视频  https://www.bilibili.com/video/av7973580/ 教材 Molecular biology of the gene 7th edition  J.D. Watson et. al 调控RNA 一.细菌中RNA介导的调控 sRNA对翻译的激活与抑制 色氨酸trp操纵子 色氨酸浓度高时: 先导核糖体顺利通过先导RNA的两个Trp密码子 占据位置2 位置3.4形成发夹 形成衰减子(4后面有polyU终止信号) 色氨酸浓度低时: 先导核糖体被两个Trp密码子阻滞…

视频  https://www.bilibili.com/video/av7973580/ 教材 Molecular biology of the gene 7th edition  J.D. Watson et. al RNA剪接 真核生物成熟RNA的形成需要剪接 有些pre-mRNA存在不只一种剪接方式,成为可变剪接 一.RNA剪接的化学基础 1.决定剪接位点的特定序列 3'端是多聚嘧啶区 2.当内含子两边的外显子连接时,内含子是以套索(lariat)除去的 二.剪接体 1.RNA剪接是由一…

视频  https://www.bilibili.com/video/av7973580?from=search&seid=16993146754254492690 教材 Molecular biology of the gene 7th edition  J.D. Watson et. al 转录的调控 原核生物的转录调控 一.转录调控原理 1.基因表达由调控蛋白控制 激活因子 activator 抑制因子 repressor 它们通常都是DNA结合蛋白 2.大多数的激活因子和抑制因子在转录起…

位点特异性重组 和 DNA转座 视频 https://www.bilibili.com/video/av7973580/ 教材 Molecular biology of the gene 7th edition  J.D. Watson et. al 很多重要DNA重排是由两类重要遗传重组造成的 保守位点特异性重组CSSR 两端特定序列之间 需要重组酶 形成联会复合体 转座重组 transpositional recombination 不一定特定 一.保守性位点特异性重组 1.CSSR的三种类…

视频  https://www.bilibili.com/video/av7973580/ 教材 Molecular biology of the gene 7th edition  J.D. Watson et. al 翻译 翻译机器的组成 mRNA tRNA aminoacyl tRNA synthetase ribosome 一.信使RNA 1.多肽链是由可读框决定的 含有多个ORF的mRNA叫多顺反子 只有1个ORF的mRNA叫单顺反子 2.原核细胞mRNA具有核糖体结合位点,可以募集翻…

视频  https://www.bilibili.com/video/av7973580?from=search&seid=16993146754254492690 教材 Molecular biology of the gene 7th edition  J.D. Watson et. al DNA的复制,染色体组装 一.Replication Enzymes 复制酶 1.酶结构: 手状结构.thumb不动,而finger动. 手掌:①聚合作用. β折叠片层 2个二价金属离子(Mg2+orMn…

视频  https://www.bilibili.com/video/av7973580?from=search&seid=16993146754254492690 教材 Molecular biology of the gene 7th edition  J.D. Watson et. al 转录机制 一.RNA聚合酶和转录周期 1. 细菌:一种转录酶 真核:三种转录酶(植物+2种) Pol I   大核糖体RNA前体 Pol II  几乎转录所有蛋白质编码 Pol III tRNA,小的核R…

视频  https://www.bilibili.com/video/av7973580?from=search&seid=16993146754254492690 教材 Molecular biology of the gene 7th edition  J.D. Watson et. al DNA复制相关实验 一. 1.聚合酶活力测定 掺入法 膜结合法 1)DNA聚合酶以标记的dNTP为底物反应 2)分离dNTP 硝酸纤维素滤膜(带正电) 点样 缓冲溶液洗脱dNTP 50mmol·L-1 N…

视频  https://www.bilibili.com/video/av7973580?from=search&seid=16993146754254492690 教材 Molecular biology of the gene 7th edition  J.D. Watson et. al DNA 同源重组 一.Classic Pathway Ku 70-80 蛋白寻找断裂 招募DNA PKc DNA PKc 招募 Artemis 其具有内外切活性 加工末端(trim) 连接酶修复 这种方法…

视频  https://www.bilibili.com/video/av7973580?from=search&seid=16993146754254492690 教材 Molecular biology of the gene 7th edition  J.D. Watson et. al DNA的突变和修复 一.复制错误及修复 1.突变的本质 点突变 大范围插入.缺失 染色体结构整体重排 与转座子插入,细胞重组异常活动有关 染色体上有重组热点 微卫星DNA极易发生突变 如CA二核苷酸序列重…

详细MIT算法导论笔记 (网络链接) 第一讲:课程简介及算法分析 (Sheridan) 第二讲:渐近符号.递归及解法  (Sheridan) 第三讲:分治法(1)(Sheridan) 第四讲:快排及随机化算法 (Sheridan) 第五讲:线性时间排序 (Sheridan) 第六讲:顺序统计.中值(Sheridan)…

未经许可谢绝以任何形式对本文内容进行转载! 本篇接着上一篇对kernel的分析. (5)pte_t * pgdir_walk(pde_t *pgdir, const void *va, int create) 这个函数是整个JOS操作系统页式内存管理最重要的函数.在这个函数中,JOS的设计者要求我们对于给定的一个页目录"pgdir",返回线性地址(这是虚拟地址)"va"对应的页表入口地址.先用MIT自己的一张图来解释下整个地址转换的过程: 在本函数中,返回值就是上图…

未经许可谢绝以任何形式对本文内容进行转载! 一.环境配置 关于MIT课程中使用的JOS的配置教程网上已经有很多了,在这里就不做介绍,个人使用的是Ubuntu 16.04 + qemu.另注,本文章中贴出的代码均是JOS中未经修改的源代码,其中有一些细节是MIT课程中要求学生自己实现的. 二.Boot Loader代码分析 1.boot.S(AT&T汇编格式) #include <inc/mmu.h> # Start the -bit protected mode, jump into…

未经许可谢绝以任何形式对本文内容进行转载! 在文章开头不得不说的是,因为这部分的代码需要仔细理清的东西太多,所以导致这篇分析显得很啰嗦,还请谅解. 我们在上一篇文章已经分析了Boot Loader的功能,现在我们来分析由Boot Loader加载到内存里的kernel.从MAKEFILE文件可以看出kernel由以下几部分代码组成(注:这里给出的列表是进行lab2时的代码,即比lab1多了pmap.c等文件,由lab1更新到lab2需要用到Git,具体操作仅贴出参考链接:http://www.x…

scRNA-seq做完该做的QC.normalization.imputation.clustering.trajectory和integration,就会开始做转录调控的分析了. 核心就是围绕着TF转录因子做文章 预测TF的靶基因 鉴定regulon 大部分都是高通量的预测,准确性有待论证,需要很好的实验验证设计. 预测的工具不要太多: MARINa — Andrea Califano - paper SCENIC 什么是regulon? 这是一个高通量测序后发明的词,其实就是被同一个调控元件…

https://ocw.mit.edu/courses/find-by-topic/#cat=mathematics Course # Course Title Level 1.010 Uncertainty in Engineering Undergraduate 1.017 Computing and Data Analysis for Environmental Applications Undergraduate 2.003J Dynamics and Control I (Fall 2…

单细胞在脑科学方面的应用 Session 1: Deciphering the Cellular Landscape of the Brain Using Single Cell Transcriptomics Single cell/nucleus transcriptomics has emerged as a powerful approach to classify cell types and dynamic cell states in any multicellular organ…

注:从进入生信领域到现在,已经过去快8年了.生物信息学包含了我最喜欢的三门学科:生物学.计算机科学和数学.但是如果突然问起,什么是生物信息学,我还是无法给出一个让自己满意的答案.于是便有了这篇博客. 起源 据说在1970年,荷兰科学家Paulien Hogeweg和Ben Hesper最早在荷兰语中创造了"bioinformatica"一词,英语中的"bioinformatics" 在1978年首次被使用.这两位科学家当时使用该词来表示: The study of…

题目:Deep Protein Methylation Profiling by Combined Chemical and Immunoaffinity Approaches Reveals Novel PRMT1 Targets (结合层析法和免疫沉淀法的蛋白甲基化的深度检测技术发现了PRMT1新的靶标蛋白) 期刊名:Molecular & Cellular Proteomics (MCP) 发表日期:2019.11.1 IF: 4.828 DOI:10.1074/mcp.RA119.001…

中国计算机学会推荐国际学术会议 (计算机系统与高性能计算) 一.A类 序号 会议简称 会议全称 出版社 网址 1 ASPLOS Architectural Support for Programming Languages and Operating Systems ACM http://www.acm.org/pubs/contents/proceedings/series/asplos 2 FAST Conference on File and Storage Technologies US…

类别如下计算机系统与高性能计算,计算机网络,网络与信息安全,软件工程,系统软件与程序设计语言,数据库.数据挖掘与内容检索,计算机科学理论,计算机图形学与多媒体,人工智能与模式识别,人机交互与普适计算,前沿.交叉与综合 中国计算机学会推荐国际学术会议 (计算机系统与高性能计算) 一.A类 序号 会议简称 会议全称 出版社 网址 1 ASPLOS Architectural Support for Programming Languages and Operating Systems ACM htt…

http://gmod.org/wiki/MAKER_Tutorial 简单好用 identify repeats, to align ESTs and proteins to the genome, and to automatically synthesize these data into feature-rich gene annotations, including alternative splicing and UTRs, as well as attributes such as…

英文投稿的一点经验[转载] From: http://chl033.woku.com/article/2893317.html 1. 首先一定要注意杂志的发表范围, 超出范围的千万别投,要不就是浪费时间;另外,每个杂志都有他们的具体格式要求,一定要按照他们的要求把论文写好,免得浪费时间,前些时候,我的一个同事向一个著名的英文杂志投稿,由于格式问题,人家过两个星期就退回来了,而且说了很多难听的话,说投稿前首先就应该看清楚他们的格式要求:2. 论文写作一定要言简意赅,特别是摘要,引言和结论部分,特别…

The top 100 papers Nature explores the most-cited research of all time. The discovery of high-temperature superconductors, the determination of DNA’s double-helix structure, the first observations that the expansion of the Universe is accelerating —…

转自:http://www.gogoqq.com/ASPX/8390905/JournalContent/1303140588.aspx 研究了近半年的算法,记录下来给自己一个交代,也应该是考G前地最后一篇日志了. Weighted Gene Co-Expression Network Analysis中文名有翻译成加权关联网络分析的,感觉不是很恰当,英文来得比较直接.本来是佟昊从老汪那拿的一个课题,因为看起来比较有意思就把文章找来慢慢啃,到现在算是捣鼓出点名堂了.方法是UCLA的一个教授提出来…

A curated list of Artificial Intelligence (AI) courses, books, video lectures and papers. Updated 2018 Copied from: https://medium.com/datadriveninvestor/a-curated-list-of-artificial-intelligence-ai-courses-books-video-lectures-and-papers-d2f584ca14f…

1.平面操作工具箱 http://cathy.ijs.si/~leon/planman.html 2.SimMechanics 工具箱 (这个好像不是免费的) http://www.mathworks.com/access/helpdesk/help/toolbox/physmod/mech/mech.shtml 3.gaot工具箱(遗传算法工具箱) http://www.dytrol.com/viewFile.asp?Boardid=11&ID=263 4.Optimization Toolb…

MATLAB Toolboxes top (Top) Audio - Astronomy - BiomedicalInformatics - Chemometrics  - Chaos - Chemistry - Coding - Control - Communications - Engineering - Data Mining - Excel - FEM - Fuzzy - Finance - GAs - Graph - Graphics - Images - ICA - Kernel …

中国计算机学会推荐国际学术期刊会议 2014年12月,中国计算机学会(CCF)启动新一轮<)计算机体系结构/高性能计算/存储系统: )计算机网络:)网络与信息安全:)软件工程/系统软件/程序设计语言:)数据库/数据挖掘/内容检索:)计算机科学理论:)计算机图形学与多媒体:)人工智能:)人机交互与普适计算:)交叉/新兴/综合等.期刊和会议的推荐类别保持不变,仍分为A.B.C三类.其中,会议论文指“Full paper”或“regular paper”,会议上发表的Short paper, Post…

| Main | Site Index | Download | mimetic A free/GPL C++ MIME Library mimetic is a free/GPL Email library (MIME) written in C++ designed to be easy to use and integrate but yet fast and efficient. It is based on the C++ standard library and heavily us…