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网上已经有很多代码了,但是注释的都不全,看起来很费解,我自己加了一些注释,重新发出来,尽可能的通俗易懂 读取前需要先安装库 pip install nibabel pip install matplotlib from nibabel.viewers import OrthoSlicer3D from nibabel import nifti1 import nibabel as nib from matplotlib import pylab as plt import matplotlib…
简介 VoxelMorph使用CNN实现了非监督的医学图像配准,速度较之前的方法有很大提升.主要特点有: 提出了一种基于学习的解决方案,不需要在训练过程中获取诸如ground truth对应或解剖标志等信息: 提出一个参数跨种群共享的CNN函数,通过函数评估实现配准: 参数优化的方法可以使用各种代价函数,从而适应各种任务: VoxelMorph这个组发表了多篇论文,有不同的使用场景,具体的区别请看论文,但代码都在这一个库 下载代码: https://github.com/voxelmorph/v…
Source:http://fsl.fmrib.ox.ac.uk/fsl/fslwiki/DualRegression Research Overview A common need for analyses such as ICA for resting-state FMRI is to run a group-average ICA, and then, for each subject, estimate a "version" of each of the group-leve…
Source: http://fsl.fmrib.ox.ac.uk/fsl/fslwiki/MELODIC; https://fsl.fmrib.ox.ac.uk/fsl/fslwiki/MELODIC/FAQ#How_do_I_transform_the_MELODIC_results_from_a_low-resolution_space_to_a_higher-resolution_one.3F Research Overview MELODIC ( Multivariate Explor…
如:[gzip]命令,可执行: (tf) duanyongchun@hc1217:~/pycharm_projects /3DUNet-Pytorch /data$ gzip --help 输出: 由图可知[-d]表示解压缩,此时我们就可以执行以下命令解压缩: (tf) duanyongchun@hc1217:~/pycharm_projects /3DUNet-Pytorch /data$ gzip -d data0001.nii.gz…
from nibabel.viewers import OrthoSlicer3D from nibabel import nifti1 import nibabel as nib from matplotlib import pylab as plt import matplotlib # matplotlib.use('TkAgg') # 需要查看的nii文件名文件名.nii或nii.gz filename = 'F:/BaiduNetdiskDownload/COVID-19CTSeg/0…
FreeSurfer 是美国哈佛-麻省理工卫生科学与技术部和马萨诸塞州总医院共同开发的一款磁共振数据处理软件包,是基于 Linux 平台的全免费开源软件.FreeSurfer 能完成对高分辨率的 MRI 图像进行分割.配准及三维重建,其处理过程主要包含去头骨.B1 偏差场校正.体数据配准.灰白质分割.面数据配准等.FreeSurfer 可以方便地处理大脑 MRI 图像,并生成高精度的灰.白质分割面和灰质.脑脊液分割面,根据这两个表面可以计算任何位置的皮质厚度及其他面数据特征如皮质 外表面积.曲率…
利用MONAI加速医学影像学的深度学习研究 Accelerating Deep Learning Research in Medical Imaging Using MONAI 医学开放式人工智能网络(MONAI)是一个免费提供.社区支持.基于Pythorch的医疗影像学深度学习框架.它为开发训练工作流程提供了领域优化的基础功能. 在4月份发布的gtc2020 alpha版本的基础上,MONAI现在发布了0.2版本,为医学成像研究人员提供了新的功能.示例和研究实现,以加快人工智能开发的创新步伐.…
系列目录: Node.js 教程 01 - 简介.安装及配置 Node.js 教程 02 - 经典的Hello World Node.js 教程 03 - 创建HTTP服务器 Node.js 教程 04 - 模块系统 Node.js 教程 05 - EventEmitter(事件监听/发射器) Node.js 教程 06 - 函数 ▁▃▅ Node.js 教程 01 - 简介.安装及配置 ▅▃▁ 简单的说 Node.js 就是运行在服务端的 JavaScript. Node.js 是一个基于Ch…
1.Nutch简介 Nutch是一个由Java实现的,开放源代码(open-source)的web搜索引擎.主要用于收集网页数据,然后对其进行分析,建立索引,以提供相应的接口来对其网页数据进行查询的一套工具.其底层使用了Hadoop来做分布式计算与存储,索引使用了Solr分布式索引框架来做,Solr是一个开源的全文索引框架,从Nutch 1.3开始,其集成了这个索引架构. Nutch目前最新的版本为version1.4. 1.1 Nutch的目标 Nutch 致力于让每个人能很容易,同时花费很少…