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GWAS: 曼哈顿图，QQ plot 图，膨胀系数（ manhattan、Genomic Inflation Factor）

画曼哈顿图和QQ plot 首推R包“qqman”,简约方便.下面具体介绍以下. 一.画曼哈顿图 install.packages("qqman") library(qqman) 1.准备包含SNP, CHR, BP, P的文件gwasResults(如果没有zscore可以不用管),如下所示: 2.上代码,如下所示: manhattan(gwasResults) 如果觉得不够美观,考虑添加一下参数: manhattan(gwasResults, main = "Manhat…

Q-Q图和P-P图

 一. QQ图      分位数图示法(Quantile Quantile Plot,简称 Q-Q 图)       统计学里Q-Q图(Q代表分位数)是一个概率图,用图形的方式比较两个概率分布,把他们的两个分位数放在一起比较.首先选好分位数间隔.图上的点(x,y)反映出其中一个第二个分布(y坐标)的分位数和与之对应的第一分布(x坐标)的相同分位数.因此,这条线是一条以分位数间隔为参数的曲线.如果两个分布相似,则该Q-Q图趋近于落在y=x线上.如果两分布线性相关,则点在Q-Q图上趋近于落在一条直线…

一个简单的QQ隐藏图生成算法 通过jQuery和C#分别实现对.NET Core Web Api的访问以及文件上传

一个简单的QQ隐藏图生成算法   隐藏图不是什么新鲜的东西,具体表现在大部分社交软件中,预览图看到的是一张图,而点开后看到的又是另一张图.虽然很早就看到过这类图片,但是一直没有仔细研究过它的原理,今天思考了一下,发现挺有趣的,所以自己也写了个简单的算法把两张图片合成为一张隐藏图. 比如下面这张图. 当背景颜色为白色时,通常也就是在预览状态下,它是这个样子的 而当背景颜色变黑以后,通常也就是点开图片以后,它是这样子的.. 隐藏图原理 我们知道一张图片中具有透明度的像素会叠加一部分的背景色,因此当背…

R & ggplot2 & Excel绘图（直方图/经验分布图/QQ图/茎叶图/箱线图）实例

持续更新~ 散点图 条形图 文氏图 饼图 盒型图 频率直方图 热图 PCA图 3D图 火山图 分面图 分面制作小多组图 地图 练习数据: year count china Ame jap '12 2.800000 1.500000 4.500000 2.500000 '13 2.941956 1.587559 5.342547 2.814862 '14 3.508838 1.648075 5.429438 2.701108 '15 4.011208 1.533966 5.419301 2.660…

一个简单的QQ隐藏图生成算法

隐藏图不是什么新鲜的东西,具体表现在大部分社交软件中,预览图看到的是一张图,而点开后看到的又是另一张图.虽然很早就看到过这类图片,但是一直没有仔细研究过它的原理,今天思考了一下,发现挺有趣的,所以自己也写了个简单的算法把两张图片合成为一张隐藏图. 比如下面这张图. 当背景颜色为白色时,通常也就是在预览状态下,它是这个样子的 而当背景颜色变黑以后,通常也就是点开图片以后,它是这样子的.. 隐藏图原理 我们知道一张图片中具有透明度的像素会叠加一部分的背景色,因此当背景色为白色时,所有具有透明度的白色…

Matlab 语谱图(时频图)绘制与分析

Matlab 语谱图(时频图)绘制与分析 语谱图:先将语音信号作傅里叶变换,然后以横轴为时间,纵轴为频率,用颜色表示幅值即可绘制出语谱图.在一幅图中表示信号的频率.幅度随时间的变化,故也称"时频图". %matlab 2016a %需要先安装语音处理工具箱(matlab_voicebox) [Y,FS,WMODE,FIDX]=readwav('sound0_10','s',-1,-1); %Y为读到的双声道数据 %FS为采样频率 %这里的输入参数sound0_10为双声道数字0到10的…

JFreeChart 图表生成实例(饼图、柱状图、折线图、时序图)

import java.awt.BasicStroke; import java.awt.Color; import java.io.FileOutputStream; import java.io.IOException; import java.text.DateFormat; import java.text.SimpleDateFormat; import javax.servlet.ServletException; import javax.servlet.ServletReques…

前端数据统计用做Bootstrap的一些柱状图、饼状图和折线图案例

Bootstrap,来自 Twitter,是目前最受欢迎的前端框架.Bootstrap 是基于 HTML.CSS.JAVASCRIPT 的,它简洁灵活,使得 Web 开发更加快捷. Bootstrap 使用了一些 HTML5 元素和 CSS 属性.为了让这些正常工作,您需要使用 HTML5 文档类型(Doctype). 因此,请在使用 Bootstrap 项目的开头包含下面的代码段. <!DOCTYPE html> <html> .... </html> Bootstr…

06. Matplotlib 2 |折线图| 柱状图| 堆叠图| 面积图| 填图| 饼图| 直方图| 散点图| 极坐标| 图箱型图

1.基本图表绘制 plt.plot() 图表类别:线形图.柱状图.密度图,以横纵坐标两个维度为主同时可延展出多种其他图表样式 plt.plot(kind='line', ax=None, figsize=None, use_index=True, title=None, grid=None, legend=False, style=None, logx=False, logy=False, loglog=False, xticks=None, yticks=None, xlim=None, yl…

GIS案例学习笔记-ArcGIS整图大图出图实例教程

GIS案例学习笔记-ArcGIS整图大图出图实例教程 联系方式:谢老师,135-4855-4328,xiexiaokui#qq.com 1. 通过出图比例尺(1:2000),地图范围测算图纸大小. 图纸大小=地图范围*比例尺=10米*8米 2. 设置页面布局 3. 设置参考比例尺 4.页面布局,调整地图布局   5. 导出地图. 6.由于地图太大,普通图片查看器,例如美图看看,可能不能正确.全部.放大显示.考虑在ps中打开,20个屏幕大小. 7. 出错原因和walkarounds: (1)默认需…