转载:http://fhqdddddd.blog.163.com/blog/static/18699154201241014835362/ http://blog.sina.com.cn/s/blog_4476400f0100iq0x.html   EST----对EST序列进行冗余查找,利用CD_HIT软件聚类,快速批量去除冗余序列 est-trimer(去掉帽子和尾巴,去掉太短而不可信的) RepeatMaster(去掉转座子等重复) seqclean(去除载体,线粒体叶绿体等序列) CAP…

EST:表达序列标签,expressed sequence tags . 顾名思义,很好理解,就是表达出来的序列,即从基因组DNA上表达出来的RNA,但是我们没法测序RNA,所以我们最终测的是表达序列的cDNA片段. “标签”:就是指这些序列可能比较短,但是可以用来标定一个物种. 常见下载方式有两种: 1. NCBI Web下载 https://www.ncbi.nlm.nih.gov/dbEST/ 打开,搜索你要的物种,比如 Camellia ,可以看到结果EST (50287). Web下载…

A bracket(括号) sequence is a string containing only characters "(" and ")".A regular bracket sequence is a bracket sequence that can be transformed into a correct arithmetic expression by inserting characters "1" and "+&q…

Est--编码序列,gene 片段且具有标签 其中,est数据库中是类似测序1.测序2.测序3这样的序列.实验室测得的序列是cDNA,通过上图方法拼接,电脑克隆(dbest).如果有overlap则认为两个序列来自于同一个gene,overlap的碱基数目是40(不建议低于30,不建议高于40),过少容易拼接乱,过多对碱基突变的容忍性差.就一条序列来说,将比对后延长的结果进行二次比对,以此类推,直到不能延长为止. est数据库的覆盖率超过95%. 先利用其他数据库(eg:引物数据库.末端数据库)…

文章版权由作者李晓晖和博客园共有,若转载请于明显处标明出处:http://www.cnblogs.com/naaoveGIS/. 1.前言 在之前的五个章节中,我们在第一章节里介绍了WebGIS的基本框架和技术,第二章节里介绍了什么是瓦片行列号以及计算它的原因,第三章节里介绍了如何通过地理范围计算出这个范围内瓦片的行列号,第四和第五章节里介绍了在得到瓦片行列号后如何获得离线和在线地图的URL,这个章节里,我们将介绍在通过URL得到瓦片后,如何将其显示在浏览器相对应的地方,拼接出整块地图. 2.左…

一.序列(本文使用python3.5)############################################################# 列表.元组 字符窜都是序列#特点:#1.通过索引可以获取特定的元素#2.可以通过切片操作获取一个小的序列#基本操作str="abc";str1="efg";print(len(str));#获取序列长度print(str+str1);#序列拼接print(str*5);#使序列重复5次 abcabcabca…

这里面都是一些比较杂的东西,没什么实际意义.主要是为了,后面能跑一个程序: Stitcher: 抠细节: http://docs.opencv.org/2.4.2/modules/stitching/doc/high_level.html?highlight=stitcher#stitcher Stitcher是啥? class Stitcher High level image stitcher. It’s possible to use this class without being aw…

bowtie:短序列比对的新工具(转) (2014-11-17 22:15:24) 转载▼ 标签: 转载   原文地址:bowtie:短序列比对的新工具(转)作者:玉琪星兆 Bowtie是一个超级快速的,较为节省内存的短序列拼接至模板基因组的工具.它在拼接35碱基长度的序列时,可以达到每小时2.5亿次的拼接速度. Bowtie并不是一个简单的拼接工具,它不同于Blast等.它适合的工作是将小序列比对至大基因组上去.它最长能读取1024个碱基的片段.换言之,bowtie非常适合下一代测序技术. 在…

从底层谈WebGIS 原理设计与实现(六):WebGIS中地图瓦片在Canvas上的拼接显示原理 作者:naaoveGI…    文章来源:naaoveGIS    点击数:1145    更新时间:2014-9-14 摘要:在之前的五个章节中,我们在第一章节里介绍了WebGIS的基本框架和技术,第二章节里介绍了什么是瓦片行列号以及计算它的原因,第三章节里介绍了如何通过地理范围计算出这个范围内瓦片的行列号,第四和第五章节里介绍了在得到瓦片行列号后如何获得离线和在线地图的URL,这个章节里,我们将…

流程控制 • 流程控制语句作用 ▪ 选择:根据条件跳转到不同的执行序列. ▪ 循环:根据条件反复执行某个序列. ▪ 跳转:据条件返回到某执行序列. • 流程控制语句类型 ▪ 条件语句:关键字为if.else和else if. ▪ 选择语句:关键字为switch.case和select. ▪ 循环语句:关键字为for和range. ▪ 跳转语句:关键字为goto. 条件语句 • 语法如下 // 1if condition { ... } // 2 if condition { ... } else…