1.相对于能量函数来说,能量最小化的办法都有哪些? 梯度下降 模拟退火 图割 2.这个 跟最优化问题的求解,有什么联系跟区别呢? 基本上差不多,其实就是求出来了函数的一个最小值,我们看问题的时候不妨把能量二字去掉.单纯的理解为函数 3.这个能量的观点是否跟信息熵类似,让系统的熵最小? 其实也都差不多,都是求最小值的. 我们可以看到下面的代码就求出来了相关表达式,在x =0 ,y = 1, z= 1时候能够取得最小值. /* energy.h */ /* Vladimir Kolmogorov (…
1 ; 2 ; STANDARD MD INPUT OPTIONS FOR MARTINI 2.x 3 ; Updated 02 feb 2013 by DdJ 4 ; 5 ; for use with GROMACS 4.5/4.6 6 ; 7 8 title = Martini 9 10 11 ; TIMESTEP IN MARTINI 12 ; Most simulations are numerically stable 13 ; with dt=40 fs, some (especia…
mdp文件是能量最小化,NVT模拟,NPT模拟与MD模拟的必须文件. mdp文件的详细解释可以参考官方文档http://manual.gromacs.org/online/mdp_opt.html 接下来我将使用四个文件为例子来解释mdp文件. 能量最小化minim.mdp 1 ; minim.mdp - used as input grompp to generate *.tpr 2 integrator = steep ; steep = steepest descent minimizat…
这是mdp文件系列的第二篇,介绍nvt平衡中要使用的mdp文件. 先上代码,nvt.mdp 1 title = OPLS Lysozyme NVT equilibration 2 define = -DPOSRES 3 ; Run parameters 4 integrator = md 5 nsteps = 50000 6 dt = 0.002 7 ; Output control 8 nstxout = 500 9 nstvout = 500 10 nstenergy = 500 11 ns…
输入参数:一个典型的mdp文件 1 ; 2 ; STANDARD MD INPUT OPTIONS FOR MARTINI 2.x 3 ; Updated 02 feb 2013 by DdJ 4 ; 5 ; for use with GROMACS 4.5/4.6 6 ; 7 8 title = Martini 9 10 ; TIMESTEP IN MARTINI 11 ; Most simulations are numerically stable 12 ; with dt=40 fs,…
(MTT)连续能量函数最小化方法 Multitarget tracking Multi-object tracking 连续能量函数 读"A.Milan,S. Roth, K. Schindler, 'continuous Energy Minimization for Multitarget Tracking[J]',TPAMI,2014."笔记 当前追踪的主要策略是tracking-by-dection,即首先使用背景减除法或者分类器检测出前景运动目标,然后再对目标轨迹进行估计.…
简介 以前写过一个补丁更新的文章,此处会做一个更精简的最小化实现,以便于集成.为了使逻辑具有通用性,将剥离对AFNetworking和ReativeCocoa的依赖.原来的文章,可以先看这里: http://www.ios122.com/2015/12/jspatconline/ 这么做的意义 先交代动机和意义,或许应该成为自己博客的一个标准框架内容之一,不然以后自己需要看着,也不过是一堆干瘪的代码.基本的逻辑图,如上!此处,我就从简! 从简的原因有3: 补丁更新,状态可以设计的很复杂,就像开头…
需求背景 用python进行文件的创建和读写操作时,我们很少关注所创建的文件的权限配置.对于一些安全性较高的系统,如果我们创建的文件权限其他用户或者同一用户组里的其他用户有可读权限的话,有可能导致不必要的信息泄漏的风险.因此,除了创建一个更加安全和隐私的个人环境之外(如容器环境等),我们还可以对生成的文件的配置进行权限最小化处理. 常用方法及其缺陷分析 常用的python文件创建和读写方法,是直接通过内置的open函数创建一个文件.这里如果是使用with语法来创建的,结束语句后会自动关闭被打开的…
原文 (WinForm)文件夹状态监控,最小化到托盘,开机自启动 . 文件夾監控(監測文件夾中的文件動態): //MSDN上的例子 public class Watcher { public static void Main() { Run(); } [PermissionSet(SecurityAction.Demand, Name = "FullTrust")] public static void Run() { string[] args = System.Environmen…
CentOS 6.x 最小化安装推荐安装的依赖包 我在日常工作中,新建的xenserver的虚拟机,CentOS release 6.9 (Final)操作系统,采用最小化安装,后续很多操作需要各种依赖包,经过一些时间的积累,推荐安装如下依赖包.前提是需要yum源先配置好,最好能联网,采用网络yum源. yum clean all yum -y update yum -y install gd libxml2-devel libjpeg-devel libpng-devel net-snmp-d…