bowtie:短序列比对的新工具(转) (2014-11-17 22:15:24) 转载▼ 标签: 转载   原文地址:bowtie:短序列比对的新工具(转)作者:玉琪星兆 Bowtie是一个超级快速的,较为节省内存的短序列拼接至模板基因组的工具.它在拼接35碱基长度的序列时,可以达到每小时2.5亿次的拼接速度. Bowtie并不是一个简单的拼接工具,它不同于Blast等.它适合的工作是将小序列比对至大基因组上去.它最长能读取1024个碱基的片段.换言之,bowtie非常适合下一代测序技术. 在…

转载:http://blog.sina.com.cn/s/blog_4af3f0d20100fq5i.html 短序列组装(Sequence assembly)几乎是近年来next-generation sequencing最热门的话题.简单来说,就是把基因组长长的序列打断(shotgun sequencing),因为我们不知道基因组整条序列是如何排列(成一条链,最后成为一条染色体)组合(如何区分不同染色体)的,而我们又无法实现一次 把整条长序列完整测序(现在有单子测序可能是一个新的sunlig…

原文地址 导语:"我很惊讶地发现,现在许多程序员讨论的内容几乎和我十多年前刚开始做 Java 时几乎完全一样.要知道,我们生存的这个行业号称是变化飞快的.其实,这十几年时间,在开发领域已经有了非常多的新内容涌现出来,即便是 Java 开发这个领域,也有了很多变化--" --郑晔 1995年5月23日,Java 语言正式诞生: 1996年1月,JDK1.0发布: 2000年5月,JDK1.3.JDK1.4 相继发布: 2004年9月,J2SE 1.5发布: 2009年12月,Java E…

本文转载自:http://tech.ifeng.com/a/20180713/45062331_0.shtml 选自TensorFlow 作者:Michael Tyka 机器之心编译 参与:路.王淑婷 今日,TensorFlow 推出新工具 Seedbank,用户可在该平台上查找大量机器学习示例(包括教程.研究文章等等),这些示例还具备相应的 Colab notebook,使应用更加简单明了. 工具链接:http://tools.google.com/seedbank/ 发现并开始新的机器学习项…

jQuery 1.5 发布的时候 john resig 大神说所用的代码优化程序从Google Closure切换到UglifyJS,新工具的压缩效果非常令人满意. UglifyJS 是一个服务端node.js的压缩程序.我测试了一下压缩率确实比较高. 所以值得写篇文章推荐下. 你也可以尝试一下在线版的Uglifyjs: 如果你对 uglifyjs 有兴趣可以按照以下安装方式进行安装. 1. 安装 node.js 环境 2. 进入 右上角 “Download” ZIP下载整个包. 3. 解压打开…

[Android]详解7.0带来的新工具类:DiffUtil 标签: diffutil 2017-04-17 18:21 226人阅读 评论(0) 收藏 举报  分类: Android学习笔记(94)    目录(?)[+]   本文出自: [张旭童的博客] 博客地址:http://blog.csdn.net/zxt0601/article/details/52562770 一 概述 DiffUtil是support-v7:24.2.0中的新工具类,它用来比较两个数据集,寻找出旧数据集—>新数据…

Google 正在将云端硬盘 Drive 转变成更强大的文件备份工具.很快,Google Drive 将能监测并备份你电脑上的(几乎)所有文件,只要是你勾选的文档,Drive 就能同步至云端. 具体来说,这项改变将在 6 月 28 日到来,届时 Google 将会推出一款名为 Backup and Sync(备份与同步)的应用.看起来 Backup and Sync 似乎在未来某个时间点将取代 Google 的 Drive 和 Photos(照片同步与管理)应用.目前 Google 正在向普通用…

新工具 Scapy 1.环境: 命令: pip install scapy 启动终端: 看这花里胡哨的界面那就成功啦! 注意上图中的INFO信息,如果没有安装可选包,部分功能不可用,在需要的时候单独安装即可. 注意: 如果没有配置环境变量,那么你需要切换到root用户! 基本命令: ls() 密密麻麻一大堆!估计你也不看!但是这正是Scapy的强大之处! 命令: lsc() 会列出scapy所有命令 help() 显示帮助 命令: show() 显示详细信息 小操作: 命令: a=IP(ttl=…

☞ ░ 前往老猿Python博文目录 ░ 一.引言 在<Python音视频开发:消除抖音短视频Logo和去电视台标的实现详解>节介绍了怎么通过Python+Moviepy+OpenCV实现消除视频Logo的四种方法,并提供了详细的实现思路和实现代码,但这种原生态的应用不适合开发人员以外的其他人员使用,提供一个图形界面的工具程序是比较好的解决方案,本文就介绍实现这样一个图形化工具的步骤. 本节的背景知识都在<Python音视频开发:消除抖音短视频Logo和去电视台标的实现详解>介绍了…

编辑推荐: 内切酶经过改造可以成为强大的DNA编辑工具,比如ZFN.TALEN.风头正劲的CRISPR–Cas系统和充满争议的NgAgo技术.不过这些技术都是通过序列识别来实现靶向切割的,会受到序列偏好的限制.南京大学的研究团队九月十五日在Genome Biology杂志上发表了一项突破性成果.他们开发了结构引导的DNA编辑新技术,不再受到靶序列的限制. 原文链接:http://www.ebiotrade.com/newsf/2016-9/2016918155816993.htm 生物通报道:内…