R一般的散点图:plot() 折线图:plot()   lines() 柱状图  barplot() 箱子图  boxplot() 直方图:hist() 热力图:heatmap 画地图的:拓展包  maps,sp包 在一张画板上画多个散点图 par(mfrow=c(2,3)) 绘制的2行3列个图形 图例的参数legend 绘制图的一些参数: 背景图:bg= 只设置坐标系内的背景颜色:x<-plot(rnorm(100),type="n") x<-par("usr&…

一开始用lattice包,感觉在多元数据的可视化方面,确实做得非常好.各种函数,可以实现任何想要实现的展示. barchart(y ~ x) y对x的直方图 bwplot(y ~ x) 盒形图 densityplot(~ x) 密度函数图 dotplot(y ~ x) Cleveland点图(逐行逐列累加图) histogram(~ x) x的频率直方图 qqmath(~ x) x的关于某理论分布的分位数-分位数图 stripplot(y ~ x) 一维图,x必须是数值型,y可以是因子 qq(y…

最近经常要画好看的盒形图,还要在上面加入散点,所以总结了两个方法. 第一种方法是,利用beeswarm函数: library(beeswarm) beeswarm 蜜蜂群图 http://rgm3.lab.nig.ac.jp/RGM/r_function?p=beeswarm&f=beeswarm 可以结合盒形图展示. 有多种布局方法method = c("swarm", "center", "hex", "square&quo…

=== 数据基础操作 ===reshape2 横向.纵向做数据变换,例如把纵向堆叠在数据库中的证券行情数据转换成一个按照不同证券代码横向排列,按照时间纵向排列收盘价的数据表stringr 方便地用正则表达式做批量字符串操作,可做检测.匹配.替换.计数等等lubridate 方便地做日期/时间操作,各种标准化时间和时区的处理plyr 轻松地在vector, list, data.frame之间做分组变换,实现拆分.变换.合并的操作dplyr 轻松地处理data.frame, data.table以…

       一般R作图有三大绘图系统:base系统.ggplot2绘图系统.lattice绘图系统.        本篇主要介绍base系统绘图时的图形参数.一般用plot()函数来完成.在R中,若画的图不止一副,执行plot语句时会自动覆盖前一副,如何才能创建多个图形呢?可以在作图之前添加:dev.new().         下面通过几个图例来介绍图形参数. dose <- c(20,30,40,45,60) dragA <- c(16,20,27,40,60) dragB <-…

解决方案有好几种: 网页版,无脑绘图,就是麻烦,没有写代码方便 极简版,gplots::venn 文艺版,venneuler,不好安装rJava,参见Y叔 酷炫版,VennDiagram 特别注意: 目前主流的韦恩图都只支持5个类别,多了不能使用韦恩图. UpSet某种程度上可以显示多于5个类别,但是结果不是很直观,不推荐. library(ComplexHeatmap) m = make_comb_mat(venn.list) UpSet(m) 1. 网页版的就不说了,非常简单,直接输入数据就…

[怪毛匠子 整理] samtools学习及使用范例,以及官方文档详解 #第一步:把sam文件转换成bam文件,我们得到map.bam文件 system"samtools view -bS map.sam > map.bam"; #第二步:sort 一下 BAM 文件,得到map.sorted.bam system"samtools sort map.b/am map.sorted"; #第三步:创建一个关于bam的索引文件,我们得到一个map.sorted.b…

dataSet = [ #数据集 # 1 [0.697, 0.460], # 2 [0.774, 0.376], # 3 [0.634, 0.264], # 4 [0.608, 0.318], # 5 [0.556, 0.215], # 6 [0.403, 0.237], # 7 [0.481, 0.149], # 8 [0.437, 0.211], # 9 [0.666, 0.091], # 10 [0.243, 0.267], # 11 [0.245, 0.057], # 12 [0.343…

##################    Rancher v2.1.7  +    Kubernetes 1.13.4  ################ #######################    以下为声明  ##################### 此文档是在两台机上进行的实践,kubernetes处于不断开发阶段 不能保证每个步骤都能准确到同步开发进度,所以如果安装部署过程中有问题请尽量google 按照下面步骤能得到什么? 1.两台主机之一会作为Rancher的serve…

txt_filename = './files/python_baidu.txt' # 打开文件 file_obj = open(txt_filename, 'r', encoding='utf-8') # 读取整个文件内容 all_content = file_obj.read() # 关闭文件 file_obj.close() print(all_content) 结果: Python (英国发音:/ˈpaɪθən/ 美国发音:/ˈpaɪθɑːn/), 是一种面向对象的解释型计算机程序设计语…

{#portal.html#} {## ————————46PerfectCRM实现登陆后页面才能访问————————#} {#{% extends 'king_admin/table_index.html' %}#} {#{% block right-container-content %}#} {#<div class="container col-lg-offset-3">#} {# <h2><a class="form-signin-he…

假设有如下数据,我们使用plot函数作图 月龄 体重 月龄 体重  1 4.4 9 7.3 3 5.3 3 6.0 5 7.2 9 10.4 2 5.2 12 10.2 11 8.5 3 6.1 R语言中默认函数 abs   绝对值 sqrt   平方根 exp  e^x次方 log   自然对数 log2 log10  其他对数 sin  cos tan 三角函数 sinh cosh tanh  双曲函数 poly  正交多项式 polyroot  多项式求根 assign   赋值操作 等同…

以下函数只为满足常用的若干作图需求. 基本作图: plot(x).plot(x, y) #散点图,最多两个变量     #可使用参数type生成不同的效果图.常用'l'.'o'.'h',分别为折线图,点线图,垂线图.     #'s'和'S'是折线图,前者是先水平后垂直,后者是先垂直后水平:'n'是不显示,用于画空白图     #若需对三个以上变量两两作图,可先合并在一个数据框,再对数据框使用plot     #例:r=data.frame(x,y,z); plot(r); boxplot(x)…

R语言基础画图/绘图/作图 R语言基础画图 R语言免费且开源,其强大和自由的画图功能,深受广大学生和可视化工作人员喜爱,这篇文章对如何使用R语言作基本的图形,如直方图,点图,饼状图以及箱线图进行简单介绍. 0 结构 每种图形构成一个section,每个部分大致三部分构成,分别是R语言标准画图代码,R语言画图实例,和画图结果. R语言标准画图代码帮助你可以直接使用:help(funciton)查找,实例数据基本都来自内置包的数据,好了,直接切入主图,从最简单的点图开始吧. 1 点图 点图,简单的讲…

#中文 UTF-8编码   3.4.0library(Hmisc)mydata = read.table('clipboard',header = T)head(mydata)mycol=c(rgb(1,0,0,0.3),'cadetblue','darkseagreen',        'aquamarine3','darkslateblue','red','blue')coltextandlabel = 'black'####################################…

par()函数:用来设置画图参数的函数par()的作用直到画板被关闭为止 1.设置背景颜色 #设置背景颜色 > par(bg="gray") #设置画板背景色 > plot(rnorm(100)) #如果在plot函数中设置了背景颜色,则会覆盖par命令 #只设置坐标系内的背景颜色  > plot(rnorm(1000),type="n") > x<-par("usr") #提取坐标系范围 > rect(x[1…

需要注意的是,设置其中的柱子的宽度,间隔的宽度.有公式如下 width为柱子的宽度 space为间隔宽度 barnumbers 为柱子数量 那么xlim的设置右侧范围为:(width + space) * barnumbers + space…

参考:https://zhuanlan.zhihu.com/p/27360411 第一步.下载shapefile文件 一直都没有找到下载地址,死在了第一步 第二步.导入shp文件 第三步.画图…

本文版权归http://www.cnblogs.com/weibaar 本文旨在介绍R语言中ggplot2包的一些精细化操作,主要适用于对R画图有一定了解,需要更精细化作图的人,尤其是那些刚从excel转ggplot2的各位,有比较频繁的作图需求的人.不讨论那些样式非常酷炫的图表,以实用的商业化图表为主.包括以下结构: 1.画图前的准备:自定义ggplot2格式刷 2.画图前的准备:数据塑形利器dplyr / tidyr介绍 3.常用的商业用图: 1)简单柱形图+文本(单一变量) 2)分面柱形图…

先上图 R语言的REmap包拥有非常强大的空间热力图以及空间迁移图功能,里面内置了国内外诸多城市坐标数据,使用起来方便快捷. 开始 首先安装相关包 install_packages("devtools") install_packages("REmap") library(devtools) library(REmap) 我们来试试其强大的城市坐标获取功能 city<- c("beijing","上海") get_geo…

导入android项目后,R全部变红,控制台有下面的提示 意思是缺少一些资源,比如说图片之类的,然后我发现确实少了一张图片资源,导入图片资源后,依旧报错,如下  Error:Execution failed for task ':generalAPPN:mergeDebugResources'.  查阅了一些资料,发现是由于.9 png图片有问题,android studio "点九"是andriod平台的应用软件开发里的一种特殊的图片形式,文件扩展名为:.9.png 智能手机中有自动…

本文主要参考:来自segmentfault上的FinanceR的专栏 https://segmentfault.com/a/1190000004580610 并自己对生疏不解之处做了补充和注释. 当然,况客的R SDK的强大之处在于,你注册账号,进入网站的控制台后,会直接在浏览器模拟出一个RStudio的页面,可以直接运行操作,还可以设置. 而对于的qutke包,托管于github,所谓的API,应当就是指这个包的用法. 每个人会分配一个私钥.   个人感觉,现在他仅仅是提供了一个浏览器平台,以…

在日常学习或工作中经常会使用线性回归模型对某一事物进行预测,例如预测房价.身高.GDP.学生成绩等,发现这些被预测的变量都属于连续型变量.然而有些情况下,被预测变量可能是二元变量,即成功或失败.流失或不流失.涨或跌等,对于这类问题,线性回归将束手无策.这个时候就需要另一种回归方法进行预测,即Logistic回归. 在实际应用中,Logistic模型主要有三大用途: 1)寻找危险因素,找到某些影响因变量的"坏因素",一般可以通过优势比发现危险因素: 2)用于预测,可以预测某种情况发生的概…

含有x和y这两个变量的线性回归是所有回归分析中最常见的一种:而且,在描述它们关系的时候,也是最有效.最容易假设的一种模型.然而,有些时候,它的实际情况下某些潜在的关系是非常复杂的,不是二元分析所能解决的,而这时,我们需要多项式回归分析来找到这种隐藏的关系. 让我们看一下经济学里的一个例子:假设你要买一个具体的产品,而你要买的个数是q.如果产品的单价是p,然后,你要给y元.其实,这就是一个很典型的线性关系.而总价和产品数量呈正比例关系.下面,根据这个实例,我们敲击行代码来作它们的线性关系图: p…

转载自:http://blog.fens.me/r-linear-regression/ 前言 在我们的日常生活中,存在大量的具有相关性的事件,比如大气压和海拔高度,海拔越高大气压强越小:人的身高和体重,普遍来看越高的人体重也越重.还有一些可能存在相关性的事件,比如知识水平越高的人,收入水平越高:市场化的国家经济越好,则货币越强势,反而全球经济危机,黄金等避险资产越走强. 如果我们要研究这些事件,找到不同变量之间的关系,我们就会用到回归分析.一元线性回归分析是处理两个变量之间关系的最简单模型,是…

统计学上分布有很多,在R中基本都有描述.因能力有限,我们就挑选几个常用的.比较重要的简单介绍一下每种分布的定义,公式,以及在R中的展示. 统计分布每一种分布有四个函数:d――density(密度函数),p――分布函数,q――分位数函数,r――随机数函数.比如,正态分布的这四个函数为dnorm,pnorm,qnorm,rnorm.下面我们列出各分布后缀,前面加前缀d.p.q或r就构成函数名:norm:正态,t:t分布,f:F分布,chisq:卡方(包括非中心) unif:均匀,exp:指数,wei…

本文对应<R语言实战>前3章,因为里面大部分内容已经比较熟悉,所以在这里只是起一个索引的作用. 第1章       R语言介绍 获取帮助函数 help(), ? 查看函数帮助 example() 使用函数示例 vignette() 列出vignette文档 vignette("svmdoc") 打开对应文档 管理工作空间 getwd() 显示当前工作目录 setwd("mydirectory") 修改当前工作目录为mydirectory rm(objec…

一.扩展包的基本操作语句R安装好之后,默认自带了"stats" "graphics"  "grDevices" "utils" "datasets"  "methods" "base"这七个包,这七个包是不允许被卸载和删除的.1.扩展包的安装install.packages("扩展包名称") 也可以在手动安装,所有的安装包都可以在网站https:/…

前言: 在前面介绍了R的基础入门语法之后,现也将最近整理好的一些R的基础绘图实例提供给需要的朋友参考.(温馨提示:代码慎用!按照本博文实例进行练习的话最好能做到举一反三.代码多敲方为上策,切不可隔岸观火!) #基础R绘图 x <- : y <- + x* windows(,);plot(y) #默认情况绘制散点图type="p" windows(,);plot(y,type="l") #"l"即 line首字母 #正态分布随机数图 x…

大家熟知的画图ggplot2包 library(ggplot2) #查看系统自带的qplot的函数演示 example(qplot) #R语言的基本对象 向量.矩阵.数组.数据框.列表 R语言的变量都是对象(包括函数),都有mode和lenght方法可以调用 #善用向量化的ifelse()函数 #R语言的下标从1开始,与C等语言不同 #R语言的矩阵元素默认按列存储 #善用apply, sapply, lapply(list apply)等函数,其中sapply(代表simplified appl…