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一.实验目的与实验要求 1.实验目的 (1)学会将串行程序改为并行程序. (2)学会mpich2的使用. (3)学会openmp的配置. (4)mpi与openmp之间的比较. 2.实验要求 (1)将串行冒泡程序局部并行化,以降低时间消耗. (2) 理论上求出时间复杂度之比,根据结果得出时间消耗之比,进行比对分析. 二.实验设备(环境)及要求 Vs2013,mpich2 三.实验内容与步骤 1.实验一 mpi并行 (1)实验内容 1.写出一个冒泡排序程序,求出其时间复杂度,并运行得到相应的时间消…
用c语言写了kmeans算法的串行程序,再用mpi来写并行版的,貌似参照着串行版来写并行版,效果不是很赏心悦目~ 并行化思路: 使用主从模式.由一个节点充当主节点负责数据的划分与分配,其他节点完成本地数据的计算,并将结果返回给主节点.大致过程如下: 1.进程0为主节点,先从文件中读取数据集,然后将数据集划分并传给其他进程: 2.进程0选择每个聚类的中心点,并发送给其他进程: 3.其他进程计算数据块中每个点到中心点的距离,然后标出每个点所属的聚类,并计算每个聚类所有点到其中心点的距离之和,最后将这…
前言 本文中作者使用MPI的Python接口mpi4py来将自己的遗传算法框架GAFT进行多进程并行加速.并对加速效果进行了简单测试. 项目链接: GitHub: https://github.com/PytLab/gaft PyPI: https://pypi.python.org/pypi/gaft 正文 我们在用遗传算法优化目标函数的时候,函数通常都是高维函数,其导数一般比较难求取.这样我们的适应度函数计算通常都是比较费时的计算. 例如在使用遗传算法寻找最优结构时候通常需要调用量化软件进行…
00][100].在创建方阵时,方阵的阶数N(N<100)由外部输入.然后用两层"for循环"来给方阵 p左上角 N×N个位置赋值.具体实现如下: /* * 定义矩阵阶数N */ int N; /* * 定义一个全局矩阵 */ int p[100][100]; /* * 用随机数生成矩阵 */ void create(){ int i,j; for(i=0;i<N;i++) { for(j=0;j<N;j++) { int a=rand()%15;//产生随机数,并赋…
大数据集群计算利器之MPI/OpenMP ---以连通域标记算法并行化为例 1 背景 图像连通域标记算法是从一幅栅格图像(通常为二值图像)中,将互相邻接(4邻接或8邻接)的具有非背景值的像素集合提取出来,为不同的连通域填入数字标记,并且统计连通域的数目.通过对栅格图像中进行连通域标记,可用于静态地分析各连通域斑块的分布,或动态地分析这些斑块随时间的集聚或离散,是图像处理非常基础的算法.目前常用的连通域标记算法有1)扫描法(二次扫描法.单向反复扫描法等).2)线标记法.3)区域增长法.二次扫描法由…
第三章MPI编程 3.1 MPI简单介绍 多线程是一种便捷的模型,当中每一个线程都能够訪问其他线程的存储空间.因此,这样的模型仅仅能在共享存储系统之间移植.一般来讲,并行机不一定在各处理器之间共享存储,当面向非共享存储系统开发并行程序时,程序的各部分之间通过来回传递消息的方式通信.要使得消息传递方式可移植,就须要採用标准的消息传递库.这就促成的消息传递接口(Message Passing Interface, MPI)的面世,MPI是一种被广泛採用的消息传递标准[1]. 与OpenMP并行程序不…
第三章MPI计划 3.1 MPI简单介绍 多线程是一种便捷的模型,当中每一个线程都能够訪问其他线程的存储空间.因此,这样的模型仅仅能在共享存储系统之间移植. 一般来讲,并行机不一定在各处理器之间共享存储,当面向非共享存储系统开发并行程序时,程序的各部分之间通过来回传递消息的方式通信.要使得消息传递方式可移植,就须要採用标准的消息传递库. 这就促成的消息传递接口(Message Passing Interface, MPI)的面世.MPI是一种被广泛採用的消息传递标准[1]. 与OpenMP并行程…
针对大数据的计算,很多程序通过搭建mpi集群进行加速,并取得了很好的效果.算法内部的加速,当前的并行化趋势是利用GPU显卡进行算法加速.针对并行性非常好的算法,GPU加速效果将远大于集群带来的加速效果.所以,如果我们面临非常多的数据,针对数据的处理算法有具有很好的内部并行性,则我们可以将mpi和GPU结合,获得更大的加速比. 将mpi和GPU结合的产物就是GPU集群.它可以为我们带来非常高的加速比.虽说NVIDIA的cuda为我们提供了类C语言的编程环境,但是cuda还不是C语言,这就为mpi和…
原文地址http://blog.csdn.net/qinggebuyao/article/details/8059300 3.1 MPI简介 多线程是一种便捷的模型,其中每个线程都可以访问其它线程的存储空间.因此,这种模型只能在共享存储系统之间移植.一般来讲,并行机不一定在各处理器之间共享存储,当面向非共享存储系统开发并行程序时,程序的各部分之间通过来回传递消息的方式通信.要使得消息传递方式可移植,就需要采用标准的消息传递库.这就促成的消息传递接口(Message Passing Interfa…
这里我先对MPI进行一下简单的介绍,MPI的全称是Message Passing Interface,即消息传递接口. 它并不是一门语言,而是一个库,我们可以用Fortran.C.C++结合MPI提供的接口来将串行的程序进行并行化处理,也可以认为Fortran+MPI或者C+MPI是一种再原来串行语言的基础上扩展出来的并行语言. 它是一种标准而不是特定的实现,具体的可以有很多不同的实现,例如MPICH.OpenMPI等. 它是一种消息传递编程模型,顾名思义,它就是专门服务于进程间通信的. MPI…