ceRNA 不同于mRNA, lncRNA, ncRNA 等概念,其指的既不是某一种类型的RNA(比如mRNA, lncRNA), 也不是某一类的RNA(如ncRNA); ceRNA 其实指的是不同种类的RNA之间的调控机制,英文名为 competing endogenous RNA , 翻译成中文叫做 " 竞争性内源RNA "; 在这个概念中有两个关键词,竞争和内源, 内源指的是这个调控机制本来在生物体内就存在,而竞争就是这个调控机制的核心: 对于miRNA, 研究的都很成熟,其通过…

水稻是我国重要的粮食作物,稻曲病是水稻三大病害之一,不仅造成稻米产量损失,更重要的是稻曲球中的稻曲菌素的毒性和致畸作用,给人畜健康带来严重威胁.病原菌对植物的侵袭是由病原菌的毒力和植物免疫系统相互作用决定的.深入研究这种复杂的互作过程,对全面理解细菌如何引起植物病害以及植物如何保护自己免受病原菌侵染至关重要. 蛋白翻译后修饰(PTMs)在病原菌与植物互作过程中起关键作用.最新研究发现,组蛋白赖氨酸2-羟基异丁酰化(Khib)修饰是拟南芥.水稻.烟草等多种植物中保守的表观基因组标记,参与植物对暗诱…

蛋白质琥珀酰化修饰 (succinylation) ,作为赖氨酸酰化修饰家族的重要一员,于2011年由芝加哥大学赵英明教授团队在Nature Chemical Biology 发文被首次报道,并被评为该杂志创刊10年39篇精品论文之一 [1].随后,关于琥珀酰化的调控酶系统(转移酶writer和去修饰酶eraser)和生物学功能也有了越来越多的报道.如浙江大学转化医学研究院吕志民教授课题组在Nature发文,首次发现了组蛋白琥珀酰化修饰的转移酶--KAT2A,可以调节组蛋白H3K79位点琥珀酰化…

冠状病毒是一种自然界普遍存在的单股正链RNA病毒,电镜下呈日冕状或皇冠状,故命名为冠状病毒.在本世纪初短短20年中,共爆发了三次冠状病毒疫情,即2003年SARS-CoV.2012年MERS-CoV和2019年SARS-CoV-2,极易引起呼吸道系统感染并在人与人间传播,严重威胁人类生命.其中,SARS-CoV-2如今更是造成了全球300多万人死亡,1.4亿人感染,再次刷新了人们对于冠状病毒危害性的认识.因此,准确.深入地研究冠状病毒及其感染宿主细胞过程的生物学特征,并开发高效地防治药物及疫苗,…

巨噬细胞 (macrophage, Mϕ) 是先天免疫系统中重要的免疫细胞,也是血液.淋巴和所有哺乳动物组织类型中最常见的吞噬细胞,具有极强的功能多样性.其中,肿瘤微环境组织中存在的巨噬细胞也被称作肿瘤相关巨噬细胞 (tumor-associated macrophages, TAMs).一般来说,在不同生理病理因素刺激下,巨噬细胞可分化成两种极化状态,即经典活化的M1型和替代活化的M2型.其中,M1型参与促炎反应,同时也发挥抗肿瘤活性,而M2型则参与抗炎反应,并能通过肿瘤免疫抑制等作用促进肿瘤…

------------------------------- Long noncoding RNAs are rarely translated in two human cell lines. (蛋白,多肽) Bánfai B, Jia H, Khatun J, Wood E, Risk B, Gundling WE Jr, Kundaje A, Gunawardena HP, Yu Y, Xie L, Krajewski K, Strahl BD, Chen X, Bickel P, Gi…

长链非编码RNA(lncRNA) 转自:http://blog.sina.com.cn/s/blog_909da11301010bkz.html     长链非编码RNA(lncRNA)是一类转录本长度超过200nt的RNA分子,它们并不编码蛋白,而是以RNA的形式在多种层面上(表观遗传调控.转录调控以及转录后调控等)调控基因的表达水平. lncRNA起初被认为是基因组转录的“噪音”,是RNA聚合酶II转录的副产物,不具有生物学功能.然而,近年来的研究表明,lncRNA参与了X染色体沉默,基因组…

阴茎科学:一氧化氮(NO),为什么亚洲人是最硬 尼堪巴图鲁   ​关注他 2,911 人赞同了该文章   https://zhuanlan.zhihu.com/p/55941740 超级少儿不宜.. 超过国人平均35% 摘要 一氧化氮(NO)是引起阴茎勃起的主谋.文章调查不同人种的NO分泌水平及性障碍风险. 目录 1.0:一氧化氮(NO)简介 1.1:阴茎勃起功能障碍(ED)简介 1.2:分泌NO的两条通路 1.3:影响勃起功能的eNOS基因 2.0:基因与NO分泌水平 2.1:不同人种的G89…

miRTarBase 是一个手 收集的,经过实验验证过miRNA靶基因的数据库,对于每条miRNA靶基因的记录, 都会赋予1个唯一的 miRNA-target interactions (简称MTs) 编号,比如MIRT000012,目前miRTarBase 的版本为V7.0, 2017年9月15号更新,共收录了23个物种.4076 个miRNA, 23054 个基因,422147 个靶基因相互作用. 网址: http://mirtarbase.mbc.nctu.edu.tw/php/index…

DNA motif 搜索算法总结 2011-09-15 ~ ADMIN 翻译自:A survey of DNA motif finding algorithms, Modan K Das et. al., BMC Bioinformatics 2007, 8(suppl 7):S21 dio:10.1186/1471-2105-8-s7-s21 DNA功能域(motif)简单地讲就是一段特定模式的DNA序列,它之所以可以具有生物学功能是因为它的特殊序列可以和调控蛋白结合,比如转录因子,从而可以在…