1)介绍 在分析序列时,我们通常对特定的连续子序列感兴趣. 例如,a矢量可以被认为是按字母顺序排列的小写字母序列. 我们将第一个五个字母(a到e)称为连续的子序列,而仅包含元音的子序列不会是连续的. 分析任务仅关注区域的几何形状,而忽略基础序列值的情况并不少见. 索引列表是选择子序列的简单方法. 然而,连续子序列的稀疏表示将是一个范围,即开始位置和宽度的配对,如在用窗口提取序列时.Bioconductor中有两个中心类别可用于表示范围:IRanges类中定义的IRanges类用于表示单个空间上定…