Bedtools 是一个很好的用来处理区间的工具,很多时候用这个底层语言编写的小工具比自己写的脚本运行快很多,但是这个工具中的某些功能对输入文件有一定的要求,比如说里面的一个merge函数,这是里面的一个note: Note: bedtools merge requires that you presort your data by chromosome and then by start position (e.g., sort -k1,1 -k2,2n in.bed > in.sorted.…

oracle中imp命令具体解释 Oracle的导入有用程序(Import utility)同意从数据库提取数据,而且将数据写入操作系统文件.imp使用的基本格式:imp[username[/password[@service]]],下面例举imp经常使用用法. 1. 获取帮助 imp help=y 2. 导入一个完整数据库 imp system/manager file=bible_db log=dible_db full=y ignore=y 3. 导入一个或一组指定用户所属的所有表.索引和…

目录 一:sort命令作用 二:sort格式 1.sort参数 2.参数解析 sort命令简介 Linux sort 命令用于将文本文件内容加以排序. sort 可针对文本文件的内容,以行为单位来排序. 一:sort命令作用 sort用于将文件内容加以排序 二:sort格式 sort格式: cat [文件名称] | sort [参数] 解析: 默认情况下排序是(开头)从小到大排序的 1.sort参数 -n : 按照数值的大小排序 -r : 以相反的(开头)顺序来排序 -k : 以某列进行排序(空…

功能说明:将文本文件内容加以排序,sort可针对文本文件的内容,以行为单位来排序. 参 数: -b 忽略每行前面开始出的空格字符. -c 检查文件是否已经按照顺序排序. -d 排序时,处理英文字母.数字及空格字符外,忽略其他的字符. -f 排序时,将小写字母视为大写字母. -i 排序时,除了040至176之间的ASCII字符外,忽略其他的字符. -m 将几个排序好的文件进行合并. -M 将前面3个字母依照月份的缩写进行排序. -n 依照数值的大小排序. -o<输出文件> 将排序后的结果存入指定…

写在前面的话:读书破万卷,编码如有神 ------------------------------------------------- 1.排序 (1)sort:可以对List.Set.ZSet里面的值进行排序. 格式是:SORT source-key [BY pattern] [LIMIT offset count] [GET pattern [GET pattern ...]] [ASC|DESC] [ALPHA] [STORE dest-key] 参数说明: by : 设置排序的参考键,…

sort怎样按指定的列排序0000 27189 41925425065f 15 419254250663 7 419254250675 5 419254250691 76 419254250693 2 4192542506a7 82 4192542506a9 58 4192542506bf 68 4192542506c1 56 4192542506d7 145 4192542506e1 127 4192542506e3 230 4192542506e5 7 4192542506ef 48 419…

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实例:压缩server上当前文件夹的内容为xxx.zip文件 zip -r xxx.zip ./* 解压zip文件到当前文件夹 unzip filename.zip ============================ 另:有些server没有安装zip包运行不了zip命令,但基本上都能够用tar命令的.实比例如以下: tar -zcvf /home/zdzlibs.tar.gz /home/zdz/java/zdzlibs/ ============================ lin…

转自:http://www.cnblogs.com/51linux/archive/2012/05/23/2515299.html sort是在Linux里非常常用的一个命令,管排序的,集中精力,五分钟搞定sort,现在开始! 1 sort的工作原理 sort将文件的每一行作为一个单位,相互比较,比较原则是从首字符向后,依次按ASCII码值进行比较,最后将他们按升序输出. [rocrocket@rocrocket programming]$ cat seq.txt banana apple pe…

CentOS中实现与Ubuntu下apt-get install build-essential功能类似的命令 在Ubuntu中安装完系统后,可以直接使用apt-get install build-essential命令安装常用的开发编译工具包.在诸如CentOS这样的使用Yum包管理的系统中,其实也有类似的实现方法.解决方案是使用如下命令: [root@CentOS ~]# yum groupinstall "Development Tools" yum groupinstall 命…