前言 这是代谢组学数据分析的一个R包,包括用于代谢组学数据分析.可视化和功能注释等众多功能.最近有同事在集群中搭建蛋白和代谢流程,安装这个包出现了问题,于是我折腾了一上午. 这个包的介绍在:https://github.com/xia-lab/MetaboAnalystR,安装确实还比较复杂,依赖的东西太多太多.废话不多说,记录下安装历程. 安装过程 首先最好是已经安装了自己的R版本(非root),比如我的是R-3.5.2.然后进入R中,依照文档给的顺序依次安装: 第一步:安装依赖包 insta…

Linux下非root用户如何安装软件 从windows转移到Linux的用户最开始总会有各种不适,因为这种不适最终放弃linux的不在少数.对于这类人只能说可惜,还没有领略到linux的美好就过早放弃了.还有就是用着Linux还不错,但是因为熟悉了在个人电脑上使用,有着各种权限.突然发现工作的时候只能使用普通账户,许多sudo命令都不能再使用,然后各种不适应和各种纠结.本文主要面向对象是第二类人群,简要的介绍在没有root权限的情形下良好的使用Linux来工作. windows毫无疑问是PC操…

[转载]Linux下非root用户如何安装软件 来源:https://tlanyan.me/work-with-linux-without-root-permission/ 这是本人遇到的实际问题,之前用到的所有机器,无论是自己的PC还是云服务器,root权限都是妥妥的,但是现在发现实验室的服务器原来自己并没有root权限2333 再看用户的权限.root用户是bug,电脑上所有的文件都是它的,权限位设置对其无效.非root用户默认 只对家目录有完全的控制权限,对/tmp目录有读写的权限./tm…

Linux查看非root流程执行 youhaidong@youhaidong-ThinkPad-Edge-E545:~$ ps -U root -u root -N PID TTY TIME CMD 663 ? 00:00:00 dbus-daemon 713 ? 00:00:00 rsyslogd 730 ? 00:00:00 avahi-daemon 736 ? 00:00:00 avahi-daemon 987 ? 00:00:00 kerneloops 1043 ? 00:00:00 w…

Linux 下非root用户使用docker 通常我们使用linux系统的时候,最好是不要直接使用root账号,但是使用Docker的时候,默认又是不能使用非root用户的,关于原因,官方说法如下: The docker daemon binds to a Unix socket instead of a TCP port. By default that Unix socket is owned by the user root and other users can access it wi…

Linux查看非root运行的进程 youhaidong@youhaidong-ThinkPad-Edge-E545:~$ ps -U root -u root -N PID TTY TIME CMD 663 ? 00:00:00 dbus-daemon 713 ? 00:00:00 rsyslogd 730 ? 00:00:00 avahi-daemon 736 ? 00:00:00 avahi-daemon 987 ? 00:00:00 kerneloops 1043 ? 00:00:00…

1. Python 3.8.1安装 源码安装常规操作: wget -c https://www.python.org/ftp/python/3.8.1/Python-3.8.1.tgz tar -xvf Python-3.8.1.tgz mkdir -p /my/python/ cd Python-3.8.1 ./configure --prefix="/my/python/" make make install make后没报错,但出现了如下提示: Could not build t…

第一次在Linux上不用root权限安装软件,查看了很多博客,并实践安装成功.大致总结了一下samtools的安装过程,仅供大家参考,如有不对的地方,欢迎指正~ samtools安装过程中依赖于lzma.htslib两个包,所以在安装samtools之前需要确保安装了lzma.htslib.如果没有安装好,可以按照step1~step6,依次下载安装xz-5.2.3.htslib-1.5.samtools,最后在验证是否安装成功(先下载好了安装包). [step1]:先创建好自己软件需要安装到的…

非root权限安装perl 在使用Linux或是unix时,perl是一个非常有用的脚本的语言. 关于perl的模块安装,网上也有很多介绍,一方面可以通过不同套件自带的软件安装工具安装,一方面可以通过cpan安装,再者就是可以直接编译源代码. 这样,对于拥有root权限的用户来说,没有任何问题,可是对于不拥有root权限的一般用户来说,如果想在自己的home目录下安装与使用 perl的模块,还有很多特别之 处.我这里就是专门介绍如何在一般用户的home目录下安装以及使用perl模块的. 编译与安…

注意:非root用户必须要有sudo权限 一.安装前的准备 1.查看当前主机是否有docker组 若没有输出结果则新建 再次查看,发现已经有了docker组 2.新增拥有sudo权限的用户(若知道root和其他拥有sudo权限的系统用户密码,跳到3;若都没有,必做) 修改该用户的密码 为新增的用户添加sudo权限 sudo vi /etc/sudoers 在92行下一行添加 test ALL=(ALL) ALL 3.把当前用户加入到docker组 (此时用户并没有加入进docker组) 切换至s…