R包安装的正确方式

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R包安装的正确方式

options("repos" = c(CRAN="https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/CRAN/")) if(! require("devtools")) install.packages("devtools") if(! require("reshape2")) install.packages("reshape2") if(! require(…

前言 R对windows使用很友好,对Linux来说充满了敌意.小数据可以在windows下交互操作,效果很好很棒.可是当我们要处理大数据,或者要在集群上搭建pipeline时,不得不面对在Linux上装R及想要的R包这个难题,尤其是对非root用户而言更是艰难重重. 准备依赖库依次安装:zlib/bzip/liblzma/pcre/curl,注意顺序和版本.目前3.4以上3.6以下R版本相对较为稳定和不过时,我自己安装的是3.5.2. cd zlib-1.2.11 ./configure -…

如何将R包安装到自定义路径

参考设置环境变量R_LIBS将R包安装到自定义路径实际上是可以解决问题的, #环境变量完成以后,启动(重启)R,运行 .libPaths() 加载R包时,发现路径仍然未变成自定义的. 那么参考 quantreg软件包加载失败.是要改路径么?新手求帮忙开启R的时候用管理者身份打开[鼠标右键RStudio→以管理者身份运行],再运行,就会发现路径自定义成功. .libPaths()…

R 包安装、载入和卸载

生物上的一些包可以这样安装 source("https://bioconductor.org/biocLite.R") biocLite("affy") 一般的包: install.package("包名") 使用library()可以查看已经安装的包的列表,会打开一个新窗口显示信息. 使用installed.packages()可以看到各个包安装的路径,版本号等信息. 也可以使用 .packages(all.available=T) 就在控制台…

R 包安装卸载查看版本

R 查看包的版本 version> packageVersion("snow") 卸载包remove.packages 从源码安装包install.packages(path_to_file, repos = NULL, type="source")http://stackoverflow.com/questions/1474081/how-do-i-install-an-r-package-from-source 生成随机数正太分布For uniforml…

R包安装失败failed to download mirrors file

在R console中使用install.packages()来安装第三方包时,会出现这样的错误: 即使我们选择的是China的镜像也解决不了问题. 这时候,可以先试试用IE打开上图中黑底部分的URL.因为据说R是使用IE来打开页面进行下载的,所以如果自己电脑上的IE打不开相应的链接,那么在R里面也是无法完成下载的. 如果用IE打不开,网友们的说法是修复IE.我的做法是直接翻了墙.然后用IE就能正常打开页面了,然后也能在R里面进行各种包的安装了. 在安装的过程中,有时会出现无法把下载好的包移动到…