SNP命名 [2016-11-24]       奶茶妹妹是谁,京东老板娘,咦?章泽天!没错! 国民老公是谁?万达少东家,王健林儿子,王思聪!恭喜你又答对了! 函数是谁?这不是数学上的名词吗?不对,是杨幂…… 人类这是有多么爱给人取外号,就连SNP的命名,也是各种各样,奇怪到令人发指(⊙o⊙) 关于SNP位点的命名其实是很乱的,不同的组织机构命名不统一,大家在文献中也是根据自己的习惯命名.具体表现有以下几种形式: 1. RS命名 RS 命名是目前最常用的SNP 命名法,NCBI 会对作者提交的S…

Swift 的 extension 机制很强大,不仅可以针对自定义的类型,还能作用于系统库的类型,甚至基础类型比如 Int.当在对系统库做 extension 的时候,就会涉及到一个命名冲突的问题.Objective-C 时代的通行解决办法是在扩展方法名字的最前面加上 XXX_ 形式的前缀.这种形式不但解决了命名冲突的问题,而且增强了代码可读性.一旦阅读到这种风格的方法名,就知道是非系统的实现.Swift 社区最初的一段时间内,也是按照这种命名方式来做的. Swifty 在前缀形式的扩展使用了一…

GATK4.0 和之前的版本相比还是有较大的不同,更加趋于流程化. 软件安装 1 wget https://github.com/broadinstitute/gatk/releases/download/4.1.5.0/gatk-4.1.5.0.zip 2 unzip gatk-4.1.5.0.zip GATK 简单说明 1 ## 帮助信息 2 gat --help 3 4 ## 列出所有的工具 5 gatk --list 6 7 ## 工具的说明,比如以VariantAnnotator 为例…

之间介绍过annovar进行对snp注释,今天介绍snpEFF SnpEff is a variant annotation and effect prediction tool. It annotates and predicts the effects of variants on genes 详细的说明请阅读: http://snpeff.sourceforge.net/SnpEff_manual.html 一.安装 1 wget http://sourceforge.net/projec…

问题: Springboot启动报错: Caused by: org.springframework.beans.factory.BeanCreationException: Error creating bean with name 'entityManagerFactory' defined in class path resource [org/springframework/boot/autoconfigure/orm/jpa/HibernateJpaAutoConfiguration.…

本篇主要介绍var关键字.变量的undefined和null状态.异常处理.命名规范. 目录 1. var 关键字:介绍var关键字的使用. 2. 变量的状态:介绍变量的未定义.已定义未赋值.已定义已赋值 三种状态. 3. JS异常:介绍对JS异常的处理. 4. 命名规范:介绍Js的基本命名规范. 1. var 关键字 1.1 作用 声明作用:如声明个变量. 1.2 语法 var c = 1; 1.3 省略var 在javascript中,若省略var关键字而直接赋值,那么这个变量为全局变量,哪…

今天在使用VSCode编写golang代码时,定义一个struct,扩展几个方法,如下: package storage import ( "fmt" "github.com/zsy619/gcommon" ) //ChunkFooter 块Footer type ChunkFooter struct { ChunkDataTotalSize int } //NewChunkFooter 创建一个ChunkFooter func NewChunkFooter(chu…

所谓的命名sql其实也就是数据库里的sql语句,普元EOS里做了一定的封装,以方便在程序中的使用. 命名SQL的基本元素包括: 1. <parameterMap> parameterMap负责将对象属性映射成statement的参数. 2. <resultMap> resultMap负责将结果集的列值映射成对象的属性值 3. <statement>(Mapped Statement)元素是个通用声明,可以用于任何类型的sql语句, 但具体的statement类型(即&l…

人们问我最多的问题之一是在CSS类名中“--”和“__”是什么意思?它们的出现是源于BEM和Nicolas Gallagher... BEM的意思就是块(block).元素(element).修饰符(modifier),是由Yandex团队提出的一种前端命名方法论.这种巧妙的命名方法让你的CSS类对其他开发者来说更加透明而且更有意义.BEM命名约定更加严格,而且包含更多的信息,它们用于一个团队开发一个耗时的大项目. 重要的是要注意,我使用的基于BEM的命名方式是经过Nicolas Gallagh…

背景: 工作中有两个异地机房需要传数据,数据全名很规范,在某个目录下命名为统一的前缀加上编号.如/path/from/file.{1..100}.而机房间的专线对单个scp进程的传输速度是有限制的,比如最大在100Mb/s,如果直接启动100个scp,则又会遇到ssh的并发连接数限制. 所以需要控制并发数,即不超过ssh的并发限制,又要让单网卡上的带宽接近饱和,尽快完成传输(假设专线带宽远大于单机网卡带宽) 实现 之前知道通过mkfifo创建一个命名管道,可以实现对并发的控制.现在来实现一个.…