转自http://blog.csdn.net/pennyliang/article/details/6838956 Clustering coefficient的定义有两种:全局的和局部的. 全局的算法基于triplet.triplet分为开放的triplet(open triplet)和封闭的triplet(closed triplet)两种(A triplet is three nodes that are connected by either two (open triplet) or…
目录: 1.问题描述 2.问题转化 3.划分准则 4.总结 1.问题描述 谱聚类(Spectral Clustering, SC)是一种基于图论的聚类方法——将带权无向图划分为两个或两个以上的最优子图(sub-Graph),使子图内部尽量相似,而子图间距离尽量距离较远,以达到常见的聚类的目的. 对于图的相关定义如下: 对于无向图G = (V,E),V表示顶点集合,即样本集合,即一个顶点为一个样本:E表示边集合. 设样本数为n,即顶点数为n. 权重矩阵:W,为n*n的矩阵,其值wi,j为各边的权值…
谱聚类(Spectral Clustering)详解 谱聚类(Spectral Clustering, SC)是一种基于图论的聚类方法——将带权无向图划分为两个或两个以上的最优子图,使子图内部尽量相似,而子图间距离尽量距离较远,以达到常见的聚类的目的.其中的最优是指最优目标函数不同,可以是割边最小分割——如图1的Smallest cut(如后文的Min cut), 也可以是分割规模差不多且割边最小的分割——如图1的Best cut(如后文的Normalized cut). 图1 谱聚类无向图划分…
杰卡德相似系数(Jaccardsimilarity coefficient) (1)杰卡德相似系数 两个集合A和B交集元素的个数在A.B并集中所占的比例,称为这两个集合的杰卡德系数,用符号 J(A,B) 表示.杰卡德相似系数是衡量两个集合相似度的一种指标(余弦距离也可以用来衡量两个集合的相似度). jaccard值越大说明相似度越高. (2)杰卡德距离 与杰卡德相似系数相反的概念是杰卡德距离(Jaccard Distance),可以用如下公式来表示: 杰卡德距离用两个两个集合中不同元素占所有元素…
# -*- coding: cp936 -*- import random import networkx as nx from networkx.generators.classic import empty_graph def powerlaw_cluster_graph(n, m, p, seed=None): """Holme and Kim algorithm for growing graphs with powerlaw degree distribution…
什么是聚类(clustering) 个人理解:聚类就是将大量无标签的记录,根据它们的特点把它们分成簇,最后结果应当是相同簇之间相似性要尽可能大,不同簇之间相似性要尽可能小. 聚类方法的分类如下图所示: 一.如何计算样本之间的距离? 样本属性可能有的类型有:数值型,命名型,布尔型……在计算样本之间的距离时,需要将不同类型属性分开计算,最后统一相加,得到两个样本之间的距离.下面将介绍不同类型的属性的数据计算方法. 对于全部都是连续的数值型的样本来说,首先,对于值相差较大的属性来说,应该进行归一化,变…
肘部法则–Elbow Method 我们知道k-means是以最小化样本与质点平方误差作为目标函数,将每个簇的质点与簇内样本点的平方距离误差和称为畸变程度(distortions),那么,对于一个簇,它的畸变程度越低,代表簇内成员越紧密,畸变程度越高,代表簇内结构越松散. 畸变程度会随着类别的增加而降低,但对于有一定区分度的数据,在达到某个临界点时畸变程度会得到极大改善,之后缓慢下降,这个临界点就可以考虑为聚类性能较好的点. import pandas as pd from sklearn.cl…
基于图嵌入的高斯混合变分自编码器的深度聚类 Deep Clustering by Gaussian Mixture Variational Autoencoders with Graph Embedding, DGG 作者:凯鲁嘎吉 - 博客园 http://www.cnblogs.com/kailugaji/ 1. 引言 这篇博文主要是对论文“Deep Clustering by Gaussian Mixture Variational Autoencoders with Graph Embe…
1. 聚类简介 0x1:聚类是什么? 聚类是一种运用广泛的探索性数据分析技术,人们对数据产生的第一直觉往往是通过对数据进行有意义的分组.很自然,首先要弄清楚聚类是什么? 直观上讲,聚类是将对象进行分组的一项任务,使相似的对象归为一类,不相似的对象归为不同类 但是,要达到这个目的存在几个很困难的问题 . 上述提及的两个目标在很多情况下是互相冲突的.从数学上讲,虽然聚类共享具有等价关系甚至传递关系,但是相似性(或距离)不具有传递关系.具体而言,假定有一对象序列,X1,....,Xm,所有相邻元素(X…
层次聚类关键方法#coding:UTF-8#Hierarchical clustering 层次聚类from E_distance import Euclidean_distance from yezi import yezi class bicluster: def __init__(self, vec, left=None,right=None,distance=0.0,id=None): self.left = left self.right = right #每次聚类都是一对数据,lef…