本文首发于微信公众号“生信补给站”,https://mp.weixin.qq.com/s/A5nqo6qnlt_5kF3_GIrjIA 学习了ggplot2|详解八大基本绘图要素后,就可以根据自己的需要绘制图形.前面也给出了一些ggplot2绘制生信分析基本图形的例子 pheatmap|暴雨暂歇,“热图”来袭!!! ggplot2-plotly|让你的火山图“活”过来 ggplot2|扩展包从0开始绘制雷达图 ggplot2| 绘制KEGG气泡图 ggplot2|绘制GO富集柱形图 ggplot…

本文首发于“生信补给站”公众号,https://mp.weixin.qq.com/s/hMjPj18R1cKBt78w8UfhIw 学习了ggplot2的基本绘图元素ggplot2|详解八大基本绘图要素,可以初步绘制出需要展示的图形,legend可以对图例进行细节的修改ggplot2 |legend参数设置,图形精雕细琢,那theme有什么用呢? theme是解决图是否美观的一个工具,其与scale最大的区别在于不受数据左右.先把scale做好,就是一张合格的图:再处理theme,则是一张出色的…

转载:https://www.jianshu.com/p/d46cf6934a2f R语言基本绘图函数中可以利用par()以及layout()来进行图形排列,但是这两个函数对于ggplot图则不太适用,本文主要讲解如何对多ggplot图形多页面进行排列.主要讲解如何利用包gridExtra.cowplot以及ggpubr中的函数进行图形排列. 绘制图形 #load packages library(gridExtra) library(cowplot) library(ggpubr) #data…

ggplot2 scale相关设置-坐标转换 在R中坐标轴转换有多种形式,包括对数转换,平方根转换以及坐标刻度前后进行调换 用到的函数分别有: scale_x_log10(...) scale_y_log10(...) scale_x_sqrt(...) scale_y_sqrt(...) scale_x_reverse(...) scale_y_reverse(...)   以上几个函数其实基于 scale_x_continuous(name = waiver(), breaks = waiv…

 ggplot2   scale相关设置 标度设置:主要用于在ggplot画图后的各个图层进行调整设置. 1.相关属性scale设置 包括scale_size().scale_alpha().scale_shape() 由上面的名称可以看出,这三个设置主要对ggplot的图层属性进行相关设置,包括尺寸.透明度和形状. 以下列出该设置的主要参数: scale_xxx(name = waiver(), breaks = waiver(), labels = waiver(), limits = NU…

在JVM中如果98%的时间是用于GC(Garbage Collection)且可用的 Heap size 不足2%的时候将抛出异常信息,java.lang.OutOfMemoryError: Java heap space.  所以产生这个异样的原因通常有两种: 1.程序中出现了死循环 2.程序占用内存太多,超过了JVM堆设置的最大值. 对于第一种情况,需要自己查看程序代码,这里不再多说. 第二种情况,我们手工扩大JVM堆的参数设置.JVM堆的设置是指java程序运行过程中JVM可以调配使用的内…

第1章 简介 1.3图形的语法 第2章从qplot开始入门 1.基本用法:qplot(x,y,data) x是自变量横轴,y是因变量纵轴,data是数据框   2.图形参数 colour=I("red"),shape,size=I(2),alpha=I(1/20) colour是(外框)颜色,fill是填充颜色,shape是点的形状,适合描述分类变量:形状和颜色 size是点的大小,适合描述连续变量:大小和颜色 alpha是点的透明度,1/20说明20个重叠在一起就会变得不透明,可以用…

1.Java虚拟机运行时的数据区 2.常用的内存区域调节参数 -Xms:初始堆大小,默认为物理内存的1/64(<1GB):默认(MinHeapFreeRatio参数可以调整)空余堆内存小于40%时,JVM就会增大堆直到-Xmx的最大限制,此值可以设置与-Xmx相同,以避免每次垃圾回收完成后JVM重新分配内存 -Xmx:最大堆大小,默认是老年代的内存空间大小,如果(MaxHeapFreeRatio参数可以调整)空余堆内存大于70%时,JVM会减少堆直到 -Xms的最小限制,不包括PermSize(…

首先:在pycharm 中要使图显示出来,最后一定要加上 plt.show(),如: plt.bar(x, y) plt.show() 下面就是我使用 matplotlib  遇到的一些常用参数设置:import matplotlib.pyplot as plt . . .x = df["name"]y = df["value"]plt.bar(x, y,label="label",color='r') # 自定义X轴的长度,根据x的长度进行限制…

来源:https://ww2.mathworks.cn/help/matlab/ref/set.html?searchHighlight=set&s_tid=doc_srchtitle set 设置图形对象属性 语法 set(H,Name,Value)set(H,NameArray,ValueArray)set(H,S) s = set(H) values = set(H,Name)   说明 注意 不要对 Java 对象使用 set 函数,因为这会导致内存泄漏.有关详细信息,请参阅Access…