RNAseq分析软件STAR的安装

wget https://github.com/alexdobin/STAR/releases/STAR-2.5.2a.tar.gz tar -xzf STAR-2.5.2a.tar.gz cd STAR-2.5.2amake STAR 由于没有设置环境变量,所以每次运行的时候要加上绝对路径/STAR/STAR-2.5.2a/bin/Linux_x86_64/STAR --·······…

1.进入phred官网,给作者写信,获得所需的软件,大约需要两三天的时间即可收到回信. 2.根据作者的指示下载,解压相应软件. 3.以笔者本人的安装为例unbuntu系统(phred自带的installtion太麻烦了) 4.新建文件夹: mkdir phred 5:将下载的压缩文件移到新建的文件夹中: mv phred-dist-071222.c-acd.tar.gz 6.解压文件 tar -zxvf phred-dist-071220.c-acd.tar.gz 7.编译一下: make 8:…

11、比对软件STAR（https://github.com/alexdobin/STAR）

转载:https://mp.weixin.qq.com/s?__biz=MzI1MjU5MjMzNA==&mid=2247484731&idx=1&sn=b15fbee5910b36341bf366860ee5df53&scene=21#wechat_redirect 这次给大家带来的是ENCODE project的御用比对软件STAR,ENCODE项目是一个由美国国家人类基因组研究所(NHGRI)在2003年9月发起的一项公共联合研究项目,旨在找出人类基因组中所有功能组件…

kali下安装Nessus

Kali安装Nessus 说明 Nessus是一款基于插件的系统漏洞扫描和分析软件一.安装 1.下载安装包 https://www.tenable.com/downloads/nessus 查看kali的版本并下载相应的版本 2.安装在root下创建一个Nessus文件夹,将安装包放进去运行命令安装 dpkg -i Nessus-10.3.0-debian9_amd64.deb 3.启动服务 4.访问网页完成配置查询ip 访问网址接受,选择managed scanner模式并继续选择…

使用BRAKER2进行基因组注释

来自:https://www.jianshu.com/p/e6a5e1f85dda 使用BRAKER2进行基因组注释 BRAKER2是一个基因组注释流程,能够组合GeneMark,AUGUSTUS和转录组数据. 在使用软件之前,有几点需要注意下尽量提供高质量的基因组.目前随着三代测序价格下降,这一点问题不大. 基因组命名应该简单,最好就是">contig1"或">tig000001" 基因组需要屏蔽重复序列默认参数通常表现效果就很好,但是也要根据物种…

【效率工具】史上最好用的SSH一键登录脚本，超强更新！

说明虽然已经是凌晨,但丝毫不能掩盖我激动的心情,今天完成了对GotoSSH的一次大更新,新增了两个肥肠实用的功能,我只能说,是真的好用,话不多说,先来看效果图: 普通的一键登录: 一键登录跳板机,然后跳转登录线上服务器: 一键登录跳板机查看指定日志: 一键登录跳板机后跳转线上服务器查看指定日志: 然后是更加劲爆内容,一键从跳板机复制指定文件到本地: 一键从生产环境复制指定文件到本地: 我只能说,是真的强. Shell脚本 Shell脚本已经发布到了github上,链接在此:https://gi…

vue点击返回顶部插件vue-totop

vue-totop vue 点击返回顶部插件,可以根据参数设定按钮大小,颜色,类型,返回顶部的时间等.github地址:https://github.com/1006008051/vue-totop,欢迎star. 安装npm install vue-totop -S 使用注入 // ES6import vueToTop from 'vue-totop'//or requirevar vueToTop = require('vue-totop') Vue.use(vueToTop) 组件使用 <…