlrd   3.打开Excel文件读取数据      …
1. 前言 在对DICOM数据预处理之前很重要的一步是将扫描得到的文件按照不同的扫描序列区分开来.DPABI和PANDA工具包中已经提供了相应的功能模块.但由于是集成的模块,不容易及逆行扩展和调整.这里我们使用Python来实现DPABI当中的"DICOM Sorted"模块的功能. 2. 方法 这里主要使用pydicom包来读取DICOM文件的头文件.pydicom提供了两种访问数据头信息的方式,通过元素名称和标签号来访问. DICOM Sorted会读取头文件中的序列号和序列描述这…
1 模块简介 threading模块在Python1.5.2中首次引入,是低级thread模块的一个增强版.threading模块让线程使用起来更加容易,允许程序同一时间运行多个操作. 不过请注意,Python中的线程最好是与IO操作一起工作,比如从网络上下载资源或者从你的电脑中读取文件和目录.如果你需要处理一些CPU密集的任务,你最好是看看Python的multiprocessing模块.原因就是Python有GIL锁(解释器全局锁),使得所有的线程在主线程内运行.由于这个原因,当你使用线程执…
1 logging模块简介 logging模块是Python内置的标准模块,主要用于输出运行日志,可以设置输出日志的等级.日志保存路径.日志文件回滚等:相比print,具备如下优点: 可以通过设置不同的日志等级,在release版本中只输出重要信息,而不必显示大量的调试信息: print将所有信息都输出到标准输出中,严重影响开发者从标准输出中查看其它数据:logging则可以由开发者决定将信息输出到什么地方,以及怎么输出: 2 logging模块使用 2.1 基本使用 配置logging基本的设…
一.模块介绍                                                                                                                                   Python Module(模块),就是一个保存了Python代码的文件.模块能定义函数,类和变量.模块里也能包含可执行的代码. 文件名就是模块名加上后缀.py,在模块内部,模块名存储在全局变量__name__中,是一个str…
preprocessing 模块提供了数据预处理函数和预处理类,预处理类主要是为了方便添加到 pipeline 过程中. 数据标准化 标准化预处理函数: preprocessing.scale(X, axis=0, with_mean=True, with_std=True, copy=True): 将数据转化为标准正态分布(均值为0,方差为1) preprocessing.minmax_scale(X, feature_range=(0, 1), axis=0, copy=True): 将数据…
Paramiko模块批量管理:通过调用ssh协议进行远程机器的批量命令执行. 要使用paramiko模块那就必须先安装这个第三方模块,仅需要在本地上安装相应的软件(python以及PyCrypto),对远程服务器没有配置要求,对于连接多台服务器,进行复杂的连接操作特别有帮助. 一.安装: 1:安装gcc和python-devel yum install gcc gcc-c++ python-devel #安装所需环境 2:  paramiko依赖pycrypto模块,要先下载pycrypto安装…