在linux中用同一个版本的R 同时安装 Seurat 2 和 Seurat 3 Seurat  作为单细胞分析中的重量级R包,有多好用用,用过的人都知道.Seurat 分析流程基本涵盖了单细胞分析中的所有常见分析方法,包括filtering,tSNE,UMAP降维及画图等.还有一个重量级功能就是矫正不同实验之间的批次效应.然而Seurat 2和Seurat 3的矫正方法完全不一样,得到的结果也不一致.Seurat 2是基于CCA (典型相关性)的,可以矫正肿瘤,外周血及癌旁组织间由于实验带来的…

摘自:http://blog.csdn.net/zjg555543/article/details/8278266 linux和unix,各个版本的操作系统都有自己的软件安装方式,最方便的莫过于在线安装软件,本文就是收集了各个版本在线安装的命令. 1.Solaris 10: pkgutil -i 2.FreeBSD: 进入/usr/ports/devel/*/  执行make,make install  就会自动下载安装依赖文件. *是对应的软件包. 3.Ubuntu: apt-get 4.re…

linux mint 18版本默认是没有安装ssh server的 需要手动安装 安装ssh server: 此命令需要联网,会自动下载安装 安装之后看是否开始了ssh, 看到ssh-agent 和sshd 说明ssh server 已经启动了 如果没看到ssh server 需要手动启动 需要/etc/init.d/ssh start,如果看到sshd那说明ssh-server已经启动了. sh-server配置文件位于/ etc/ssh/sshd_config,在这里可以定义SSH的服务端口…

linux中用shell获取昨天.明天或多天前的日期 时间 -- :: BlogJava-专家区 原文 http://www.blogjava.net/xzclog/archive/2015/12/08/428555.html 主题 Shell 原文地址:http://www.itwis.com/html/os/linux/20100202/7360.html linux中用shell获取昨天.明天或多天前的日期: 在Linux中对man date -d 参数说的比较模糊,以下举例进一步说明:…

linux中用shell获取昨天.明天或多天前的日期:在Linux中对man date -d 参数说的比较模糊,以下举例进一步说明:# -d, --date=STRING display time described by STRING, not `now’[root@Gman root]# date -d next-day +%Y%m%d #明天日期20091024[root@Gman root]# date -d last-day +%Y%m%d #昨天日期20091022[root@Gma…

前言 R对windows使用很友好,对Linux来说充满了敌意.小数据可以在windows下交互操作,效果很好很棒.可是当我们要处理大数据,或者要在集群上搭建pipeline时,不得不面对在Linux上装R及想要的R包这个难题,尤其是对非root用户而言更是艰难重重. 准备依赖库 依次安装:zlib/bzip/liblzma/pcre/curl,注意顺序和版本.目前3.4以上3.6以下R版本相对较为稳定和不过时,我自己安装的是3.5.2. cd zlib-1.2.11 ./configure -…

测试环境部署过程中经常会遇到同一个服务器上部署两个不同版本的mysql数据库,在部署过程中也会有各种各样的问题,现将部署多版本mysql的方法总结如下: 1.下载mysql版本 http://downloads.mysql.com/archives/community/ 选择Linux - Generic 以及对应的 mysql版本,我这次安装的是 mysql 5.6.26版本,服务器上已安装 mysql5.5.41 下载页面最下方  Linux - Generic (glibc 2.5) (x…

 linux查看内核版本.系统版本.系统位数(32or64) 2011-05-01 22:05:12 标签:linux 内核版本 休闲 系统版本 系统位数 1. 查看内核版本命令: 1) [root@q1test01 ~]# cat /proc/version   Linux version 2.6.9-22.ELsmp (bhcompile@crowe.devel.redhat.com) (gcc version 3.4.4 20050721 3.4.4-2)) #1 SMP Mon Sep…

说明: 操作系统:CentOS 6.5 64位 需求: 编译安装LAMP运行环境 各软件版本如下: MySQL:mysql-5.1.73 Apache:httpd-2.2.31 PHP:php-5.2.17 具体操作: 准备篇 一.配置防火墙,开启80端口.3306端口 vi /etc/sysconfig/iptables #编辑防火墙配置文件 # Firewall configuration written by system-config-firewall # Manual customiz…

1. 查看内核版本命令: 1) [root@www ~]# cat /proc/version    Linux version 2.6.9-22.ELsmp (bhcompile@crowe.devel.redhat.com) (gcc version 3.4.4 20050721 3.4.4-2)) #1 SMP Mon Sep 19 18:00:54 EDT 2005 2) [root@www ~]# uname -a    Linux www 2.6.9-22.ELsmp #1 SMP…